134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1944 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_1944  nitroreductase  100 
 
 
189 aa  381  1e-105  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0375  nitroreductase  62.7 
 
 
196 aa  236  2e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0028718  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0326  nitroreductase  57.98 
 
 
191 aa  227  8e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2217  nitroreductase  48.92 
 
 
192 aa  207  1e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0549  nitroreductase  53.76 
 
 
192 aa  205  3e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0676  nitroreductase  49.73 
 
 
192 aa  202  2e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0455  nitroreductase family protein  52.15 
 
 
197 aa  198  3e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1413  nitroreductase family protein  50.27 
 
 
192 aa  198  3.9999999999999996e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0578  nitroreductase  52.13 
 
 
193 aa  191  7e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.431005  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0441  nitroreductase  52.13 
 
 
217 aa  181  7e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.185575 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1518  nitroreductase  50 
 
 
197 aa  172  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.185232  hitchhiker  0.00282354 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0956  nitroreductase  47.92 
 
 
191 aa  166  2e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000316504  hitchhiker  0.000000304833 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1895  nitroreductase  40.64 
 
 
191 aa  132  3e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2259  nitroreductase  40 
 
 
192 aa  128  6e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.101796  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04910  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  33.87 
 
 
386 aa  106  2e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  31.33 
 
 
186 aa  66.6  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  27.74 
 
 
165 aa  66.6  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0081  nitroreductase  27.78 
 
 
181 aa  65.9  0.0000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0146906  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  31.85 
 
 
170 aa  65.9  0.0000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  27.86 
 
 
186 aa  65.1  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  33.12 
 
 
163 aa  63.9  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  29.17 
 
 
190 aa  62.8  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0664  nitroreductase  26.22 
 
 
180 aa  62.8  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.237638  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  31.25 
 
 
174 aa  62.4  0.000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  31.71 
 
 
188 aa  61.6  0.000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  29.27 
 
 
168 aa  61.6  0.000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  30.07 
 
 
183 aa  61.2  0.000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  29.63 
 
 
166 aa  58.2  0.00000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  29.63 
 
 
192 aa  58.2  0.00000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2684  nitroreductase  26.95 
 
 
178 aa  58.2  0.00000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  29.63 
 
 
166 aa  57.8  0.00000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0073  nitroreductase family protein  32.89 
 
 
178 aa  57.4  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13220  nitroreductase  30.3 
 
 
278 aa  57.8  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  25.62 
 
 
176 aa  57  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  28.75 
 
 
178 aa  56.2  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  29.94 
 
 
167 aa  57  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2267  nitroreductase family protein, putative  27.16 
 
 
203 aa  54.3  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  28.82 
 
 
187 aa  53.9  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3146  nitroreductase  27.63 
 
 
200 aa  53.9  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  26.25 
 
 
176 aa  53.9  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0509  nitroreductase  30.13 
 
 
181 aa  53.5  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1513  nitroreductase  25.62 
 
 
180 aa  53.5  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000744029 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0212  nitroreductase  29.17 
 
 
184 aa  52.8  0.000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.362808  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0545  nitroreductase  29.94 
 
 
172 aa  53.1  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.361368  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  26.28 
 
 
194 aa  52.8  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3075  nitroreductase family protein  23.89 
 
 
212 aa  52.4  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.1167  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  25.97 
 
 
166 aa  52.4  0.000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3070  nitroreductase family protein  23.89 
 
 
212 aa  52  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.511917  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  24.53 
 
 
178 aa  52  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  25.64 
 
 
194 aa  51.2  0.000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3031  NAD  23.33 
 
 
212 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  26.99 
 
 
184 aa  50.4  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2798  NAD(P)H nitroreductase  23.33 
 
 
212 aa  50.1  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2761  NAD(P)H nitroreductase  23.33 
 
 
212 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3299  NADPH-flavin oxidoreductase  28.8 
 
 
169 aa  50.1  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.47744  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3044  nitroreductase  23.33 
 
 
212 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1165  nitroreductase family protein  29.1 
 
 
181 aa  50.1  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000313764  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0997  nitroreductase family protein  29.1 
 
 
181 aa  50.1  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0119809  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2206  nitroreductase family protein  23.33 
 
 
212 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00142362  hitchhiker  5.10468e-16 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1328  nitroreductase  28.48 
 
 
170 aa  50.1  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000802581 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  28.3 
 
 
174 aa  49.7  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0218  nitroreductase  25.16 
 
 
180 aa  49.3  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  29.19 
 
 
176 aa  49.3  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1324  NAD(P)H nitroreductase, putative  21.24 
 
 
210 aa  48.9  0.00004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000367676  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0249  nitroreductase A  43.86 
 
 
240 aa  48.9  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.807471  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2738  nitroreductase  29.3 
 
 
170 aa  49.3  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1207  nitroreductase family protein  22.28 
 
 
195 aa  48.5  0.00005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1624  nitroreductase  27.54 
 
 
176 aa  48.5  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.101829  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24750  nitroreductase  26.88 
 
 
176 aa  48.5  0.00005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1872  nitroreductase  25.58 
 
 
232 aa  48.9  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1374  nitroreductase  24.86 
 
 
202 aa  48.5  0.00006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2827  nitroreductase  21.23 
 
 
212 aa  48.5  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.374853  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  23.35 
 
 
177 aa  48.1  0.00007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0547  nitroreductase  23.03 
 
 
185 aa  48.1  0.00008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000441926  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0271  nitroreductase  31.36 
 
 
171 aa  48.1  0.00008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000757805  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1625  nitroreductase  23.37 
 
 
176 aa  47.8  0.00009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0106837  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  27.56 
 
 
179 aa  47.8  0.0001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0221  nitroreductase  27.74 
 
 
180 aa  47.4  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.602782  normal  0.0189765 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1167  nitroreductase  30.3 
 
 
174 aa  47.4  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0202  nitroreductase  25.77 
 
 
243 aa  46.6  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.779167  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0371  nitroreductase  24.07 
 
 
261 aa  46.6  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1518  nitroreductase  19.3 
 
 
170 aa  47  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1563  nitroreductase  25.93 
 
 
173 aa  46.6  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  26.38 
 
 
186 aa  47  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  25.95 
 
 
163 aa  46.6  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1652  nitroreductase  25.49 
 
 
171 aa  46.2  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.177323  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0536  nitroreductase  25.75 
 
 
172 aa  46.2  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.870767  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1474  nitroreductase  28.57 
 
 
334 aa  45.8  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0168  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  28.65 
 
 
236 aa  46.2  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.119752  normal  0.808425 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1363  nitroreductase family protein  26.25 
 
 
169 aa  45.4  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  26.55 
 
 
190 aa  45.8  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1639  nitroreductase  26.71 
 
 
184 aa  45.4  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1006  nitroreductase  26.74 
 
 
202 aa  45.4  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269661  normal  0.607301 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3233  nitroreductase  22.02 
 
 
215 aa  45.4  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1720  nitroreductase  28.81 
 
 
196 aa  45.1  0.0007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0905  nitroreductase  18.42 
 
 
212 aa  44.7  0.0009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000395807  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0660  nitroreductase family protein  27.61 
 
 
184 aa  44.3  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.799475 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1829  nitroreductase  27.44 
 
 
200 aa  43.9  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00202262  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2164  nitroreductase  25.29 
 
 
190 aa  43.9  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0537  nitroreductase  27.66 
 
 
321 aa  43.9  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>