103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_2259 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_2259  nitroreductase  100 
 
 
192 aa  392  1e-108  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.101796  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1518  nitroreductase  45.83 
 
 
197 aa  182  3e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.185232  hitchhiker  0.00282354 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0441  nitroreductase  42.93 
 
 
217 aa  151  5.9999999999999996e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.185575 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0326  nitroreductase  36.7 
 
 
191 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0549  nitroreductase  38.1 
 
 
192 aa  137  8.999999999999999e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0578  nitroreductase  37.43 
 
 
193 aa  136  2e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.431005  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0956  nitroreductase  39.79 
 
 
191 aa  136  2e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000316504  hitchhiker  0.000000304833 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0676  nitroreductase  36.84 
 
 
192 aa  134  6.0000000000000005e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2217  nitroreductase  38.02 
 
 
192 aa  134  9.999999999999999e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0455  nitroreductase family protein  40.21 
 
 
197 aa  132  3e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0375  nitroreductase  38.5 
 
 
196 aa  129  3e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0028718  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1944  nitroreductase  40 
 
 
189 aa  128  6e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1413  nitroreductase family protein  33.33 
 
 
192 aa  116  3e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1895  nitroreductase  36.51 
 
 
191 aa  115  3e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04910  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  32.45 
 
 
386 aa  102  3e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  29.38 
 
 
183 aa  62.4  0.000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  29.56 
 
 
170 aa  60.5  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  29.7 
 
 
178 aa  60.8  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  32.73 
 
 
186 aa  60.1  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0212  nitroreductase  27.81 
 
 
184 aa  58.9  0.00000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.362808  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  26.75 
 
 
165 aa  58.5  0.00000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  27.33 
 
 
168 aa  57  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0509  nitroreductase  29.19 
 
 
181 aa  55.5  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  28.39 
 
 
174 aa  55.5  0.0000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  28.31 
 
 
166 aa  55.1  0.0000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18320  nitroreductase  26.04 
 
 
174 aa  53.9  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1518  nitroreductase  23.21 
 
 
170 aa  52.8  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0536  nitroreductase  26.63 
 
 
172 aa  52.4  0.000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.870767  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1136  nitroreductase  25.57 
 
 
200 aa  52  0.000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.710664  normal  0.0578189 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  27.61 
 
 
192 aa  52  0.000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1183  nitroreductase  28.48 
 
 
175 aa  52  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000761176  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  26.9 
 
 
186 aa  51.6  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  27.39 
 
 
176 aa  51.6  0.000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1660  nitroreductase  27.33 
 
 
175 aa  50.4  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.283139  normal  0.036754 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  26.67 
 
 
188 aa  50.4  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  28.4 
 
 
179 aa  49.7  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_002950  PG0660  nitroreductase family protein  28.22 
 
 
184 aa  50.1  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.799475 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0406  nitroreductase  32.41 
 
 
201 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.699033  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0432  nitroreductase  30.34 
 
 
201 aa  50.1  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.181342  normal  0.330733 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  26.37 
 
 
194 aa  50.4  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  27.47 
 
 
194 aa  49.7  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1374  nitroreductase  27.53 
 
 
202 aa  49.7  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  25.82 
 
 
178 aa  48.9  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2805  nitroreductase family protein  27.08 
 
 
201 aa  48.5  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.360066  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3612  nitroreductase family protein  27.08 
 
 
201 aa  48.5  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0028  nitroreductase family protein  27.08 
 
 
201 aa  48.5  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.901836  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1738  nitroreductase family protein  27.08 
 
 
201 aa  48.9  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3601  nitroreductase family protein  27.08 
 
 
201 aa  48.5  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.735488  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3625  nitroreductase family protein  27.08 
 
 
201 aa  48.5  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.159047  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3172  nitroreductase family protein  27.08 
 
 
201 aa  48.9  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  24.84 
 
 
186 aa  48.9  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2938  nitroreductase family protein  27.08 
 
 
201 aa  48.1  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0153  nitroreductase  23.97 
 
 
174 aa  48.1  0.00008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027489  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2684  nitroreductase  30.08 
 
 
178 aa  47.8  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1657  nitroreductase  35.48 
 
 
215 aa  47.8  0.00009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0325303  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2896  nitroreductase  30.34 
 
 
207 aa  47.8  0.00009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.318005  normal  0.764115 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2891  nitroreductase  27.16 
 
 
340 aa  47.4  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36390  nitroreductase  26.47 
 
 
199 aa  47.4  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0221  nitroreductase  26.9 
 
 
180 aa  46.6  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.602782  normal  0.0189765 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2604  nitroreductase  29.86 
 
 
201 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.759207  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1165  nitroreductase family protein  25.75 
 
 
181 aa  47  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000313764  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0997  nitroreductase family protein  25.75 
 
 
181 aa  47  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0119809  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0501  nitroreductase  29.86 
 
 
201 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2080  nitroreductase  31.75 
 
 
215 aa  46.6  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.123305  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2101  nitroreductase family protein  31.75 
 
 
215 aa  45.8  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.320716  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2040  nitroreductase family protein  31.75 
 
 
215 aa  45.8  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0134367  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  26.67 
 
 
163 aa  46.2  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2257  nitroreductase family protein  31.75 
 
 
215 aa  45.8  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.328438  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2367  nitroreductase family protein  31.75 
 
 
215 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.130661  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2282  nitroreductase family protein  31.75 
 
 
215 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.1661e-35 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  25.88 
 
 
190 aa  45.8  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0225  nitroreductase  27.59 
 
 
200 aa  45.8  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.936652  normal  0.851937 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0474  nitroreductase  29.17 
 
 
201 aa  45.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.573695 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  24.54 
 
 
176 aa  45.8  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2239  nitroreductase family protein  31.75 
 
 
215 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.153685  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  24.22 
 
 
184 aa  45.4  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1472  nitroreductase  24.22 
 
 
172 aa  45.1  0.0007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1513  nitroreductase  26.71 
 
 
180 aa  44.7  0.0009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000744029 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1363  nitroreductase family protein  23.38 
 
 
169 aa  44.3  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2286  nitroreductase family protein  31.75 
 
 
215 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.153669  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2038  nitroreductase family protein  31.75 
 
 
215 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119654  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3589  nitroreductase  29.37 
 
 
201 aa  44.7  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0073  nitroreductase family protein  28 
 
 
178 aa  43.9  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1006  nitroreductase  27.07 
 
 
202 aa  44.3  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269661  normal  0.607301 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0857  nitroreductase  28.57 
 
 
175 aa  43.9  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.3237  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4328  nitroreductase  27.41 
 
 
199 aa  44.3  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.59961  normal  0.455501 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0804  nitroreductase  22.7 
 
 
184 aa  43.5  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0827  nitroreductase  22.7 
 
 
184 aa  43.5  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  24.49 
 
 
177 aa  42.7  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3085  nitroreductase family protein  30.65 
 
 
215 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000156331 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1220  nitroreductase family protein  22.7 
 
 
200 aa  42.4  0.004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.168432  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2105  nitroreductase  25.88 
 
 
176 aa  42.4  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.892838  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1122  nitroreductase  20.74 
 
 
200 aa  42.4  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  24.68 
 
 
163 aa  42.4  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0081  nitroreductase  27.82 
 
 
181 aa  42.4  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0146906  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0116  nitroreductase  28.17 
 
 
171 aa  42.4  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0579  nitroreductase  21.74 
 
 
173 aa  42  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0264  nitroreductase  27.4 
 
 
187 aa  42  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.284109  hitchhiker  0.00114487 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2738  nitroreductase  26.11 
 
 
170 aa  42.4  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1624  nitroreductase  25 
 
 
176 aa  42  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.101829  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>