262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0805 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_0805  nitroreductase  100 
 
 
218 aa  447  1e-125  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2480  putative ribonuclease BN  47.29 
 
 
546 aa  166  4e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.422158  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0797  nitroreductase  40.09 
 
 
230 aa  157  1e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2581  nitroreductase  36.99 
 
 
236 aa  112  5e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00210488  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4320  nitroreductase  34.53 
 
 
224 aa  108  6e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4554  nitroreductase  35.19 
 
 
219 aa  101  9e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.644271  normal  0.2444 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2149  nitroreductase  34.1 
 
 
225 aa  100  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00130487  normal  0.0184861 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3115  nitroreductase  30.77 
 
 
239 aa  95.1  8e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.029346  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3382  nitroreductase  28.96 
 
 
234 aa  88.6  7e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.385821 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3917  nitroreductase  31.44 
 
 
221 aa  87  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0265412  normal  0.0438071 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6394  nitroreductase  33.67 
 
 
280 aa  85.5  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.130468 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29770  nitroreductase  27.12 
 
 
241 aa  81.3  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1524  nitroreductase  31.12 
 
 
223 aa  75.1  0.0000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0196672  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1532  nitroreductase  30.41 
 
 
213 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.24948  normal  0.391496 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2909  nitroreductase  29 
 
 
206 aa  71.2  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3978  nitroreductase  30.73 
 
 
209 aa  69.3  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0811138 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  26.79 
 
 
186 aa  68.6  0.00000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5547  nitroreductase  33.67 
 
 
241 aa  68.2  0.00000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1184  nitroreductase  28.89 
 
 
213 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1201  nitroreductase  28.89 
 
 
213 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.223399  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1211  nitroreductase  30.43 
 
 
213 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.120576 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3640  nitroreductase  32.06 
 
 
228 aa  67  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.913499 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13404  oxidoreductase  28.7 
 
 
214 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.15844e-25  normal  0.575826 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4892  nitroreductase  31.31 
 
 
213 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.967064  normal  0.0361814 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0106  nitroreductase  25.13 
 
 
223 aa  64.3  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0309697  normal  0.07675 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05880  nitroreductase  28.18 
 
 
166 aa  64.7  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  25.94 
 
 
186 aa  63.9  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  27.88 
 
 
184 aa  63.5  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1352  nitroreductase  26.74 
 
 
206 aa  62.4  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.160233  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4099  nitroreductase  30.65 
 
 
217 aa  61.2  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  27.17 
 
 
188 aa  60.5  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0271  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  32.88 
 
 
233 aa  60.1  0.00000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  27.89 
 
 
166 aa  59.7  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1652  nitroreductase  28.57 
 
 
171 aa  60.1  0.00000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.177323  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2465  nitroreductase  28.33 
 
 
202 aa  59.7  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  26.11 
 
 
167 aa  59.3  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2472  nitroreductase  28.87 
 
 
272 aa  58.5  0.00000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.151442  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0337  nitroreductase  29.06 
 
 
218 aa  58.2  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0019  nitroreductase  28.22 
 
 
196 aa  58.2  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  25 
 
 
170 aa  57.8  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  27.54 
 
 
190 aa  57.4  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4448  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  30.41 
 
 
209 aa  57  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.178194 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1137  nitroreductase  28.5 
 
 
209 aa  57  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.038928 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1262  nitroreductase  30.26 
 
 
225 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.88  normal  0.0140866 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  25.36 
 
 
186 aa  56.2  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  24.39 
 
 
170 aa  56.2  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0664  nitroreductase  23.96 
 
 
180 aa  55.8  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.237638  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1532  nitroreductase  26.24 
 
 
244 aa  55.5  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.509965  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  23.94 
 
 
174 aa  55.1  0.0000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0694  nitroreductase  23.56 
 
 
183 aa  55.1  0.0000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.402157  unclonable  1.19991e-19 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  29.1 
 
 
167 aa  54.3  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3287  nitroreductase  36.92 
 
 
273 aa  54.7  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.954102 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4933  nitroreductase  28.35 
 
 
226 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.850383  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5021  nitroreductase  28.35 
 
 
226 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.227652  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5314  nitroreductase  28.35 
 
 
226 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1682  nitroreductase family protein  25.79 
 
 
244 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  26.56 
 
 
169 aa  53.9  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0973  nitroreductase  27.88 
 
 
348 aa  53.9  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2164  nitroreductase  29.74 
 
 
190 aa  53.9  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0797  nitroreductase  27.44 
 
 
240 aa  53.9  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3660  nitroreductase family protein  25.79 
 
 
244 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.930381  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1790  nitroreductase family protein  25.34 
 
 
244 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2080  nitroreductase  24.89 
 
 
215 aa  52.4  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.123305  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1528  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  25.34 
 
 
244 aa  52.4  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.165515  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1647  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  25.34 
 
 
244 aa  52.4  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  25.54 
 
 
204 aa  52  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3085  nitroreductase family protein  25.57 
 
 
215 aa  52  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000156331 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  25.53 
 
 
165 aa  52  0.000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1713  nitroreductase family protein  25.34 
 
 
244 aa  52  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2239  nitroreductase family protein  24.43 
 
 
215 aa  52  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.153685  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  23.41 
 
 
166 aa  51.6  0.000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4527  Nitroreductase-like protein  27.14 
 
 
215 aa  51.6  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.435373  normal  0.468539 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4023  nitroreductase  27.75 
 
 
202 aa  51.6  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.479853  normal  0.746138 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5045  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  31.28 
 
 
584 aa  51.2  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.87863  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1500  oxygen-insensitive NADPH nitroreductase  25.34 
 
 
244 aa  50.8  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00104852  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1491  oxygen-insensitive NADPH nitroreductase  25.34 
 
 
244 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2038  nitroreductase family protein  25.57 
 
 
215 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119654  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1474  nitroreductase  40 
 
 
334 aa  50.8  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1167  nitroreductase  25.47 
 
 
174 aa  50.8  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  23.41 
 
 
166 aa  51.2  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1538  nitroreductase  24.46 
 
 
203 aa  50.8  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.422269 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  23.94 
 
 
177 aa  51.2  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0690  nitroreductase  42.86 
 
 
246 aa  51.2  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0134674  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1649  nitroreductase  35.71 
 
 
274 aa  51.6  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0777  nitroreductase  43.28 
 
 
275 aa  51.2  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0136069  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1263  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  28.36 
 
 
219 aa  50.4  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4232  nitroreductase  32.34 
 
 
214 aa  50.4  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502325  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1736  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  24.89 
 
 
244 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0685688  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2282  nitroreductase family protein  25.11 
 
 
215 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.1661e-35 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0144  nitroreductase  29.65 
 
 
184 aa  50.8  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2101  nitroreductase family protein  25.11 
 
 
215 aa  50.1  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.320716  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2040  nitroreductase family protein  25.11 
 
 
215 aa  50.1  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0134367  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2257  nitroreductase family protein  25.11 
 
 
215 aa  50.1  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.328438  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1159  nitroreductase  40.66 
 
 
199 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.250977  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0015  nitroreductase  32.98 
 
 
272 aa  50.4  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4962  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  29.38 
 
 
207 aa  50.8  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.445827  normal  0.0961797 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  25 
 
 
190 aa  50.1  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2367  nitroreductase family protein  23.98 
 
 
215 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.130661  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1568  nitroreductase  25 
 
 
191 aa  50.4  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0545  nitroreductase  25.65 
 
 
172 aa  50.1  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.361368  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>