176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4170 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_4170  Nitroreductase-like protein  100 
 
 
199 aa  408  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7111  nitroreductase  35.56 
 
 
204 aa  90.9  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.109168  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3234  nitroreductase  36.21 
 
 
199 aa  83.6  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.33338  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4388  nitroreductase  36.72 
 
 
211 aa  75.9  0.0000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.98243  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3014  nitroreductase  31.58 
 
 
212 aa  75.1  0.0000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.579195  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  26.01 
 
 
168 aa  72  0.000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  28.64 
 
 
170 aa  71.6  0.000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0515  nitroreductase  29.89 
 
 
200 aa  70.1  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.303234  decreased coverage  0.000536484 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0427  nitroreductase  28.73 
 
 
200 aa  67  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.693238  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0729  nitroreductase  26.67 
 
 
220 aa  64.3  0.000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.552696  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  28.99 
 
 
188 aa  62.8  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  28.21 
 
 
183 aa  63.2  0.000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2581  nitroreductase  28.23 
 
 
236 aa  62.4  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00210488  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  27.75 
 
 
186 aa  61.6  0.000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1547  nitroreductase  33.92 
 
 
192 aa  60.5  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.259202  normal  0.0817814 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  25.36 
 
 
186 aa  60.1  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  24.57 
 
 
163 aa  58.5  0.00000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  27.46 
 
 
174 aa  57.4  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  28.11 
 
 
176 aa  57.4  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2975  nitroreductase  31.43 
 
 
169 aa  57.4  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.522963 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4783  nitroreductase  27.23 
 
 
217 aa  56.6  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0866516 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0153  nitroreductase  25.43 
 
 
174 aa  56.6  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027489  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2104  nitroreductase  25.93 
 
 
223 aa  56.6  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.0062642  normal  0.304613 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1204  nitroreductase  25 
 
 
174 aa  55.8  0.0000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.460953  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0509  nitroreductase  33.01 
 
 
181 aa  55.8  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5045  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  31.89 
 
 
584 aa  55.5  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.87863  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  39.18 
 
 
192 aa  55.5  0.0000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2373  nitroreductase  25.65 
 
 
172 aa  55.5  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00327904  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1270  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  30.94 
 
 
216 aa  53.9  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2247  nitroreductase  26.85 
 
 
209 aa  54.3  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.200242  normal  0.163117 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  21.43 
 
 
176 aa  53.5  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2149  nitroreductase  26.73 
 
 
225 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00130487  normal  0.0184861 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4320  nitroreductase  26.26 
 
 
224 aa  53.1  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  23.63 
 
 
176 aa  52.4  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3956  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  30.29 
 
 
230 aa  52.4  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.733345  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  26.73 
 
 
190 aa  52  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  24.88 
 
 
186 aa  52  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2105  nitroreductase  23.66 
 
 
176 aa  52  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.892838  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3218  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  30.29 
 
 
230 aa  52  0.000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1846  nitroreductase  25.91 
 
 
172 aa  52  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000122819 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  24.02 
 
 
184 aa  52  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0690  nitroreductase  26.92 
 
 
246 aa  50.4  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0134674  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1517  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  29.28 
 
 
217 aa  50.1  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0235269  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0536  nitroreductase  23.91 
 
 
172 aa  50.4  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.870767  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4554  nitroreductase  25.24 
 
 
219 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.644271  normal  0.2444 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2000  nitroreductase  27.08 
 
 
213 aa  50.1  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.578725  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0371  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  25.67 
 
 
227 aa  49.3  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0271  nitroreductase  23.73 
 
 
171 aa  49.7  0.00003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000757805  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  25.44 
 
 
170 aa  49.7  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0381  nitroreductase  38.89 
 
 
246 aa  49.7  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.53738  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0073  nitroreductase family protein  27.18 
 
 
178 aa  49.7  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0809  nitroreductase  30.29 
 
 
169 aa  49.7  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.177891  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1158  nitroreductase  27.59 
 
 
169 aa  49.3  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000244648  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1106  nitro/flavin reductase  26.22 
 
 
248 aa  49.3  0.00004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000115125  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4002  hypothetical protein  25.39 
 
 
867 aa  48.9  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1437  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  24.62 
 
 
218 aa  48.9  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3598  hypothetical protein  29.81 
 
 
230 aa  48.9  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1625  nitroreductase  23.5 
 
 
176 aa  48.5  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0106837  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4962  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  44.07 
 
 
207 aa  48.5  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.445827  normal  0.0961797 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  24.44 
 
 
178 aa  48.1  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2969  nitroreductase  27.31 
 
 
235 aa  48.1  0.00009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.788882  normal  0.0360376 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1401  nitroreductase family protein  30.43 
 
 
368 aa  47.4  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000248129  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0649  nitroreductase  22.75 
 
 
173 aa  47.4  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.535499  normal  0.149872 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2604  nitroreductase  30.34 
 
 
201 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.759207  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1532  nitroreductase  23.71 
 
 
244 aa  47.4  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.509965  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0501  nitroreductase  30.34 
 
 
201 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1518  nitroreductase  21.78 
 
 
170 aa  47.4  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3602  nitroreductase  33.77 
 
 
246 aa  47.8  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.263517  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4448  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  43.1 
 
 
209 aa  47.4  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.178194 
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  22.45 
 
 
179 aa  46.6  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1141  nitroreductase family protein  28.57 
 
 
222 aa  47  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.492433  normal  0.120129 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1013  nitroreductase family protein  27.47 
 
 
214 aa  46.6  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0338  nitroreductase  37.5 
 
 
246 aa  47  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3737  NADH dehydrogenase  24.78 
 
 
221 aa  47  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  32.22 
 
 
177 aa  47  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1065  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  28.8 
 
 
214 aa  47.4  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.167871  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1141  nitroreductase  23.12 
 
 
171 aa  47  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.426198  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1513  nitroreductase  30.61 
 
 
180 aa  47  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000744029 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  27.78 
 
 
178 aa  46.6  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3589  nitroreductase  29.78 
 
 
201 aa  46.2  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2164  nitroreductase  24.06 
 
 
190 aa  46.6  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1213  nitroreductase  38.95 
 
 
221 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.718567 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  20.6 
 
 
165 aa  46.2  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1790  nitroreductase family protein  24.23 
 
 
244 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05880  nitroreductase  42.11 
 
 
166 aa  45.8  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0813  nitroreductase  30.3 
 
 
173 aa  45.8  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0141  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  26.09 
 
 
324 aa  45.4  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2878  Cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  43.86 
 
 
279 aa  45.4  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.348827  normal  0.405788 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2480  putative ribonuclease BN  25.96 
 
 
546 aa  45.4  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.422158  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1116  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  27.47 
 
 
214 aa  45.4  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0837  nitroreductase  26.67 
 
 
173 aa  45.4  0.0005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.638671  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2051  nitroreductase family protein  29.89 
 
 
219 aa  45.1  0.0006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000565957  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2222  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  43.33 
 
 
814 aa  45.4  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1682  nitroreductase family protein  23.2 
 
 
244 aa  45.4  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0862  nitroreductase family protein  29.89 
 
 
219 aa  45.1  0.0006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00254558  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  24.56 
 
 
166 aa  45.1  0.0006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6394  nitroreductase  29.25 
 
 
280 aa  45.4  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.130468 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3169  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  29.89 
 
 
219 aa  45.1  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00240689  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  25.7 
 
 
169 aa  45.4  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1226  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  25.65 
 
 
222 aa  45.1  0.0007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>