More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3234 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3234  nitroreductase  100 
 
 		 199 aa  389  1e-107  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.33338  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0515  nitroreductase  69 
 
 		 200 aa  258  4e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.303234  decreased coverage  0.000536484 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0427  nitroreductase  67 
 
 		 200 aa  250  9.000000000000001e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.693238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4388  nitroreductase  59.9 
 
 		 211 aa  209  2e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.98243  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7111  nitroreductase  51.49 
 
 		 204 aa  196  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.109168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3014  nitroreductase  57.48 
 
 		 212 aa  190  1e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.579195  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1547  nitroreductase  51.6 
 
 		 192 aa  150  8.999999999999999e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.259202  normal  0.0817814 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4170  Nitroreductase-like protein  36.21 
 
 		 199 aa  101  8e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  29.29 
 
 		 183 aa  90.1  2e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  32.16 
 
 		 178 aa  84.7  7e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  29.85 
 
 		 169 aa  79.7  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  28.5 
 
 		 176 aa  79  0.00000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  28.16 
 
 		 186 aa  78.6  0.00000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0599  nitroreductase  31.76 
 
 		 166 aa  78.2  0.00000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  30.85 
 
 		 186 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  30.73 
 
 		 174 aa  76.3  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  29.35 
 
 		 184 aa  74.3  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0729  nitroreductase  35.93 
 
 		 220 aa  73.6  0.000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.552696  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  28.14 
 
 		 170 aa  73.2  0.000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  28.86 
 
 		 186 aa  69.7  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0212  nitroreductase  32.57 
 
 		 184 aa  68.6  0.00000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.362808  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2105  nitroreductase  26.06 
 
 		 176 aa  68.2  0.00000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.892838  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  31.52 
 
 		 174 aa  66.6  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1328  nitroreductase  30.85 
 
 		 170 aa  66.2  0.0000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000802581 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  29.67 
 
 		 187 aa  65.5  0.0000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1141  nitroreductase  28.81 
 
 		 171 aa  65.1  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.426198  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  27.91 
 
 		 163 aa  64.7  0.0000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3299  NADPH-flavin oxidoreductase  30.56 
 
 		 169 aa  64.3  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.47744  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1720  nitroreductase  31.07 
 
 		 196 aa  63.9  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1294  nitroreductase  24.62 
 
 		 167 aa  62.8  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0670007  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  27.68 
 
 		 168 aa  63.2  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  29.78 
 
 		 166 aa  63.2  0.000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  21.61 
 
 		 176 aa  62.8  0.000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  28.36 
 
 		 188 aa  62.4  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  25 
 
 		 163 aa  62  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  26.92 
 
 		 190 aa  61.2  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  29.78 
 
 		 166 aa  60.8  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2373  nitroreductase  28.26 
 
 		 172 aa  59.7  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00327904  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1183  nitroreductase  24.61 
 
 		 175 aa  60.1  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000761176  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4962  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  28.96 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.445827  normal  0.0961797 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3037  nitroreductase  24.87 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.179867  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2975  nitroreductase  28.86 
 
 		 169 aa  59.7  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.522963 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4023  nitroreductase  31.38 
 
 		 202 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.479853  normal  0.746138 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0271  nitroreductase  28.57 
 
 		 171 aa  57.4  0.0000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000757805  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0603  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  28.96 
 
 		 210 aa  57  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  23.47 
 
 		 165 aa  56.6  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1974  nitroreductase  27.18 
 
 		 183 aa  56.2  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000485253  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2810  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  28.96 
 
 		 226 aa  55.5  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.407169 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  30.94 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1472  nitroreductase  24.76 
 
 		 172 aa  55.1  0.0000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0617  nitroreductase  24.63 
 
 		 169 aa  55.1  0.0000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.146729  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3002  nitroreductase  27.03 
 
 		 195 aa  55.1  0.0000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.454313  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05880  nitroreductase  29.89 
 
 		 166 aa  54.7  0.0000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2164  nitroreductase  26.88 
 
 		 190 aa  54.7  0.0000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5045  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  33.49 
 
 		 584 aa  54.3  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.87863  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0360  nitroreductase  26.74 
 
 		 200 aa  54.3  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  27.6 
 
 		 170 aa  54.3  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  30.99 
 
 		 176 aa  54.3  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0809  nitroreductase  29.85 
 
 		 169 aa  54.3  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.177891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4448  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  28.05 
 
 		 209 aa  54.3  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.178194 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3049  nitroreductase  28.34 
 
 		 170 aa  53.9  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3446  nitroreductase  29.85 
 
 		 184 aa  53.5  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3956  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  32.24 
 
 		 230 aa  53.9  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.733345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1997  nitroreductase  25.54 
 
 		 182 aa  53.5  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0291646  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1846  nitroreductase  28.11 
 
 		 172 aa  53.5  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000122819 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  27.5 
 
 		 178 aa  53.1  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0153  nitroreductase  26.84 
 
 		 174 aa  52.8  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027489  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3218  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  31.28 
 
 		 230 aa  52.8  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1141  nitroreductase family protein  29.72 
 
 		 222 aa  52.8  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.492433  normal  0.120129 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0079  nitroreductase  25.79 
 
 		 175 aa  53.1  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.423186  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1517  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  28.3 
 
 		 217 aa  52.8  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0235269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  24.86 
 
 		 190 aa  53.1  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0353  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  30.73 
 
 		 212 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.261778  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1353  nitroreductase family protein  32.95 
 
 		 169 aa  52.4  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000360113  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1513  nitroreductase  22.73 
 
 		 180 aa  52.8  0.000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000744029 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2938  nitroreductase family protein  28.72 
 
 		 201 aa  52.4  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3631  nitroreductase  52.94 
 
 		 225 aa  52.4  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1270  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  29.25 
 
 		 216 aa  52  0.000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_585  nitroreductase  22.89 
 
 		 169 aa  52  0.000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.179153  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3625  nitroreductase family protein  28.72 
 
 		 201 aa  52  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.159047  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2805  nitroreductase family protein  28.72 
 
 		 201 aa  52  0.000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.360066  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3612  nitroreductase family protein  28.72 
 
 		 201 aa  52  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1660  nitroreductase  26.26 
 
 		 175 aa  52  0.000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.283139  normal  0.036754 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0028  nitroreductase family protein  28.72 
 
 		 201 aa  52  0.000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.901836  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1437  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  26.07 
 
 		 218 aa  52  0.000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3601  nitroreductase family protein  28.72 
 
 		 201 aa  52  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.735488  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2684  nitroreductase  30.06 
 
 		 178 aa  52  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3172  nitroreductase family protein  28.72 
 
 		 201 aa  51.6  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4035  nitroreductase  26.14 
 
 		 273 aa  51.6  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.55178 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1013  nitroreductase family protein  27.83 
 
 		 214 aa  51.6  0.000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1523  NAD(P)H-flavin oxidoreductase, putative  27.57 
 
 		 191 aa  51.6  0.000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1738  nitroreductase family protein  28.72 
 
 		 201 aa  51.6  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0846  nitroreductase  23.81 
 
 		 169 aa  51.6  0.000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.245537  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0645  nitroreductase family protein  24.63 
 
 		 171 aa  51.6  0.000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0679  nitroreductase family protein  24.63 
 
 		 171 aa  51.6  0.000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2878  Cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  28.64 
 
 		 279 aa  51.6  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.348827  normal  0.405788 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0721  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  32.75 
 
 		 249 aa  51.2  0.000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0629951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3427  nitroreductase  26.18 
 
 		 213 aa  51.2  0.000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1116  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  27.88 
 
 		 214 aa  50.4  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0381  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  30.37 
 
 		 213 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.199086  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>