130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1547 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1547  nitroreductase  100 
 
 		 192 aa  366  1e-101  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.259202  normal  0.0817814 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3234  nitroreductase  51.09 
 
 		 199 aa  157  8e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.33338  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0427  nitroreductase  45.95 
 
 		 200 aa  145  4.0000000000000006e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.693238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0515  nitroreductase  46.67 
 
 		 200 aa  144  5e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.303234  decreased coverage  0.000536484 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4388  nitroreductase  42.63 
 
 		 211 aa  134  9e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.98243  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3014  nitroreductase  40.4 
 
 		 212 aa  122  3e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.579195  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7111  nitroreductase  42.11 
 
 		 204 aa  118  4.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.109168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0729  nitroreductase  39.33 
 
 		 220 aa  89  4e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.552696  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  30.81 
 
 		 176 aa  73.9  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4170  Nitroreductase-like protein  33.92 
 
 		 199 aa  70.5  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  36.26 
 
 		 174 aa  69.7  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  30.48 
 
 		 178 aa  68.2  0.00000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  29.09 
 
 		 183 aa  67.8  0.00000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  28.82 
 
 		 170 aa  63.5  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  25.26 
 
 		 176 aa  63.2  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  24.19 
 
 		 165 aa  61.6  0.000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3427  nitroreductase  26.11 
 
 		 213 aa  60.1  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  27.6 
 
 		 186 aa  60.1  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  27.96 
 
 		 178 aa  58.9  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  24.86 
 
 		 163 aa  58.2  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0599  nitroreductase  28.57 
 
 		 166 aa  57.8  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  32.3 
 
 		 192 aa  57.8  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  24.22 
 
 		 168 aa  57.8  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  28.57 
 
 		 179 aa  56.6  0.0000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  26.74 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  26.74 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  28.72 
 
 		 186 aa  56.2  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  30.17 
 
 		 166 aa  55.8  0.0000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  29.01 
 
 		 169 aa  54.7  0.0000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1513  nitroreductase  23.73 
 
 		 180 aa  54.7  0.0000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000744029 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24750  nitroreductase  29.65 
 
 		 176 aa  54.3  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0509  nitroreductase  26.32 
 
 		 181 aa  53.9  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0212  nitroreductase  30.51 
 
 		 184 aa  53.9  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.362808  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  30.17 
 
 		 166 aa  53.5  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0221  nitroreductase  26.32 
 
 		 180 aa  52.8  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.602782  normal  0.0189765 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  27.03 
 
 		 190 aa  52.4  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1294  nitroreductase  22.58 
 
 		 167 aa  52.4  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0670007  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2581  nitroreductase  27.59 
 
 		 236 aa  52  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00210488  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1720  nitroreductase  26.23 
 
 		 196 aa  50.8  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  27.75 
 
 		 184 aa  51.2  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1363  nitroreductase family protein  26.92 
 
 		 169 aa  49.7  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3037  nitroreductase  21.55 
 
 		 212 aa  49.7  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.179867  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  27.78 
 
 		 170 aa  49.7  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0664  nitroreductase  24.32 
 
 		 180 aa  49.3  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.237638  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4554  nitroreductase  27.23 
 
 		 219 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.644271  normal  0.2444 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2149  nitroreductase  25.74 
 
 		 225 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00130487  normal  0.0184861 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  25 
 
 		 187 aa  48.9  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0536  nitroreductase  23.49 
 
 		 172 aa  48.9  0.00005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.870767  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0116  nitroreductase  28.57 
 
 		 171 aa  48.9  0.00005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2938  nitroreductase family protein  30.27 
 
 		 201 aa  48.5  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1895  nitroreductase  22.8 
 
 		 191 aa  48.5  0.00006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0694  nitroreductase  26.92 
 
 		 183 aa  48.5  0.00006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.402157  unclonable  1.19991e-19 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1141  nitroreductase  27.78 
 
 		 171 aa  48.5  0.00007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.426198  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1649  nitroreductase  25.99 
 
 		 274 aa  48.1  0.00007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0427  oxidoreductase  30.26 
 
 		 205 aa  47.4  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2164  nitroreductase  24.86 
 
 		 190 aa  47.4  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4002  hypothetical protein  26.01 
 
 		 867 aa  47.8  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06664  nitroreductase A  25.44 
 
 		 257 aa  47.4  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1183  nitroreductase  21.76 
 
 		 175 aa  47.4  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000761176  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4320  nitroreductase  24.77 
 
 		 224 aa  47.8  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  29.03 
 
 		 188 aa  47  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2805  nitroreductase family protein  29.89 
 
 		 201 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.360066  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3612  nitroreductase family protein  29.89 
 
 		 201 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0079  nitroreductase  27.04 
 
 		 175 aa  46.6  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.423186  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  24.85 
 
 		 190 aa  46.6  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1518  nitroreductase  41.27 
 
 		 197 aa  46.6  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.185232  hitchhiker  0.00282354 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0028  nitroreductase family protein  29.89 
 
 		 201 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.901836  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1738  nitroreductase family protein  29.89 
 
 		 201 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3601  nitroreductase family protein  29.89 
 
 		 201 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.735488  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3625  nitroreductase family protein  29.89 
 
 		 201 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.159047  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3172  nitroreductase family protein  29.89 
 
 		 201 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2878  Cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  32.68 
 
 		 279 aa  46.2  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.348827  normal  0.405788 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1356  nitroreductase  27.32 
 
 		 194 aa  46.2  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  25.97 
 
 		 186 aa  46.2  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1472  nitroreductase  24.56 
 
 		 172 aa  46.2  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0690  nitroreductase  30.26 
 
 		 246 aa  45.8  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0134674  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1474  nitroreductase  26.21 
 
 		 334 aa  45.4  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  28.09 
 
 		 176 aa  45.1  0.0006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0218  nitroreductase  24.87 
 
 		 180 aa  45.1  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0645  nitroreductase family protein  27.01 
 
 		 171 aa  45.1  0.0007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0679  nitroreductase family protein  27.01 
 
 		 171 aa  45.1  0.0007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2465  nitroreductase  24.87 
 
 		 202 aa  45.1  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3299  NADPH-flavin oxidoreductase  25.41 
 
 		 169 aa  44.7  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.47744  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001121  NADPH-flavin oxidoreductase  26.09 
 
 		 240 aa  44.3  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000890353  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  29.27 
 
 		 174 aa  43.9  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  22.51 
 
 		 177 aa  43.9  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1903  nitroreductase  29.67 
 
 		 185 aa  44.3  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3531  nitroreductase  28.12 
 
 		 197 aa  44.3  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.12812  normal  0.174487 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0081  nitroreductase  25.43 
 
 		 181 aa  44.3  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0146906  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0371  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  25.37 
 
 		 227 aa  43.5  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_585  nitroreductase  25.42 
 
 		 169 aa  43.5  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.179153  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2388  nitroreductase  26.19 
 
 		 226 aa  43.5  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0406  nitroreductase  31.15 
 
 		 201 aa  43.9  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.699033  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3407  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  28.92 
 
 		 222 aa  43.1  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4023  nitroreductase  28.14 
 
 		 202 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.479853  normal  0.746138 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0153  nitroreductase  26.92 
 
 		 174 aa  43.9  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027489  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3382  nitroreductase  25.93 
 
 		 234 aa  43.9  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.385821 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2000  nitroreductase  30.41 
 
 		 213 aa  43.1  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.578725  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2730  nitroreductase  31.09 
 
 		 205 aa  43.5  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.796867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3400  hypothetical protein  27.84 
 
 		 199 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>