71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0729 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_0729  nitroreductase  100 
 
 
220 aa  418  1e-116  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.552696  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1547  nitroreductase  38.71 
 
 
192 aa  84.7  9e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.259202  normal  0.0817814 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4170  Nitroreductase-like protein  27.87 
 
 
199 aa  77.4  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3234  nitroreductase  35.93 
 
 
199 aa  73.2  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.33338  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7111  nitroreductase  30.48 
 
 
204 aa  70.9  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.109168  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0515  nitroreductase  35.94 
 
 
200 aa  70.5  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.303234  decreased coverage  0.000536484 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  27.37 
 
 
184 aa  69.7  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0427  nitroreductase  35.94 
 
 
200 aa  69.3  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.693238  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  26.18 
 
 
186 aa  68.9  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  27.86 
 
 
186 aa  67.4  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  26.37 
 
 
186 aa  67  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3014  nitroreductase  32.84 
 
 
212 aa  66.6  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.579195  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  27.72 
 
 
188 aa  66.2  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  25.42 
 
 
176 aa  62  0.000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4388  nitroreductase  30.39 
 
 
211 aa  59.7  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.98243  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  27.69 
 
 
174 aa  58.2  0.00000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1895  nitroreductase  24.86 
 
 
191 aa  57  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0153  nitroreductase  27.33 
 
 
174 aa  55.5  0.0000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027489  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  25.28 
 
 
166 aa  54.3  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001121  NADPH-flavin oxidoreductase  26.14 
 
 
240 aa  54.7  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000890353  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  24.72 
 
 
170 aa  53.5  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1513  nitroreductase  23.16 
 
 
180 aa  53.5  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000744029 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  25.28 
 
 
166 aa  52.8  0.000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0019  nitroreductase  29.19 
 
 
196 aa  52.4  0.000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1736  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  28.43 
 
 
236 aa  52  0.000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.321705 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3299  NADPH-flavin oxidoreductase  25.99 
 
 
169 aa  52  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.47744  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  26.19 
 
 
183 aa  51.6  0.000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0690  nitroreductase  22.99 
 
 
246 aa  51.6  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0134674  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0493  nitroreductase  25.91 
 
 
269 aa  50.4  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0787  nitroreductase family protein  30.65 
 
 
177 aa  50.1  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0290068  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0664  nitroreductase  21.69 
 
 
180 aa  50.1  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.237638  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  30.29 
 
 
167 aa  49.7  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  22.99 
 
 
176 aa  49.3  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  25.56 
 
 
165 aa  48.9  0.00006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3598  hypothetical protein  26.97 
 
 
230 aa  48.5  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  30.77 
 
 
167 aa  48.5  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  23.03 
 
 
178 aa  48.1  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3602  nitroreductase  25.68 
 
 
246 aa  47.8  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.263517  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  23.16 
 
 
168 aa  47.8  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0371  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  24.06 
 
 
227 aa  47.8  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3956  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  26.4 
 
 
230 aa  47  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.733345  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0545  nitroreductase  28.9 
 
 
172 aa  47  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.361368  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3218  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  26.4 
 
 
230 aa  47  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  28.16 
 
 
176 aa  47  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0813  nitroreductase  28.49 
 
 
173 aa  47  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0338  nitroreductase  25 
 
 
246 aa  46.2  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  27.84 
 
 
192 aa  46.2  0.0004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0381  nitroreductase  24.54 
 
 
246 aa  46.2  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.53738  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  24.44 
 
 
194 aa  45.8  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  25 
 
 
170 aa  45.4  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0353  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  27.62 
 
 
212 aa  45.8  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.261778  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0676  nitroreductase  25.58 
 
 
192 aa  45.1  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  22.03 
 
 
178 aa  45.1  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3407  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  27.42 
 
 
222 aa  44.7  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5732  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  24.31 
 
 
235 aa  44.3  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0679  nitroreductase family protein  28.3 
 
 
171 aa  44.3  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  23.33 
 
 
194 aa  43.5  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_002936  DET0645  nitroreductase family protein  28.3 
 
 
171 aa  44.3  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2042  nitroreductase  30.3 
 
 
228 aa  43.5  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.335823  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0660  nitroreductase  24.87 
 
 
189 aa  43.5  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  25 
 
 
163 aa  43.9  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1903  nitroreductase  28.71 
 
 
185 aa  43.5  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1116  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  34.55 
 
 
214 aa  43.9  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0617  nitroreductase  28.48 
 
 
169 aa  43.9  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.146729  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0709  nitroreductase  23.16 
 
 
215 aa  43.1  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0326  nitroreductase  24.71 
 
 
191 aa  43.1  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0549  nitroreductase  24.42 
 
 
192 aa  42.4  0.005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_585  nitroreductase  27.81 
 
 
169 aa  42.4  0.005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.179153  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2810  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  35.71 
 
 
226 aa  42  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.407169 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1862  nitroreductase  24.52 
 
 
197 aa  42  0.008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1683  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  30.85 
 
 
235 aa  41.6  0.009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000634411  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>