203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_3014 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_3014  nitroreductase  100 
 
 		 212 aa  418  1e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.579195  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4388  nitroreductase  57.67 
 
 		 211 aa  207  6e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.98243  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0515  nitroreductase  54.87 
 
 		 200 aa  202  4e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.303234  decreased coverage  0.000536484 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0427  nitroreductase  53.33 
 
 		 200 aa  198  5e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.693238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3234  nitroreductase  57.48 
 
 		 199 aa  194  1e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.33338  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7111  nitroreductase  45.79 
 
 		 204 aa  176  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.109168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1547  nitroreductase  41.87 
 
 		 192 aa  122  4e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.259202  normal  0.0817814 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4170  Nitroreductase-like protein  32.54 
 
 		 199 aa  95.1  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  25.93 
 
 		 184 aa  74.3  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  27.31 
 
 		 186 aa  71.6  0.000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  25.47 
 
 		 170 aa  71.2  0.00000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  24.54 
 
 		 186 aa  68.9  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  24.06 
 
 		 176 aa  67.4  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0729  nitroreductase  32.99 
 
 		 220 aa  67.4  0.0000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.552696  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  26.51 
 
 		 169 aa  65.5  0.0000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  24.07 
 
 		 186 aa  63.5  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0599  nitroreductase  24.73 
 
 		 166 aa  62.8  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1353  nitroreductase family protein  35.44 
 
 		 169 aa  62.4  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000360113  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  25 
 
 		 194 aa  62.8  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  25.47 
 
 		 178 aa  62  0.000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  24.53 
 
 		 194 aa  61.6  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1183  nitroreductase  23.33 
 
 		 175 aa  61.6  0.000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000761176  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  27.65 
 
 		 188 aa  61.2  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  24.53 
 
 		 178 aa  60.8  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1141  nitroreductase  23.4 
 
 		 171 aa  60.5  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.426198  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2975  nitroreductase  29.26 
 
 		 169 aa  59.7  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.522963 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  26.57 
 
 		 167 aa  58.9  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1294  nitroreductase  25.82 
 
 		 167 aa  58.9  0.00000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0670007  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1997  nitroreductase  25.6 
 
 		 182 aa  57.4  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0291646  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  25.37 
 
 		 174 aa  57  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1974  nitroreductase  23.7 
 
 		 183 aa  57.4  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000485253  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5547  nitroreductase  29.58 
 
 		 241 aa  57  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0617  nitroreductase  22.9 
 
 		 169 aa  57  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.146729  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  20.77 
 
 		 168 aa  56.6  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_585  nitroreductase  23.4 
 
 		 169 aa  56.2  0.0000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.179153  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  22.49 
 
 		 163 aa  56.2  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2373  nitroreductase  24.14 
 
 		 172 aa  56.2  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00327904  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0271  nitroreductase  27.98 
 
 		 171 aa  56.2  0.0000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000757805  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  24.76 
 
 		 190 aa  55.8  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0857  nitroreductase  25.82 
 
 		 175 aa  55.5  0.0000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.3237  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0430  nitroreductase  22.01 
 
 		 251 aa  55.5  0.0000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000330176  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0441  nitroreductase  22.01 
 
 		 251 aa  55.5  0.0000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000237608  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3299  NADPH-flavin oxidoreductase  23.36 
 
 		 169 aa  55.5  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.47744  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1846  nitroreductase  25.62 
 
 		 172 aa  55.1  0.0000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000122819 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  27.66 
 
 		 174 aa  54.7  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  23.91 
 
 		 163 aa  54.7  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0809  nitroreductase  30.85 
 
 		 169 aa  54.7  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.177891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5045  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  30.22 
 
 		 584 aa  54.7  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.87863  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3233  nitroreductase  23.45 
 
 		 215 aa  54.7  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  19.81 
 
 		 176 aa  54.7  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2105  nitroreductase  23.28 
 
 		 176 aa  54.7  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.892838  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0645  nitroreductase family protein  23.94 
 
 		 171 aa  53.9  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0679  nitroreductase family protein  23.94 
 
 		 171 aa  53.9  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1262  nitroreductase  29.58 
 
 		 225 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.88  normal  0.0140866 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1379  coenzyme F420-0 gamma-glutamyl ligase  29.63 
 
 		 439 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.539165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  24.74 
 
 		 187 aa  53.1  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0748  F420-dependent oxidoreductase  32.63 
 
 		 427 aa  53.1  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0318949  normal  0.411209 
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  24.06 
 
 		 183 aa  52.8  0.000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  22.47 
 
 		 204 aa  52.8  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3085  nitroreductase family protein  25.66 
 
 		 215 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000156331 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3226  nitroreductase  26.56 
 
 		 187 aa  52  0.000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.236693  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2518  F420-0--gamma-glutamyl ligase  29.95 
 
 		 423 aa  52  0.000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0675541  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2239  nitroreductase family protein  24.23 
 
 		 215 aa  51.6  0.000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.153685  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0660  nitroreductase family protein  23.04 
 
 		 184 aa  50.8  0.00001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.799475 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1513  nitroreductase  19.81 
 
 		 180 aa  51.2  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000744029 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4073  F420-dependent oxidoreductase  31.96 
 
 		 431 aa  50.8  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.578682  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3407  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  29.96 
 
 		 222 aa  51.2  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  24.17 
 
 		 166 aa  51.2  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1625  nitroreductase  23.04 
 
 		 176 aa  50.4  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0106837  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1720  nitroreductase  26.26 
 
 		 196 aa  50.4  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2367  nitroreductase family protein  23.79 
 
 		 215 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.130661  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0039  nitroreductase  24.39 
 
 		 245 aa  50.4  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.499814  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  23.63 
 
 		 170 aa  50.1  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  23.18 
 
 		 190 aa  50.1  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2855  nitroreductase  28.78 
 
 		 191 aa  49.7  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4933  nitroreductase  27.96 
 
 		 226 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.850383  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5021  nitroreductase  27.96 
 
 		 226 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.227652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  23.7 
 
 		 166 aa  49.7  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2102  nitroreductase  27.33 
 
 		 200 aa  49.7  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5314  nitroreductase  27.96 
 
 		 226 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4232  nitroreductase  28.78 
 
 		 214 aa  49.7  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1328  nitroreductase  25.93 
 
 		 170 aa  50.1  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000802581 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0229  nitroreductase  24.24 
 
 		 169 aa  49.3  0.00004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00298374  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2187  nitroreductase  28.02 
 
 		 173 aa  49.3  0.00005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.530109 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  25.7 
 
 		 176 aa  48.9  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3049  nitroreductase  23.38 
 
 		 170 aa  49.3  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2286  nitroreductase family protein  23.79 
 
 		 215 aa  48.9  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.153669  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2038  nitroreductase family protein  23.01 
 
 		 215 aa  48.9  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119654  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1568  nitroreductase  22.63 
 
 		 191 aa  48.9  0.00006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0579  nitroreductase  21.69 
 
 		 173 aa  48.9  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2080  nitroreductase  23.35 
 
 		 215 aa  48.1  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.123305  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3002  nitroreductase  24.74 
 
 		 195 aa  48.1  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.454313  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2805  nitroreductase family protein  25.11 
 
 		 201 aa  47.8  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.360066  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1200  nitroreductase  22.58 
 
 		 188 aa  47.8  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3612  nitroreductase family protein  25.11 
 
 		 201 aa  47.8  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0694  nitroreductase  22.9 
 
 		 183 aa  48.1  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.402157  unclonable  1.19991e-19 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0189  nitroreductase  19.02 
 
 		 203 aa  47.8  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3601  nitroreductase family protein  25.11 
 
 		 201 aa  47.8  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.735488  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3625  nitroreductase family protein  25.11 
 
 		 201 aa  47.8  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.159047  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3172  nitroreductase family protein  25.11 
 
 		 201 aa  47.8  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>