196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4388 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4388  nitroreductase  100 
 
 		 211 aa  426  1e-118  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.98243  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0515  nitroreductase  59.8 
 
 		 200 aa  218  6e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.303234  decreased coverage  0.000536484 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0427  nitroreductase  58.33 
 
 		 200 aa  212  2.9999999999999995e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.693238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3234  nitroreductase  59.9 
 
 		 199 aa  209  3e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.33338  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3014  nitroreductase  57.67 
 
 		 212 aa  205  3e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.579195  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7111  nitroreductase  48.78 
 
 		 204 aa  190  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.109168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1547  nitroreductase  43.52 
 
 		 192 aa  130  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.259202  normal  0.0817814 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4170  Nitroreductase-like protein  36.72 
 
 		 199 aa  94  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  28.78 
 
 		 169 aa  78.2  0.00000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3226  nitroreductase  32.04 
 
 		 187 aa  73.6  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.236693  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  27.45 
 
 		 170 aa  71.6  0.000000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  26.07 
 
 		 184 aa  68.2  0.00000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  28.23 
 
 		 186 aa  68.2  0.00000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  25.37 
 
 		 176 aa  67.8  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  28.81 
 
 		 166 aa  67.4  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_585  nitroreductase  30.34 
 
 		 169 aa  67.4  0.0000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.179153  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  32.31 
 
 		 174 aa  67.4  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1353  nitroreductase family protein  30.41 
 
 		 169 aa  66.6  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000360113  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  28.81 
 
 		 166 aa  66.6  0.0000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  24.27 
 
 		 178 aa  64.3  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1846  nitroreductase  27.46 
 
 		 172 aa  64.3  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000122819 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  25.59 
 
 		 186 aa  64.7  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3299  NADPH-flavin oxidoreductase  25.27 
 
 		 169 aa  63.5  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.47744  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2373  nitroreductase  27.53 
 
 		 172 aa  62.8  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00327904  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0837  nitroreductase  28.5 
 
 		 173 aa  62.4  0.000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.638671  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1997  nitroreductase  27.32 
 
 		 182 aa  62.4  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0291646  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  28.78 
 
 		 178 aa  62.4  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  28.64 
 
 		 176 aa  62  0.000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1563  nitroreductase  28.5 
 
 		 173 aa  61.6  0.000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0645  nitroreductase family protein  28.09 
 
 		 171 aa  61.2  0.00000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0679  nitroreductase family protein  28.09 
 
 		 171 aa  61.2  0.00000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  26.82 
 
 		 168 aa  61.2  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0729  nitroreductase  30.43 
 
 		 220 aa  60.1  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.552696  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  26.96 
 
 		 183 aa  60.5  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  22.94 
 
 		 176 aa  60.1  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  30 
 
 		 174 aa  59.7  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  26.32 
 
 		 163 aa  59.7  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2975  nitroreductase  26.67 
 
 		 169 aa  60.1  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.522963 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1114  nitroreductase  27.54 
 
 		 173 aa  59.3  0.00000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0271  nitroreductase  27.88 
 
 		 171 aa  59.3  0.00000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000757805  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1120  nitroreductase  26.96 
 
 		 173 aa  59.3  0.00000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.960146  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0599  nitroreductase  25.45 
 
 		 166 aa  58.9  0.00000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0809  nitroreductase  28.16 
 
 		 169 aa  59.3  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.177891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0617  nitroreductase  26.97 
 
 		 169 aa  58.9  0.00000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.146729  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  26.32 
 
 		 186 aa  58.5  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1294  nitroreductase  25.6 
 
 		 167 aa  58.2  0.00000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0670007  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  26.7 
 
 		 190 aa  58.2  0.00000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4962  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  27.03 
 
 		 207 aa  58.2  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.445827  normal  0.0961797 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0212  nitroreductase  27.92 
 
 		 184 aa  57.4  0.0000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.362808  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3407  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  27.88 
 
 		 222 aa  57.4  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5547  nitroreductase  28.11 
 
 		 241 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1141  nitroreductase  24.12 
 
 		 171 aa  56.6  0.0000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.426198  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0079  nitroreductase  25.74 
 
 		 175 aa  56.2  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.423186  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2105  nitroreductase  23.43 
 
 		 176 aa  55.8  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.892838  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  25 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  25 
 
 		 194 aa  55.5  0.0000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1183  nitroreductase  21.28 
 
 		 175 aa  55.1  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000761176  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3115  nitroreductase  25.33 
 
 		 239 aa  54.7  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.029346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0857  nitroreductase  25.98 
 
 		 175 aa  54.7  0.0000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.3237  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1270  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  27.6 
 
 		 216 aa  52.8  0.000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0353  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  27.4 
 
 		 212 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.261778  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3598  hypothetical protein  28.43 
 
 		 230 aa  52.8  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05880  nitroreductase  31.36 
 
 		 166 aa  52.4  0.000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0579  nitroreductase  22.65 
 
 		 173 aa  52.4  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3956  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  29.03 
 
 		 230 aa  52.4  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.733345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  27.07 
 
 		 192 aa  52  0.000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0846  nitroreductase  22.78 
 
 		 169 aa  52  0.000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.245537  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3218  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  27.96 
 
 		 230 aa  51.6  0.000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1262  nitroreductase  30.1 
 
 		 225 aa  51.6  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.88  normal  0.0140866 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5045  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  27.98 
 
 		 584 aa  51.6  0.000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.87863  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4232  nitroreductase  26.29 
 
 		 214 aa  50.8  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2855  nitroreductase  26.29 
 
 		 191 aa  51.2  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3531  nitroreductase  25.6 
 
 		 197 aa  51.2  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.12812  normal  0.174487 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2518  F420-0--gamma-glutamyl ligase  27.98 
 
 		 423 aa  50.8  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0675541  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1625  nitroreductase  22.6 
 
 		 176 aa  51.2  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0106837  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0427  oxidoreductase  26.56 
 
 		 205 aa  50.8  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2559  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  29.78 
 
 		 275 aa  51.6  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0540417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0509  nitroreductase  24.04 
 
 		 181 aa  50.1  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4933  nitroreductase  26.89 
 
 		 226 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.850383  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1165  nitroreductase family protein  24.02 
 
 		 181 aa  50.4  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000313764  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0997  nitroreductase family protein  24.02 
 
 		 181 aa  50.4  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0119809  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5021  nitroreductase  26.89 
 
 		 226 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.227652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5314  nitroreductase  26.89 
 
 		 226 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3382  nitroreductase  24.78 
 
 		 234 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.385821 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4448  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  27.03 
 
 		 209 aa  50.4  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.178194 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1328  nitroreductase  26.7 
 
 		 170 aa  50.1  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000802581 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  20.94 
 
 		 187 aa  49.7  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6394  nitroreductase  27.35 
 
 		 280 aa  50.1  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.130468 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0694  nitroreductase  25.41 
 
 		 183 aa  50.1  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.402157  unclonable  1.19991e-19 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0794  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  29.82 
 
 		 247 aa  49.3  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2000  nitroreductase  26.64 
 
 		 213 aa  49.3  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.578725  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0341  Cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  29.82 
 
 		 247 aa  49.3  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0664  nitroreductase  25.13 
 
 		 180 aa  49.3  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.237638  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0824  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  29.82 
 
 		 247 aa  49.3  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.307399  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1863  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  23.35 
 
 		 220 aa  49.3  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000280674 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1158  nitroreductase  26.78 
 
 		 169 aa  49.3  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000244648  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1518  nitroreductase  21.46 
 
 		 170 aa  49.3  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2694  nitroreductase family protein  29.71 
 
 		 351 aa  49.3  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.990195  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3208  nitroreductase family protein  29.71 
 
 		 394 aa  48.9  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0073  nitroreductase family protein  24 
 
 		 178 aa  48.9  0.00006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>