147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7111 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7111  nitroreductase  100 
 
 		 204 aa  419  1e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.109168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3234  nitroreductase  51.49 
 
 		 199 aa  193  1e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.33338  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0515  nitroreductase  51.37 
 
 		 200 aa  191  5e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.303234  decreased coverage  0.000536484 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4388  nitroreductase  48.78 
 
 		 211 aa  186  2e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.98243  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0427  nitroreductase  47.83 
 
 		 200 aa  181  8.000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.693238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3014  nitroreductase  45.79 
 
 		 212 aa  166  2e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.579195  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1547  nitroreductase  42.11 
 
 		 192 aa  122  3e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.259202  normal  0.0817814 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4170  Nitroreductase-like protein  35.56 
 
 		 199 aa  104  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0599  nitroreductase  29.88 
 
 		 166 aa  73.2  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  28.04 
 
 		 169 aa  68.2  0.00000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  24.76 
 
 		 186 aa  67.4  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1141  nitroreductase  29.76 
 
 		 171 aa  66.2  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.426198  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3299  NADPH-flavin oxidoreductase  27.42 
 
 		 169 aa  63.5  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.47744  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1294  nitroreductase  27.69 
 
 		 167 aa  63.2  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0670007  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1353  nitroreductase family protein  32.75 
 
 		 169 aa  62  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000360113  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  24.64 
 
 		 188 aa  61.6  0.000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2738  nitroreductase  25.54 
 
 		 170 aa  61.2  0.000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0729  nitroreductase  28.4 
 
 		 220 aa  59.3  0.00000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.552696  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  22.12 
 
 		 184 aa  59.3  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3226  nitroreductase  26.74 
 
 		 187 aa  59.3  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.236693  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  28.9 
 
 		 174 aa  58.5  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2975  nitroreductase  25.79 
 
 		 169 aa  57.8  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.522963 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2518  F420-0--gamma-glutamyl ligase  28.8 
 
 		 423 aa  57  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0675541  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  27.06 
 
 		 176 aa  57  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  24.64 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0809  nitroreductase  29.65 
 
 		 169 aa  56.2  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.177891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0271  nitroreductase  25.24 
 
 		 171 aa  55.8  0.0000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000757805  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  26.84 
 
 		 174 aa  55.8  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4002  hypothetical protein  28.32 
 
 		 867 aa  55.1  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3407  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  51.67 
 
 		 222 aa  54.7  0.0000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  24.38 
 
 		 178 aa  54.7  0.0000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4962  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  28.37 
 
 		 207 aa  53.9  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.445827  normal  0.0961797 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_585  nitroreductase  27.65 
 
 		 169 aa  53.5  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.179153  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  25.73 
 
 		 176 aa  53.5  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  24.4 
 
 		 166 aa  52.4  0.000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0440  nitroreductase  28.14 
 
 		 201 aa  51.6  0.000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.407872  normal  0.661672 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  26.4 
 
 		 187 aa  51.2  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  22.49 
 
 		 186 aa  50.8  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0748  F420-dependent oxidoreductase  31.15 
 
 		 427 aa  51.2  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0318949  normal  0.411209 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0141  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  28.11 
 
 		 324 aa  50.4  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  22.94 
 
 		 176 aa  50.1  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2105  nitroreductase  22.35 
 
 		 176 aa  50.1  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.892838  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6334  F420-0--gamma-glutamyl ligase  29.21 
 
 		 461 aa  50.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  23.81 
 
 		 166 aa  50.4  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3218  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  27.7 
 
 		 230 aa  49.3  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  26.9 
 
 		 192 aa  49.7  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3956  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  26.76 
 
 		 230 aa  49.7  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.733345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4448  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  41.79 
 
 		 209 aa  49.7  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.178194 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1862  nitroreductase  24 
 
 		 197 aa  49.3  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2168  nitroreductase  25.68 
 
 		 224 aa  49.3  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2187  nitroreductase  25.58 
 
 		 173 aa  48.9  0.00005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.530109 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  23.9 
 
 		 194 aa  48.9  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0202  nitroreductase  19.89 
 
 		 243 aa  48.5  0.00006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.779167  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1563  nitroreductase  23.21 
 
 		 173 aa  48.5  0.00006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1120  nitroreductase  26.19 
 
 		 173 aa  48.5  0.00006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.960146  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  25.67 
 
 		 167 aa  48.1  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2717  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  24.27 
 
 		 215 aa  48.1  0.00008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.526918 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1517  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  23.72 
 
 		 217 aa  48.1  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0235269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1732  F420-0--gamma-glutamyl ligase  25.41 
 
 		 446 aa  48.1  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.897259 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001121  NADPH-flavin oxidoreductase  25.75 
 
 		 240 aa  48.1  0.00008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000890353  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  22.49 
 
 		 163 aa  48.1  0.00008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0617  nitroreductase  24.38 
 
 		 169 aa  48.1  0.00009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.146729  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0645  nitroreductase family protein  23.15 
 
 		 171 aa  47.8  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0679  nitroreductase family protein  23.15 
 
 		 171 aa  47.8  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  24.87 
 
 		 179 aa  47.4  0.0001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06664  nitroreductase A  24.86 
 
 		 257 aa  47.8  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7192  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  26.34 
 
 		 228 aa  47.8  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0837  nitroreductase  22.62 
 
 		 173 aa  48.1  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.638671  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  24.62 
 
 		 163 aa  47  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2938  nitroreductase family protein  24.76 
 
 		 201 aa  47  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  23.41 
 
 		 194 aa  47.4  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  22.11 
 
 		 170 aa  47  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1114  nitroreductase  23.21 
 
 		 173 aa  46.6  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06230  F420-0--gamma-glutamyl ligase  27.03 
 
 		 448 aa  46.2  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.574814  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2805  nitroreductase family protein  26.63 
 
 		 201 aa  45.8  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.360066  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3612  nitroreductase family protein  26.63 
 
 		 201 aa  45.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0028  nitroreductase family protein  26.63 
 
 		 201 aa  45.8  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.901836  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3601  nitroreductase family protein  26.63 
 
 		 201 aa  45.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.735488  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3625  nitroreductase family protein  26.63 
 
 		 201 aa  45.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.159047  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  22.11 
 
 		 178 aa  45.8  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1437  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  22.58 
 
 		 218 aa  45.8  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0846  nitroreductase  24.02 
 
 		 169 aa  46.2  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.245537  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1183  nitroreductase  21.08 
 
 		 175 aa  45.8  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000761176  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0381  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  28.49 
 
 		 213 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.199086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1738  nitroreductase family protein  26.63 
 
 		 201 aa  45.8  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3172  nitroreductase family protein  26.63 
 
 		 201 aa  45.8  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5547  nitroreductase  23.92 
 
 		 241 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1204  nitroreductase  26.13 
 
 		 174 aa  45.4  0.0006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.460953  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0660  nitroreductase family protein  25 
 
 		 184 aa  45.1  0.0007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.799475 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1323  F420-0--gamma-glutamyl ligase  24.44 
 
 		 455 aa  45.1  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1340  F420-0--gamma-glutamyl ligase  24.44 
 
 		 455 aa  45.1  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.887486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0353  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  25.78 
 
 		 212 aa  45.1  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.261778  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0782  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  43.64 
 
 		 233 aa  44.7  0.0008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1997  nitroreductase  21.47 
 
 		 182 aa  45.1  0.0008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0291646  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0857  nitroreductase  22.22 
 
 		 175 aa  45.1  0.0008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.3237  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0493  nitroreductase  22.34 
 
 		 269 aa  45.1  0.0008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2559  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  26.97 
 
 		 275 aa  45.1  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0540417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3155  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  45.76 
 
 		 217 aa  44.7  0.0009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182044  normal  0.28119 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2878  Cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  25.71 
 
 		 279 aa  44.3  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.348827  normal  0.405788 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1359  F420-0--gamma-glutamyl ligase  24.44 
 
 		 471 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.576813  normal  0.392124 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>