173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_4002 on replicon NC_009430
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009430  Rsph17025_4002  hypothetical protein  100 
 
 		 867 aa  1781    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0061  nitroreductase  30.54 
 
 		 338 aa  151  6e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.259193 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0731  nitroreductase-like protein  33.45 
 
 		 347 aa  148  4.0000000000000006e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0140  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit domain protein  27.68 
 
 		 867 aa  148  6e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  7.0838e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2019  nitroreductase  32.13 
 
 		 340 aa  130  1.0000000000000001e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.997085  normal  0.966665 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2097  nitroreductase  31.63 
 
 		 334 aa  126  2e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2894  hypothetical protein  31.23 
 
 		 329 aa  124  6e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0060  hypothetical protein  27.39 
 
 		 368 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.272206 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0298  hypothetical protein  32.53 
 
 		 367 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2891  nitroreductase  42.51 
 
 		 340 aa  115  5e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1605  nitroreductase  27.05 
 
 		 330 aa  107  8e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.690358  normal  0.842537 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0960  putative WfaX  26.68 
 
 		 348 aa  104  8e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2549  hypothetical protein  28.08 
 
 		 383 aa  97.4  9e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1362  hypothetical protein  29.29 
 
 		 390 aa  93.2  2e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0609018  hitchhiker  0.00000046022 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2982  nitroreductase-like protein  26.02 
 
 		 363 aa  93.2  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1607  hypothetical protein  24.48 
 
 		 367 aa  87  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.634641 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2618  hypothetical protein  26.79 
 
 		 358 aa  85.9  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.568711  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2975  nitroreductase  33.33 
 
 		 169 aa  81.3  0.00000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.522963 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2095  hypothetical protein  23.7 
 
 		 394 aa  75.5  0.000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3682  hypothetical protein  26.27 
 
 		 366 aa  73.9  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00939506  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  30.46 
 
 		 167 aa  68.2  0.0000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1409  hypothetical protein  26.34 
 
 		 376 aa  68.2  0.0000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.872031  hitchhiker  0.0084702 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  29.53 
 
 		 176 aa  67.8  0.0000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  29.33 
 
 		 166 aa  66.6  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0271  nitroreductase  31.37 
 
 		 171 aa  65.5  0.000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000757805  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  29.33 
 
 		 166 aa  64.7  0.000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1652  nitroreductase  30.25 
 
 		 171 aa  63.9  0.00000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.177323  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26390  nitroreductase  30.99 
 
 		 174 aa  63.9  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0509  nitroreductase  26.88 
 
 		 181 aa  62.4  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0599  nitroreductase  27.44 
 
 		 166 aa  60.5  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2730  nitroreductase  30.56 
 
 		 205 aa  59.3  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.796867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0470  nitroreductase  28.86 
 
 		 171 aa  58.9  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0809  nitroreductase  28.32 
 
 		 169 aa  58.2  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.177891  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0645  nitroreductase family protein  26.85 
 
 		 171 aa  58.2  0.0000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0679  nitroreductase family protein  26.85 
 
 		 171 aa  58.2  0.0000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0690  nitroreductase  26.99 
 
 		 246 aa  57.8  0.0000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0134674  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  27.92 
 
 		 174 aa  57.8  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1136  nitroreductase  23.27 
 
 		 200 aa  57  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.710664  normal  0.0578189 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  30.46 
 
 		 192 aa  57.4  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1862  nitroreductase  25.33 
 
 		 197 aa  57.4  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0660  nitroreductase family protein  28.21 
 
 		 184 aa  56.6  0.000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.799475 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1353  nitroreductase family protein  32 
 
 		 169 aa  56.2  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000360113  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0617  nitroreductase  26.17 
 
 		 169 aa  56.6  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.146729  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1204  nitroreductase  30.67 
 
 		 174 aa  55.8  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.460953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7190  Nitroreductase  27.46 
 
 		 253 aa  55.8  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.561189  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3965  nitroreductase  25.41 
 
 		 265 aa  55.8  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.696228 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  28.98 
 
 		 174 aa  55.8  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0706  nitroreductase  28.4 
 
 		 168 aa  56.2  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.272775 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  26.47 
 
 		 167 aa  55.8  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0427  oxidoreductase  31.11 
 
 		 205 aa  55.5  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3531  nitroreductase  31.11 
 
 		 197 aa  55.1  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.12812  normal  0.174487 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  22.81 
 
 		 170 aa  55.5  0.000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24750  nitroreductase  25 
 
 		 176 aa  55.1  0.000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0536  nitroreductase  27.1 
 
 		 172 aa  55.1  0.000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.870767  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  25.64 
 
 		 169 aa  54.7  0.000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  26.17 
 
 		 176 aa  54.7  0.000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1625  nitroreductase  25.64 
 
 		 176 aa  54.7  0.000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0106837  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5299  nitroreductase  29.41 
 
 		 274 aa  54.3  0.000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.367904  normal  0.0165662 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  27.21 
 
 		 177 aa  54.3  0.000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3049  nitroreductase  26.75 
 
 		 170 aa  54.3  0.000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0221  nitroreductase  27.54 
 
 		 180 aa  53.9  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.602782  normal  0.0189765 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  26.32 
 
 		 190 aa  53.9  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0440  nitroreductase  26.75 
 
 		 201 aa  53.5  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.407872  normal  0.661672 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  23.53 
 
 		 163 aa  53.5  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0857  nitroreductase  25.91 
 
 		 175 aa  53.5  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.3237  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_585  nitroreductase  24.49 
 
 		 169 aa  53.5  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.179153  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1563  nitroreductase  23.03 
 
 		 173 aa  53.1  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  22.09 
 
 		 168 aa  52.8  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1408  nitroreductase  24.32 
 
 		 217 aa  52.8  0.00003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0739  nitroreductase  25 
 
 		 176 aa  52.4  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.033186  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1328  nitroreductase  26.54 
 
 		 170 aa  52  0.00005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000802581 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1165  nitroreductase family protein  25.28 
 
 		 181 aa  52  0.00005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000313764  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0997  nitroreductase family protein  25.28 
 
 		 181 aa  52  0.00005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0119809  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3879  hypothetical protein  26.19 
 
 		 354 aa  52  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1120  nitroreductase  25.3 
 
 		 173 aa  51.6  0.00006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.960146  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0218  nitroreductase  24.28 
 
 		 180 aa  51.2  0.00009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0046  nitroreductase  28.95 
 
 		 186 aa  51.2  0.00009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1183  nitroreductase  23.33 
 
 		 175 aa  50.8  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000761176  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  24.55 
 
 		 178 aa  50.4  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0837  nitroreductase  22.75 
 
 		 173 aa  50.4  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.638671  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1903  nitroreductase  26.06 
 
 		 185 aa  50.4  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1846  nitroreductase  26.47 
 
 		 172 aa  50.4  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000122819 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0229  nitroreductase  22.15 
 
 		 169 aa  50.8  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00298374  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1130  nitroreductase  29.17 
 
 		 286 aa  50.8  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  27.07 
 
 		 179 aa  50.4  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  28.11 
 
 		 183 aa  50.1  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3226  nitroreductase  22.67 
 
 		 187 aa  50.1  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.236693  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  24.68 
 
 		 163 aa  49.7  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0202  nitroreductase  24.86 
 
 		 243 aa  49.7  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.779167  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  25.31 
 
 		 184 aa  50.4  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  23.7 
 
 		 187 aa  50.1  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2738  nitroreductase  25.99 
 
 		 170 aa  49.7  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1660  nitroreductase  27.33 
 
 		 175 aa  49.7  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.283139  normal  0.036754 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1605  NADPH-flavin oxidoreductase  24.68 
 
 		 169 aa  49.3  0.0003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06664  nitroreductase A  24.02 
 
 		 257 aa  49.3  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2805  nitroreductase family protein  29.41 
 
 		 201 aa  48.9  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.360066  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3612  nitroreductase family protein  29.41 
 
 		 201 aa  48.9  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0028  nitroreductase family protein  29.41 
 
 		 201 aa  48.9  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.901836  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3625  nitroreductase family protein  29.41 
 
 		 201 aa  48.9  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.159047  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4170  Nitroreductase-like protein  25.39 
 
 		 199 aa  48.9  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>