40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_2019 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_2019  nitroreductase  100 
 
 
340 aa  703    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.997085  normal  0.966665 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2097  nitroreductase  31.82 
 
 
334 aa  158  1e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0061  nitroreductase  30.99 
 
 
338 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.259193 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4002  hypothetical protein  32.13 
 
 
867 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2891  nitroreductase  31.96 
 
 
340 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0731  nitroreductase-like protein  28.66 
 
 
347 aa  125  1e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1605  nitroreductase  29.15 
 
 
330 aa  109  9.000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.690358  normal  0.842537 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2982  nitroreductase-like protein  30.19 
 
 
363 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  27.06 
 
 
176 aa  64.3  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0739  nitroreductase  27.89 
 
 
176 aa  58.5  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.033186  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2247  nitroreductase  25.68 
 
 
209 aa  53.1  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.200242  normal  0.163117 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0706  nitroreductase  24.07 
 
 
168 aa  52.4  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.272775 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0079  nitroreductase  26.44 
 
 
175 aa  52  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.423186  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  23.89 
 
 
183 aa  51.6  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  23.53 
 
 
204 aa  51.2  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  24.72 
 
 
165 aa  50.8  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1652  nitroreductase  23.49 
 
 
171 aa  50.4  0.00004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.177323  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1728  nitroreductase  29.02 
 
 
230 aa  50.4  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.113712  normal  0.463075 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2104  nitroreductase  24.54 
 
 
223 aa  49.3  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.0062642  normal  0.304613 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0708  nitroreductase family protein  25.77 
 
 
171 aa  48.9  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00199278  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1408  nitroreductase  23.26 
 
 
217 aa  48.1  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0218  nitroreductase  23.39 
 
 
180 aa  48.1  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0470  nitroreductase  25.35 
 
 
171 aa  47.4  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2684  nitroreductase  23.5 
 
 
178 aa  47  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3299  NADPH-flavin oxidoreductase  24.34 
 
 
169 aa  47  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.47744  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2388  nitroreductase  24.77 
 
 
226 aa  47  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  22.36 
 
 
187 aa  46.6  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4604  nitroreductase  25.56 
 
 
241 aa  45.4  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.278026  normal  0.441291 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0073  nitroreductase family protein  21.71 
 
 
178 aa  45.4  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  24.07 
 
 
178 aa  45.4  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  26.22 
 
 
167 aa  45.4  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26390  nitroreductase  28.46 
 
 
174 aa  44.3  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  23.08 
 
 
192 aa  43.9  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  22.83 
 
 
174 aa  43.5  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0536  nitroreductase  24.18 
 
 
172 aa  43.1  0.006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.870767  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1563  nitroreductase  21.15 
 
 
173 aa  43.1  0.007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1625  nitroreductase  23.18 
 
 
176 aa  43.1  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0106837  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  24.85 
 
 
166 aa  43.1  0.008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3427  nitroreductase  35.82 
 
 
213 aa  42.7  0.01  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  25.73 
 
 
163 aa  42.4  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>