179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0731 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0731  nitroreductase-like protein  100 
 
 		 347 aa  717    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2097  nitroreductase  37.15 
 
 		 334 aa  151  1e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4002  hypothetical protein  33.45 
 
 		 867 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2891  nitroreductase  29.31 
 
 		 340 aa  133  3.9999999999999996e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2019  nitroreductase  28.66 
 
 		 340 aa  125  1e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.997085  normal  0.966665 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1605  nitroreductase  37.82 
 
 		 330 aa  122  9e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.690358  normal  0.842537 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0061  nitroreductase  25.09 
 
 		 338 aa  119  7e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.259193 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2982  nitroreductase-like protein  31.96 
 
 		 363 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  28.24 
 
 		 176 aa  82  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  28.65 
 
 		 183 aa  70.5  0.00000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1513  nitroreductase  23.86 
 
 		 180 aa  69.7  0.00000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000744029 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  31.36 
 
 		 174 aa  66.2  0.0000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1165  nitroreductase family protein  26.37 
 
 		 181 aa  64.3  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000313764  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0997  nitroreductase family protein  26.37 
 
 		 181 aa  64.3  0.000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0119809  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1472  nitroreductase  28.57 
 
 		 172 aa  62  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  34.74 
 
 		 204 aa  60.8  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2012  nitroreductase  25.78 
 
 		 223 aa  61.2  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  26.38 
 
 		 170 aa  59.3  0.00000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1652  nitroreductase  27.27 
 
 		 171 aa  58.9  0.0000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.177323  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0218  nitroreductase  27.27 
 
 		 180 aa  59.3  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  26.59 
 
 		 163 aa  57.4  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  30.19 
 
 		 166 aa  57.4  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0509  nitroreductase  26.25 
 
 		 181 aa  57.4  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  22.16 
 
 		 187 aa  57  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  26.29 
 
 		 186 aa  57.4  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1203  nitroreductase  23.92 
 
 		 231 aa  57  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000186245  normal  0.254827 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  26.03 
 
 		 165 aa  56.6  0.0000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4604  nitroreductase  28.64 
 
 		 241 aa  56.6  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.278026  normal  0.441291 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  30.19 
 
 		 166 aa  56.6  0.0000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  28.82 
 
 		 194 aa  56.2  0.0000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  26.63 
 
 		 166 aa  56.2  0.0000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2938  nitroreductase family protein  28.34 
 
 		 201 aa  55.8  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2000  nitroreductase  29.44 
 
 		 213 aa  55.8  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.578725  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  28.24 
 
 		 194 aa  55.5  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0649  nitroreductase  25.15 
 
 		 173 aa  55.1  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.535499  normal  0.149872 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0212  nitroreductase  27.27 
 
 		 184 aa  54.7  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.362808  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0382  nitroreductase  25.74 
 
 		 213 aa  54.7  0.000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000218228  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3531  nitroreductase  27.22 
 
 		 197 aa  54.7  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.12812  normal  0.174487 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0474  nitroreductase  29.76 
 
 		 201 aa  53.5  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.573695 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3589  nitroreductase  29.76 
 
 		 201 aa  53.5  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0079  nitroreductase  29.89 
 
 		 175 aa  53.1  0.000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.423186  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3737  NADH dehydrogenase  24.29 
 
 		 221 aa  53.1  0.000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3047  nitroreductase  25.12 
 
 		 239 aa  53.1  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.496767  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6222  nitroreductase  23.77 
 
 		 246 aa  53.1  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2436  nitroreductase  24.32 
 
 		 242 aa  53.1  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6027  nitroreductase  24.69 
 
 		 254 aa  53.1  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3050  nitroreductase  24.32 
 
 		 242 aa  53.1  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.908871  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2805  nitroreductase family protein  27.68 
 
 		 201 aa  52.8  0.000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.360066  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3612  nitroreductase family protein  27.68 
 
 		 201 aa  52.8  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0028  nitroreductase family protein  27.68 
 
 		 201 aa  52.8  0.000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.901836  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3601  nitroreductase family protein  27.68 
 
 		 201 aa  52.8  0.000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.735488  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3625  nitroreductase family protein  27.68 
 
 		 201 aa  52.8  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.159047  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  24.85 
 
 		 168 aa  52.8  0.000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1720  nitroreductase  22.78 
 
 		 196 aa  52.8  0.000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  23.97 
 
 		 176 aa  52.8  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2684  nitroreductase  25.28 
 
 		 178 aa  52.4  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1738  nitroreductase family protein  27.68 
 
 		 201 aa  52.8  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3172  nitroreductase family protein  27.68 
 
 		 201 aa  52.8  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3640  nitroreductase  37.93 
 
 		 245 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3069  nitroreductase  24.32 
 
 		 242 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.394271 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2465  nitroreductase  25.41 
 
 		 202 aa  52  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6397  nitroreductase  24.55 
 
 		 242 aa  51.6  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2604  nitroreductase  28.57 
 
 		 201 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.759207  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0501  nitroreductase  28.57 
 
 		 201 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5783  nitroreductase  24.2 
 
 		 254 aa  51.6  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0470  nitroreductase  29.73 
 
 		 171 aa  51.2  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2104  nitroreductase  26.29 
 
 		 223 aa  50.4  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.0062642  normal  0.304613 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0709  nitroreductase  30.41 
 
 		 215 aa  50.8  0.00004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3999  nitroreductase  24.75 
 
 		 223 aa  50.4  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2164  nitroreductase  25.14 
 
 		 190 aa  50.4  0.00005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1357  nitroreductase  30.58 
 
 		 214 aa  50.1  0.00005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.374254 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2247  nitroreductase  27.13 
 
 		 209 aa  50.1  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.200242  normal  0.163117 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  26.55 
 
 		 178 aa  49.7  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0073  nitroreductase family protein  27.13 
 
 		 178 aa  49.7  0.00008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0427  oxidoreductase  26.86 
 
 		 205 aa  49.7  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1916  nitroreductase  26.6 
 
 		 223 aa  49.3  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.385267 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7293  nitroreductase  28.32 
 
 		 228 aa  49.3  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.367017 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3154  nitroreductase  46.81 
 
 		 225 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.297718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2896  nitroreductase  28.48 
 
 		 207 aa  48.9  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.318005  normal  0.764115 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  23.35 
 
 		 170 aa  48.9  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  26.04 
 
 		 184 aa  48.1  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1481  nitroreductase  25.63 
 
 		 236 aa  48.1  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0777  nitroreductase  45.28 
 
 		 275 aa  48.1  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0136069  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0170  nitroreductase  24.31 
 
 		 221 aa  48.5  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.834926  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  26.04 
 
 		 186 aa  48.5  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0432  nitroreductase  29.17 
 
 		 201 aa  48.5  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.181342  normal  0.330733 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  25.82 
 
 		 190 aa  47.8  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1997  nitroreductase  28.07 
 
 		 182 aa  47.4  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0291646  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0739  nitroreductase  24.69 
 
 		 176 aa  47.8  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.033186  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2969  nitroreductase  26.44 
 
 		 235 aa  47.4  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.788882  normal  0.0360376 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0406  nitroreductase  27.17 
 
 		 201 aa  47.4  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.699033  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0545  nitroreductase  23.23 
 
 		 172 aa  47.4  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.361368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1796  nitroreductase  31.58 
 
 		 227 aa  47  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.539857  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2283  nitroreductase  33.33 
 
 		 199 aa  47  0.0005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.671339  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  24.65 
 
 		 167 aa  47  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26390  nitroreductase  27.11 
 
 		 174 aa  46.6  0.0006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0579  nitroreductase  25.79 
 
 		 173 aa  46.6  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  25.5 
 
 		 163 aa  46.6  0.0007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4783  nitroreductase  26.37 
 
 		 217 aa  46.2  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0866516 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1543  nitroreductase  36.25 
 
 		 232 aa  46.2  0.0008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.973718  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>