45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_2097 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_2097  nitroreductase  100 
 
 
334 aa  692    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0061  nitroreductase  34.43 
 
 
338 aa  172  5.999999999999999e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.259193 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2019  nitroreductase  31.82 
 
 
340 aa  158  1e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.997085  normal  0.966665 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0731  nitroreductase-like protein  37.15 
 
 
347 aa  151  1e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4002  hypothetical protein  31.63 
 
 
867 aa  126  5e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2891  nitroreductase  30.41 
 
 
340 aa  125  8.000000000000001e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1605  nitroreductase  32.75 
 
 
330 aa  125  1e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.690358  normal  0.842537 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2982  nitroreductase-like protein  23.31 
 
 
363 aa  65.9  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  27.88 
 
 
176 aa  55.8  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0509  nitroreductase  23.84 
 
 
181 aa  52.8  0.000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  27.27 
 
 
186 aa  52.4  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  28.41 
 
 
186 aa  52  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0079  nitroreductase  29.52 
 
 
175 aa  50.1  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.423186  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0470  nitroreductase  26.21 
 
 
171 aa  50.1  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  27.22 
 
 
188 aa  49.3  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0690  nitroreductase  26.54 
 
 
246 aa  48.9  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0134674  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1448  hypothetical protein  28.05 
 
 
176 aa  48.5  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.848866  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0536  nitroreductase  25.83 
 
 
172 aa  47  0.0004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.870767  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  26.53 
 
 
194 aa  47  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24750  nitroreductase  25 
 
 
176 aa  46.6  0.0005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  25.29 
 
 
178 aa  46.6  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  25 
 
 
184 aa  46.6  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  25.34 
 
 
194 aa  45.4  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  24.18 
 
 
186 aa  45.8  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1024  nitroreductase  33.63 
 
 
213 aa  45.4  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1083  nitroreductase  26.47 
 
 
175 aa  45.8  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000705077  normal  0.264169 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  26.9 
 
 
174 aa  45.4  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  23.45 
 
 
178 aa  44.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0660  nitroreductase family protein  27.04 
 
 
184 aa  44.7  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.799475 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1475  nitroreductase  27.38 
 
 
175 aa  44.3  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.254449  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2938  nitroreductase family protein  28.22 
 
 
201 aa  44.7  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2730  nitroreductase  28.1 
 
 
205 aa  43.9  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.796867  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3625  nitroreductase family protein  28.22 
 
 
201 aa  43.9  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.159047  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3601  nitroreductase family protein  28.22 
 
 
201 aa  43.9  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.735488  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2805  nitroreductase family protein  28.22 
 
 
201 aa  43.9  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.360066  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0028  nitroreductase family protein  28.22 
 
 
201 aa  43.9  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.901836  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3612  nitroreductase family protein  28.22 
 
 
201 aa  43.9  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01216  putative oxidoreductase  40 
 
 
223 aa  43.5  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3172  nitroreductase family protein  28.22 
 
 
201 aa  43.1  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  24.55 
 
 
170 aa  43.1  0.006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1738  nitroreductase family protein  28.22 
 
 
201 aa  43.1  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0218  nitroreductase  25.29 
 
 
180 aa  43.1  0.007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  23.03 
 
 
183 aa  42.7  0.008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1652  nitroreductase  26.63 
 
 
171 aa  42.7  0.009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.177323  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0857  nitroreductase  28.33 
 
 
175 aa  42.4  0.01  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.3237  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>