123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_1605 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010468  EcolC_1605  nitroreductase  100 
 
 		 330 aa  671    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.690358  normal  0.842537 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2097  nitroreductase  32.75 
 
 		 334 aa  125  1e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0731  nitroreductase-like protein  37.82 
 
 		 347 aa  122  8e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2019  nitroreductase  29.15 
 
 		 340 aa  109  8.000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.997085  normal  0.966665 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0061  nitroreductase  27.53 
 
 		 338 aa  108  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.259193 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4002  hypothetical protein  27.05 
 
 		 867 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2982  nitroreductase-like protein  27.62 
 
 		 363 aa  102  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2891  nitroreductase  28.47 
 
 		 340 aa  95.1  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0406  nitroreductase  27.33 
 
 		 201 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.699033  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  22.52 
 
 		 176 aa  60.8  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0432  nitroreductase  26.74 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.181342  normal  0.330733 
 
 
-
 
NC_002950  PG0660  nitroreductase family protein  25.62 
 
 		 184 aa  58.9  0.0000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.799475 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0474  nitroreductase  25.58 
 
 		 201 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.573695 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2604  nitroreductase  25.58 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.759207  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0501  nitroreductase  25.58 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3589  nitroreductase  25 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  26.42 
 
 		 168 aa  55.8  0.0000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0708  nitroreductase family protein  27.98 
 
 		 171 aa  55.8  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00199278  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2938  nitroreductase family protein  25.43 
 
 		 201 aa  55.8  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3146  nitroreductase  27.27 
 
 		 200 aa  55.8  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  23.64 
 
 		 183 aa  54.7  0.000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3562  nitroreductase  22.91 
 
 		 200 aa  55.1  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1660  nitroreductase  25.97 
 
 		 175 aa  54.3  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.283139  normal  0.036754 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0509  nitroreductase  24.55 
 
 		 181 aa  54.3  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1652  nitroreductase  24.68 
 
 		 171 aa  54.3  0.000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.177323  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0857  nitroreductase  26.32 
 
 		 175 aa  54.3  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.3237  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0014  nitroreductase family protein  22.6 
 
 		 198 aa  54.3  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3370  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  27.98 
 
 		 199 aa  53.1  0.000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0510232  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1566  nitroreductase  25.97 
 
 		 197 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00494476 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  25.81 
 
 		 174 aa  53.1  0.000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2805  nitroreductase family protein  24.86 
 
 		 201 aa  52.8  0.000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.360066  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  23.53 
 
 		 176 aa  52.8  0.000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3612  nitroreductase family protein  24.86 
 
 		 201 aa  52.8  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0028  nitroreductase family protein  24.86 
 
 		 201 aa  52.8  0.000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.901836  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3601  nitroreductase family protein  24.86 
 
 		 201 aa  52.8  0.000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.735488  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3625  nitroreductase family protein  24.86 
 
 		 201 aa  52.8  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.159047  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3919  nitroreductase family protein  25.77 
 
 		 197 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1391  nitroreductase  25.97 
 
 		 197 aa  52  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1738  nitroreductase family protein  24.86 
 
 		 201 aa  52  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3172  nitroreductase family protein  24.86 
 
 		 201 aa  52  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2896  nitroreductase  25 
 
 		 207 aa  52  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.318005  normal  0.764115 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1513  nitroreductase  27.33 
 
 		 180 aa  52.4  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000744029 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2245  nitroreductase  25 
 
 		 197 aa  52.4  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24750  nitroreductase  23.53 
 
 		 176 aa  51.2  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0212  nitroreductase  22.16 
 
 		 184 aa  51.2  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.362808  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0046  nitroreductase  24.56 
 
 		 186 aa  51.2  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2367  nitroreductase family protein  23.98 
 
 		 215 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.130661  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2239  nitroreductase family protein  23.98 
 
 		 215 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.153685  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  24.57 
 
 		 188 aa  50.8  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2772  nitroreductase  22.53 
 
 		 200 aa  50.8  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4273  nitroreductase  24.74 
 
 		 199 aa  50.8  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3531  nitroreductase  23.98 
 
 		 197 aa  50.8  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.12812  normal  0.174487 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  25.31 
 
 		 194 aa  50.8  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2164  nitroreductase  21.74 
 
 		 190 aa  50.4  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  23.97 
 
 		 166 aa  50.4  0.00004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1363  nitroreductase family protein  28.25 
 
 		 169 aa  50.1  0.00005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2286  nitroreductase family protein  23.98 
 
 		 215 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.153669  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2038  nitroreductase family protein  25 
 
 		 215 aa  50.1  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119654  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  24.26 
 
 		 186 aa  49.7  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  24.69 
 
 		 194 aa  50.1  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3221  nitroreductase  22.62 
 
 		 198 aa  49.7  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0536  nitroreductase  22.84 
 
 		 172 aa  49.7  0.00007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.870767  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0664  nitroreductase  22.91 
 
 		 180 aa  49.7  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.237638  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4947  nitroreductase  23.53 
 
 		 203 aa  49.7  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.907105  normal  0.53209 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2684  nitroreductase  25.41 
 
 		 178 aa  49.3  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2101  nitroreductase family protein  23.47 
 
 		 215 aa  48.5  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.320716  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2040  nitroreductase family protein  23.47 
 
 		 215 aa  48.5  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0134367  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2257  nitroreductase family protein  23.47 
 
 		 215 aa  48.5  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.328438  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  22.58 
 
 		 190 aa  48.5  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1657  nitroreductase  24.75 
 
 		 215 aa  48.1  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0325303  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2080  nitroreductase  23.47 
 
 		 215 aa  48.1  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.123305  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  26 
 
 		 165 aa  47.8  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4899  nitroreductase  22.42 
 
 		 203 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.913687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2282  nitroreductase family protein  23.47 
 
 		 215 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.1661e-35 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0427  oxidoreductase  22.6 
 
 		 205 aa  47.4  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1472  nitroreductase  23.46 
 
 		 172 aa  47.4  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2166  nitroreductase  26.25 
 
 		 176 aa  47.8  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4435  nitroreductase  21.82 
 
 		 203 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.676369  normal  0.38334 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3085  nitroreductase family protein  23.59 
 
 		 215 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000156331 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0470  nitroreductase  29.68 
 
 		 171 aa  47.4  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1165  nitroreductase family protein  27.78 
 
 		 181 aa  47  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000313764  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0997  nitroreductase family protein  27.78 
 
 		 181 aa  47  0.0004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0119809  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2476  nitroreductase  24.86 
 
 		 195 aa  46.6  0.0006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1072  nitroreductase  24.68 
 
 		 251 aa  46.6  0.0006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000226333  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2000  nitroreductase  21.82 
 
 		 213 aa  46.6  0.0007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.578725  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1300  nitroreductase  23.38 
 
 		 197 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  20.81 
 
 		 167 aa  45.8  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1538  nitroreductase  21.71 
 
 		 203 aa  45.8  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.422269 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0739  nitroreductase  23.87 
 
 		 176 aa  45.4  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.033186  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1106  nitro/flavin reductase  25.14 
 
 		 248 aa  44.7  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000115125  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1448  hypothetical protein  25.49 
 
 		 176 aa  45.1  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.848866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0345  nitroreductase  20.5 
 
 		 212 aa  45.1  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0690  nitroreductase  21.74 
 
 		 246 aa  45.1  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0134674  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2730  nitroreductase  23.7 
 
 		 205 aa  45.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.796867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3947  nitroreductase  23.26 
 
 		 199 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  21.48 
 
 		 167 aa  44.3  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  25.7 
 
 		 179 aa  43.9  0.003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  22.44 
 
 		 176 aa  44.7  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  24.5 
 
 		 166 aa  44.3  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0657  nitroreductase family protein  22.83 
 
 		 201 aa  43.9  0.003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>