58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0061 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0061  nitroreductase  100 
 
 		 338 aa  694    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.259193 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2097  nitroreductase  34.43 
 
 		 334 aa  172  5.999999999999999e-42  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4002  hypothetical protein  30.54 
 
 		 867 aa  151  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2019  nitroreductase  30.99 
 
 		 340 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.997085  normal  0.966665 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2891  nitroreductase  29.07 
 
 		 340 aa  120  4.9999999999999996e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0731  nitroreductase-like protein  25.09 
 
 		 347 aa  119  7e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1605  nitroreductase  27.53 
 
 		 330 aa  108  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.690358  normal  0.842537 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2982  nitroreductase-like protein  22.7 
 
 		 363 aa  99.8  5e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  28.75 
 
 		 165 aa  63.5  0.000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  22.16 
 
 		 176 aa  63.5  0.000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1652  nitroreductase  24.7 
 
 		 171 aa  63.2  0.000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.177323  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1448  hypothetical protein  27.71 
 
 		 176 aa  58.5  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.848866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26390  nitroreductase  28.23 
 
 		 174 aa  56.6  0.0000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  23.5 
 
 		 183 aa  56.2  0.0000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24750  nitroreductase  24.67 
 
 		 176 aa  55.8  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0706  nitroreductase  25.16 
 
 		 168 aa  54.7  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.272775 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1660  nitroreductase  24.07 
 
 		 175 aa  53.9  0.000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.283139  normal  0.036754 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  25.6 
 
 		 174 aa  53.5  0.000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0218  nitroreductase  23.53 
 
 		 180 aa  53.1  0.000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0440  nitroreductase  33.33 
 
 		 201 aa  52.4  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.407872  normal  0.661672 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  26.4 
 
 		 188 aa  50.8  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0470  nitroreductase  23.49 
 
 		 171 aa  50.1  0.00006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  26.4 
 
 		 186 aa  49.7  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0649  nitroreductase  21.39 
 
 		 173 aa  49.3  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.535499  normal  0.149872 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3640  nitroreductase  33.87 
 
 		 245 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  23.86 
 
 		 186 aa  49.3  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  25.29 
 
 		 186 aa  48.5  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  25.71 
 
 		 163 aa  48.5  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0073  nitroreductase family protein  23.39 
 
 		 178 aa  48.5  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  24.24 
 
 		 176 aa  49.3  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1895  nitroreductase  25.66 
 
 		 191 aa  49.3  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0551  nitroreductase  22.38 
 
 		 321 aa  48.1  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3427  nitroreductase  25.62 
 
 		 213 aa  47.8  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0509  nitroreductase  20.61 
 
 		 181 aa  47.4  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  25.29 
 
 		 167 aa  47  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0537  nitroreductase  21.68 
 
 		 321 aa  47.4  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1408  nitroreductase  23.72 
 
 		 217 aa  47  0.0005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0797  nitroreductase family protein  29.59 
 
 		 270 aa  46.6  0.0006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0323416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2247  nitroreductase  25.67 
 
 		 209 aa  46.2  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.200242  normal  0.163117 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  23.56 
 
 		 184 aa  46.2  0.0009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_585  nitroreductase  26.03 
 
 		 169 aa  45.8  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.179153  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4783  nitroreductase  24.88 
 
 		 217 aa  45.4  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0866516 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  25.61 
 
 		 169 aa  45.4  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0153  nitroreductase  28.29 
 
 		 174 aa  45.8  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027489  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0777  nitroreductase  37.5 
 
 		 275 aa  45.8  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0136069  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1083  nitroreductase  23.12 
 
 		 175 aa  45.1  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000705077  normal  0.264169 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0536  nitroreductase  20.13 
 
 		 172 aa  45.1  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.870767  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  21.82 
 
 		 187 aa  45.1  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  22.37 
 
 		 174 aa  45.1  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  24.26 
 
 		 167 aa  44.7  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0804  nitroreductase  34.33 
 
 		 270 aa  44.3  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00112064  normal  0.983564 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1862  nitroreductase  21.15 
 
 		 197 aa  43.9  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2684  nitroreductase  22.04 
 
 		 178 aa  43.5  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0212  nitroreductase  32.73 
 
 		 184 aa  43.1  0.006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.362808  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  22.95 
 
 		 190 aa  43.1  0.006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0182  NADH dehydrogenase  37.04 
 
 		 206 aa  42.7  0.008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1230  nitroreductase  35.71 
 
 		 248 aa  42.7  0.009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1391  nitroreductase  26.11 
 
 		 197 aa  42.4  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>