210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2982 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_2982  nitroreductase-like protein  100 
 
 		 363 aa  753    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0731  nitroreductase-like protein  31.96 
 
 		 347 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1605  nitroreductase  27.62 
 
 		 330 aa  102  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.690358  normal  0.842537 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0061  nitroreductase  22.7 
 
 		 338 aa  99.8  6e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.259193 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4002  hypothetical protein  26.02 
 
 		 867 aa  93.2  7e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2019  nitroreductase  30.19 
 
 		 340 aa  84.3  0.000000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.997085  normal  0.966665 
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  32.96 
 
 		 183 aa  78.6  0.0000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2891  nitroreductase  32.32 
 
 		 340 aa  73.6  0.000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1513  nitroreductase  30.36 
 
 		 180 aa  72.8  0.000000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000744029 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1652  nitroreductase  36.05 
 
 		 171 aa  68.6  0.0000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.177323  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  30.2 
 
 		 170 aa  67.8  0.0000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  32.89 
 
 		 174 aa  67  0.0000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0509  nitroreductase  29.45 
 
 		 181 aa  66.6  0.0000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3075  nitroreductase family protein  27 
 
 		 212 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.1167  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2097  nitroreductase  23.31 
 
 		 334 aa  65.9  0.000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2827  nitroreductase  26.63 
 
 		 212 aa  65.9  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.374853  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3070  nitroreductase family protein  26.5 
 
 		 212 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.511917  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2761  NAD(P)H nitroreductase  27 
 
 		 212 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2798  NAD(P)H nitroreductase  27 
 
 		 212 aa  64.3  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  33.78 
 
 		 176 aa  64.7  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3031  NAD  27 
 
 		 212 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3226  nitroreductase  27.81 
 
 		 187 aa  63.9  0.000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.236693  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2206  nitroreductase family protein  26.5 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00142362  hitchhiker  5.10468e-16 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3044  nitroreductase  26.5 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1165  nitroreductase family protein  31.9 
 
 		 181 aa  63.2  0.000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000313764  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0997  nitroreductase family protein  31.9 
 
 		 181 aa  63.2  0.000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0119809  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1625  nitroreductase  27.85 
 
 		 176 aa  62.4  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0106837  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0579  nitroreductase  34.48 
 
 		 173 aa  62.4  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1660  nitroreductase  30.86 
 
 		 175 aa  62.4  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.283139  normal  0.036754 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3002  nitroreductase  27.56 
 
 		 195 aa  60.5  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.454313  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0212  nitroreductase  26.95 
 
 		 184 aa  59.3  0.0000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.362808  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  28.22 
 
 		 168 aa  59.3  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2105  nitroreductase  32.74 
 
 		 176 aa  58.9  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.892838  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  26.98 
 
 		 176 aa  58.5  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1200  nitroreductase  24.62 
 
 		 188 aa  58.2  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0046  nitroreductase  28.21 
 
 		 186 aa  58.2  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1997  nitroreductase  27.38 
 
 		 182 aa  58.2  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0291646  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2239  nitroreductase  25.73 
 
 		 239 aa  58.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.404063  hitchhiker  0.0000304556 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0218  nitroreductase  33.05 
 
 		 180 aa  57.8  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0470  nitroreductase  29.53 
 
 		 171 aa  57.8  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0551  nitroreductase  28.65 
 
 		 321 aa  57  0.0000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  29.66 
 
 		 165 aa  57  0.0000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0739  nitroreductase  29.11 
 
 		 176 aa  57  0.0000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.033186  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0115  nitroreductase  28.9 
 
 		 274 aa  56.2  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00205311  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  29.55 
 
 		 190 aa  56.6  0.0000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24750  nitroreductase  26.45 
 
 		 176 aa  55.8  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2975  nitroreductase  29.94 
 
 		 169 aa  56.2  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.522963 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0537  nitroreductase  29.19 
 
 		 321 aa  56.2  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1916  nitroreductase  26.09 
 
 		 223 aa  54.7  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.385267 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0154  putative nitroreductase  27.27 
 
 		 204 aa  55.1  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2166  nitroreductase  28.39 
 
 		 176 aa  55.1  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1136  nitroreductase  26.74 
 
 		 200 aa  54.7  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.710664  normal  0.0578189 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_585  nitroreductase  29.05 
 
 		 169 aa  54.3  0.000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.179153  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  27.81 
 
 		 186 aa  54.3  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18320  nitroreductase  29.49 
 
 		 174 aa  54.3  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0660  nitroreductase family protein  30.77 
 
 		 184 aa  53.9  0.000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.799475 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0617  nitroreductase  27.59 
 
 		 169 aa  53.5  0.000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.146729  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1167  nitroreductase  33.13 
 
 		 174 aa  53.5  0.000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1605  NADPH-flavin oxidoreductase  26.85 
 
 		 169 aa  53.5  0.000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0073  nitroreductase family protein  28.07 
 
 		 178 aa  53.5  0.000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1220  nitroreductase family protein  30.65 
 
 		 200 aa  53.1  0.000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.168432  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1011  nitroreductase  29.56 
 
 		 329 aa  53.1  0.000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  28.48 
 
 		 186 aa  53.1  0.000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3107  nitroreductase  26.73 
 
 		 211 aa  52.8  0.000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100184  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3676  nitroreductase family protein  24.24 
 
 		 205 aa  52.8  0.000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0329631  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0536  nitroreductase  27.63 
 
 		 172 aa  52.8  0.000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.870767  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2286  nitroreductase family protein  27.59 
 
 		 215 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.153669  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2101  nitroreductase family protein  26.6 
 
 		 215 aa  52.4  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.320716  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2040  nitroreductase family protein  26.6 
 
 		 215 aa  52.4  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0134367  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1720  nitroreductase  23.63 
 
 		 196 aa  52.8  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1518  nitroreductase  26.42 
 
 		 170 aa  52.4  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2257  nitroreductase family protein  26.6 
 
 		 215 aa  52.4  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.328438  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0846  nitroreductase  27.1 
 
 		 169 aa  52.4  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.245537  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1294  nitroreductase  28.08 
 
 		 167 aa  52.8  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0670007  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1862  nitroreductase  26.82 
 
 		 197 aa  52  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0809  nitroreductase  34.16 
 
 		 169 aa  52  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.177891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2282  nitroreductase family protein  26.6 
 
 		 215 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.1661e-35 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2367  nitroreductase family protein  27.59 
 
 		 215 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.130661  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1083  nitroreductase  24.85 
 
 		 175 aa  52.4  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000705077  normal  0.264169 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2855  nitroreductase  29.02 
 
 		 191 aa  52.4  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1204  nitroreductase  36.49 
 
 		 174 aa  51.2  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.460953  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3955  nitroreductase family protein  24.23 
 
 		 205 aa  51.6  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00205855  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3801  nitroreductase family protein  24.23 
 
 		 205 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000117971  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1024  nitroreductase  27.57 
 
 		 213 aa  52  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4783  nitroreductase  26.19 
 
 		 217 aa  51.2  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0866516 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  25.95 
 
 		 176 aa  52  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1568  nitroreductase  26.79 
 
 		 191 aa  51.6  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4264  nitroreductase family protein  24.23 
 
 		 205 aa  51.6  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.17491  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4232  nitroreductase  28.16 
 
 		 214 aa  52  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  30.06 
 
 		 192 aa  51.6  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3085  nitroreductase family protein  27.59 
 
 		 215 aa  52  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000156331 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1563  nitroreductase  24.31 
 
 		 173 aa  51.6  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0144  nitroreductase  28.66 
 
 		 184 aa  51.6  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  27.89 
 
 		 166 aa  52  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0645  nitroreductase family protein  29.05 
 
 		 171 aa  51.2  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0679  nitroreductase family protein  29.05 
 
 		 171 aa  51.2  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2738  nitroreductase  30.07 
 
 		 170 aa  51.2  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0709  nitroreductase  30.43 
 
 		 215 aa  50.8  0.00004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2373  nitroreductase  31.86 
 
 		 172 aa  50.4  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00327904  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  28.77 
 
 		 166 aa  50.4  0.00005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>