150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4435 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_4435  nitroreductase  100 
 
 		 203 aa  414  9.999999999999999e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.676369  normal  0.38334 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4899  nitroreductase  99.01 
 
 		 203 aa  412  1e-114  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.913687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4947  nitroreductase  87.13 
 
 		 203 aa  365  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.907105  normal  0.53209 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4328  nitroreductase  71.35 
 
 		 199 aa  285  2e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.59961  normal  0.455501 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1159  nitroreductase  63.96 
 
 		 199 aa  258  4e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.250977  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2200  nitroreductase  62.94 
 
 		 199 aa  254  4e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0875675  normal  0.438667 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2772  nitroreductase  53.12 
 
 		 200 aa  196  2.0000000000000003e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3221  nitroreductase  48.45 
 
 		 198 aa  191  6e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5063  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  48.96 
 
 		 199 aa  187  1e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.772676  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1442  nitroreductase  48.68 
 
 		 195 aa  185  3e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2245  nitroreductase  47.92 
 
 		 197 aa  181  6e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3947  nitroreductase  45.64 
 
 		 199 aa  179  4e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1571  nitroreductase  46.67 
 
 		 199 aa  178  4e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.160224  normal  0.163104 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1391  nitroreductase  46.84 
 
 		 197 aa  176  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4273  nitroreductase  44.62 
 
 		 199 aa  175  4e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0014  nitroreductase family protein  46.15 
 
 		 198 aa  173  1.9999999999999998e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2397  nitroreductase  45.74 
 
 		 205 aa  170  2e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4588  nitroreductase  44.74 
 
 		 197 aa  169  3e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1300  nitroreductase  44.74 
 
 		 197 aa  169  3e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4118  nitroreductase  44.74 
 
 		 197 aa  169  4e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3919  nitroreductase family protein  44.21 
 
 		 197 aa  167  8e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1566  nitroreductase  43.16 
 
 		 197 aa  165  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00494476 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3177  putative NADH dehydrogenase/NAD(P)H nitroreductase  45.54 
 
 		 204 aa  165  5e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.999951  normal  0.135022 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1538  nitroreductase  46.32 
 
 		 203 aa  164  5.9999999999999996e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.422269 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0111  putative nitroreductase  43.08 
 
 		 198 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1659  nitroreductase  48.95 
 
 		 233 aa  159  3e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00583847  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3146  nitroreductase  40.86 
 
 		 200 aa  154  6e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1636  nitroreductase  45.5 
 
 		 192 aa  152  2e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0000151333  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1732  nitroreductase  48.42 
 
 		 209 aa  152  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.639581  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2215  nitroreductase  47.89 
 
 		 209 aa  152  4e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0324809  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4639  nitroreductase  42.63 
 
 		 189 aa  151  5.9999999999999996e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.564298  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3370  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  38.27 
 
 		 199 aa  150  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0510232  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0150  hypothetical protein  47.49 
 
 		 214 aa  147  8e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.197759  normal  0.577731 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0345  nitroreductase  37.76 
 
 		 212 aa  121  7e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0289  nitroreductase  36.41 
 
 		 190 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3562  nitroreductase  35.71 
 
 		 200 aa  116  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10883  Nitroreductase  35.29 
 
 		 197 aa  116  1.9999999999999998e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3075  nitroreductase  32.98 
 
 		 198 aa  109  3e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2095  nitroreductase family protein  33.71 
 
 		 189 aa  109  3e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2730  nitroreductase  36.36 
 
 		 205 aa  104  7e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.796867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2000  nitroreductase  36.08 
 
 		 213 aa  103  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.578725  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0427  oxidoreductase  35.68 
 
 		 205 aa  102  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3531  nitroreductase  36.22 
 
 		 197 aa  101  7e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.12812  normal  0.174487 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0215  nitroreductase  37.43 
 
 		 210 aa  99  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3589  nitroreductase  32.98 
 
 		 201 aa  97.4  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2604  nitroreductase  32.46 
 
 		 201 aa  97.1  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.759207  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0501  nitroreductase  32.46 
 
 		 201 aa  97.1  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0406  nitroreductase  32.43 
 
 		 201 aa  96.7  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.699033  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0474  nitroreductase  32.46 
 
 		 201 aa  96.7  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.573695 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0432  nitroreductase  32.43 
 
 		 201 aa  96.7  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.181342  normal  0.330733 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2805  nitroreductase family protein  34.07 
 
 		 201 aa  95.5  4e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.360066  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3612  nitroreductase family protein  34.07 
 
 		 201 aa  95.5  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0028  nitroreductase family protein  34.07 
 
 		 201 aa  95.5  4e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.901836  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1738  nitroreductase family protein  34.07 
 
 		 201 aa  95.5  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3601  nitroreductase family protein  34.07 
 
 		 201 aa  95.5  4e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.735488  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3625  nitroreductase family protein  34.07 
 
 		 201 aa  95.5  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.159047  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3172  nitroreductase family protein  34.07 
 
 		 201 aa  95.5  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2267  nitroreductase family protein, putative  34.9 
 
 		 203 aa  95.5  5e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2102  nitroreductase  33.33 
 
 		 200 aa  95.5  5e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4890  nitroreductase  35.16 
 
 		 199 aa  95.1  6e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4979  nitroreductase  35.16 
 
 		 199 aa  95.1  6e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2261  nitroreductase  32.97 
 
 		 201 aa  94  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.746283  normal  0.134626 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5258  nitroreductase  35.16 
 
 		 199 aa  94  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.656936 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2896  nitroreductase  32.43 
 
 		 207 aa  94.4  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.318005  normal  0.764115 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2404  nitroreductase  38.1 
 
 		 151 aa  93.2  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2938  nitroreductase family protein  33.52 
 
 		 201 aa  93.6  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5012  nitroreductase  31.43 
 
 		 191 aa  92.4  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0181044  hitchhiker  0.00444875 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5505  nitroreductase  32.46 
 
 		 194 aa  90.1  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0533827 
 
 
-
 
NC_002978  WD1207  nitroreductase family protein  28.82 
 
 		 195 aa  85.1  6e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2838  nitroreductase  28.57 
 
 		 223 aa  85.1  6e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4613  nitroreductase  33.33 
 
 		 214 aa  84.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.250865 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36390  nitroreductase  33.15 
 
 		 199 aa  82.8  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0589  nitroreductase  30.56 
 
 		 192 aa  82.8  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1303  nitroreductase  30.56 
 
 		 199 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.805588 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1829  nitroreductase  31.55 
 
 		 200 aa  77  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00202262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0264  nitroreductase  31.13 
 
 		 187 aa  75.9  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.284109  hitchhiker  0.00114487 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0491  nitroreductase  29.26 
 
 		 315 aa  74.3  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.807689 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0458  nitroreductase  30.11 
 
 		 195 aa  73.9  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.348313  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1639  nitroreductase  27.42 
 
 		 184 aa  71.2  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0225  nitroreductase  30.6 
 
 		 200 aa  67  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.936652  normal  0.851937 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0537  nitroreductase  27.91 
 
 		 321 aa  65.9  0.0000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0551  nitroreductase  27.91 
 
 		 321 aa  65.9  0.0000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1513  nitroreductase  28.86 
 
 		 180 aa  62.4  0.000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000744029 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  22.8 
 
 		 177 aa  60.8  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  29.45 
 
 		 163 aa  59.3  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15950  nitroreductase  25.32 
 
 		 188 aa  58.9  0.00000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2852  nitroreductase  40 
 
 		 178 aa  58.2  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1165  nitroreductase family protein  27.34 
 
 		 181 aa  53.1  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000313764  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0997  nitroreductase family protein  27.34 
 
 		 181 aa  53.1  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0119809  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0545  nitroreductase  31.09 
 
 		 172 aa  52.4  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.361368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0509  nitroreductase  24.86 
 
 		 181 aa  51.6  0.000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0189  nitroreductase  21.59 
 
 		 203 aa  50.8  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  26.88 
 
 		 176 aa  51.2  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  25.32 
 
 		 179 aa  50.4  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  25.17 
 
 		 168 aa  50.4  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0057  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.62 
 
 		 330 aa  50.1  0.00003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0221  nitroreductase  22.34 
 
 		 180 aa  49.3  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.602782  normal  0.0189765 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  43.14 
 
 		 170 aa  49.3  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1868  nitroreductase  26.67 
 
 		 208 aa  48.5  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.047997  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1209  nitroreductase family protein  22.56 
 
 		 201 aa  48.5  0.00007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0494654  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>