164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4639 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4639  nitroreductase  100 
 
 		 189 aa  376  1e-104  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.564298  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5063  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  50.52 
 
 		 199 aa  199  3e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.772676  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2772  nitroreductase  49.47 
 
 		 200 aa  193  1e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3221  nitroreductase  48.45 
 
 		 198 aa  190  1e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1442  nitroreductase  49.46 
 
 		 195 aa  185  4e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0014  nitroreductase family protein  48.42 
 
 		 198 aa  183  1.0000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1571  nitroreductase  47.89 
 
 		 199 aa  183  1.0000000000000001e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.160224  normal  0.163104 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3919  nitroreductase family protein  46.07 
 
 		 197 aa  179  2e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1566  nitroreductase  46.07 
 
 		 197 aa  179  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00494476 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3947  nitroreductase  47.12 
 
 		 199 aa  179  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4273  nitroreductase  46.88 
 
 		 199 aa  177  5.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2397  nitroreductase  47.85 
 
 		 205 aa  177  1e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0111  putative nitroreductase  46.84 
 
 		 198 aa  175  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1300  nitroreductase  44.5 
 
 		 197 aa  173  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4588  nitroreductase  44.5 
 
 		 197 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4118  nitroreductase  44.5 
 
 		 197 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1391  nitroreductase  44.21 
 
 		 197 aa  171  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1636  nitroreductase  50 
 
 		 192 aa  167  7e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0000151333  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2200  nitroreductase  47.34 
 
 		 199 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0875675  normal  0.438667 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2245  nitroreductase  46.32 
 
 		 197 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1159  nitroreductase  47.34 
 
 		 199 aa  160  9e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.250977  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1538  nitroreductase  40.93 
 
 		 203 aa  159  3e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.422269 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3177  putative NADH dehydrogenase/NAD(P)H nitroreductase  43.75 
 
 		 204 aa  158  4e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.999951  normal  0.135022 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3146  nitroreductase  41.58 
 
 		 200 aa  157  6e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4947  nitroreductase  42.55 
 
 		 203 aa  153  1e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.907105  normal  0.53209 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0289  nitroreductase  45.74 
 
 		 190 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4899  nitroreductase  42.11 
 
 		 203 aa  151  4e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.913687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4435  nitroreductase  42.63 
 
 		 203 aa  151  5e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.676369  normal  0.38334 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4328  nitroreductase  43.62 
 
 		 199 aa  150  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.59961  normal  0.455501 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3370  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  40.53 
 
 		 199 aa  150  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0510232  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1659  nitroreductase  46.35 
 
 		 233 aa  142  2e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00583847  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0150  hypothetical protein  48.09 
 
 		 214 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.197759  normal  0.577731 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1732  nitroreductase  45.83 
 
 		 209 aa  135  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.639581  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0345  nitroreductase  41.62 
 
 		 212 aa  133  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2215  nitroreductase  43.75 
 
 		 209 aa  130  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0324809  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3562  nitroreductase  36.81 
 
 		 200 aa  125  3e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3075  nitroreductase  39.78 
 
 		 198 aa  125  4.0000000000000003e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0406  nitroreductase  41.3 
 
 		 201 aa  125  5e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.699033  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2730  nitroreductase  39.27 
 
 		 205 aa  124  6e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.796867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0432  nitroreductase  40.76 
 
 		 201 aa  122  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.181342  normal  0.330733 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10883  Nitroreductase  35.29 
 
 		 197 aa  121  6e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2938  nitroreductase family protein  38.8 
 
 		 201 aa  120  9e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2000  nitroreductase  38.38 
 
 		 213 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.578725  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2896  nitroreductase  39.13 
 
 		 207 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.318005  normal  0.764115 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3589  nitroreductase  39.46 
 
 		 201 aa  117  9e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0427  oxidoreductase  37.7 
 
 		 205 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2604  nitroreductase  38.59 
 
 		 201 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.759207  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0501  nitroreductase  38.59 
 
 		 201 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3531  nitroreductase  37.17 
 
 		 197 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.12812  normal  0.174487 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2805  nitroreductase family protein  37.7 
 
 		 201 aa  115  3e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.360066  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3612  nitroreductase family protein  37.7 
 
 		 201 aa  115  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0028  nitroreductase family protein  37.7 
 
 		 201 aa  115  3e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.901836  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3601  nitroreductase family protein  37.7 
 
 		 201 aa  115  3e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.735488  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3625  nitroreductase family protein  37.7 
 
 		 201 aa  115  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.159047  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2261  nitroreductase  40.94 
 
 		 201 aa  115  3e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.746283  normal  0.134626 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0474  nitroreductase  37.5 
 
 		 201 aa  114  6e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.573695 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1738  nitroreductase family protein  37.16 
 
 		 201 aa  114  6e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3172  nitroreductase family protein  37.16 
 
 		 201 aa  114  6e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2838  nitroreductase  36.9 
 
 		 223 aa  114  7.999999999999999e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0215  nitroreductase  41.81 
 
 		 210 aa  109  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2102  nitroreductase  35.83 
 
 		 200 aa  107  8.000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0491  nitroreductase  36.51 
 
 		 315 aa  101  7e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.807689 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36390  nitroreductase  37.23 
 
 		 199 aa  101  7e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4613  nitroreductase  38.67 
 
 		 214 aa  101  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.250865 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1829  nitroreductase  35.68 
 
 		 200 aa  98.6  5e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00202262  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2267  nitroreductase family protein, putative  40.13 
 
 		 203 aa  97.1  1e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1207  nitroreductase family protein  34.39 
 
 		 195 aa  95.5  4e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0264  nitroreductase  36.59 
 
 		 187 aa  95.5  4e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.284109  hitchhiker  0.00114487 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5012  nitroreductase  33.33 
 
 		 191 aa  95.1  5e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0181044  hitchhiker  0.00444875 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5258  nitroreductase  39.18 
 
 		 199 aa  94  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.656936 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4890  nitroreductase  38.6 
 
 		 199 aa  93.6  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4979  nitroreductase  38.6 
 
 		 199 aa  93.6  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5505  nitroreductase  36.02 
 
 		 194 aa  92.8  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0533827 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0458  nitroreductase  34.07 
 
 		 195 aa  87.4  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.348313  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2095  nitroreductase family protein  31.87 
 
 		 189 aa  87  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0551  nitroreductase  33.53 
 
 		 321 aa  84  0.000000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0537  nitroreductase  32.94 
 
 		 321 aa  82.8  0.000000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0225  nitroreductase  35.98 
 
 		 200 aa  82.4  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.936652  normal  0.851937 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2404  nitroreductase  37.06 
 
 		 151 aa  80.1  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15950  nitroreductase  31.07 
 
 		 188 aa  79  0.00000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1303  nitroreductase  34.32 
 
 		 199 aa  77.8  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.805588 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0057  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.12 
 
 		 330 aa  71.2  0.000000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1639  nitroreductase  30.12 
 
 		 184 aa  71.2  0.000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  30.52 
 
 		 163 aa  64.3  0.0000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0589  nitroreductase  30.89 
 
 		 192 aa  58.2  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24750  nitroreductase  29.52 
 
 		 176 aa  57  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  24.46 
 
 		 177 aa  57  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0664  nitroreductase  25.61 
 
 		 180 aa  57  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.237638  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  28.95 
 
 		 174 aa  53.5  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1679  nitroreductase  35.29 
 
 		 199 aa  52.8  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  26.8 
 
 		 170 aa  52.4  0.000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1513  nitroreductase  26.38 
 
 		 180 aa  52.4  0.000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000744029 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  25.54 
 
 		 190 aa  52  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2187  nitroreductase  24.53 
 
 		 173 aa  52  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.530109 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0221  nitroreductase  24.6 
 
 		 180 aa  51.6  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.602782  normal  0.0189765 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0509  nitroreductase  28.49 
 
 		 181 aa  51.6  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0694  nitroreductase  25.71 
 
 		 183 aa  51.2  0.000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.402157  unclonable  1.19991e-19 
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  28.4 
 
 		 183 aa  51.2  0.000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  29.28 
 
 		 178 aa  50.8  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0920  nitroreductase  29.76 
 
 		 202 aa  49.3  0.00003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>