229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2245 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2245  nitroreductase  100 
 
 		 197 aa  398  9.999999999999999e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1571  nitroreductase  68.75 
 
 		 199 aa  272  2.0000000000000002e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.160224  normal  0.163104 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2772  nitroreductase  57.22 
 
 		 200 aa  232  3e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5063  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  55.96 
 
 		 199 aa  216  2e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.772676  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1566  nitroreductase  54.92 
 
 		 197 aa  214  5e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00494476 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3919  nitroreductase family protein  54.92 
 
 		 197 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1391  nitroreductase  55.21 
 
 		 197 aa  212  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3221  nitroreductase  54.92 
 
 		 198 aa  202  2e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0014  nitroreductase family protein  53.37 
 
 		 198 aa  200  9e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2200  nitroreductase  53.89 
 
 		 199 aa  200  9.999999999999999e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0875675  normal  0.438667 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3370  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  50.52 
 
 		 199 aa  200  9.999999999999999e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0510232  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0111  putative nitroreductase  52.33 
 
 		 198 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3177  putative NADH dehydrogenase/NAD(P)H nitroreductase  51.81 
 
 		 204 aa  199  3e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.999951  normal  0.135022 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1300  nitroreductase  52.08 
 
 		 197 aa  197  7e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1442  nitroreductase  51.81 
 
 		 195 aa  197  7e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4118  nitroreductase  52.08 
 
 		 197 aa  197  7.999999999999999e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4588  nitroreductase  52.08 
 
 		 197 aa  197  9e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3947  nitroreductase  49.74 
 
 		 199 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1159  nitroreductase  52.85 
 
 		 199 aa  195  3e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.250977  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1538  nitroreductase  49.48 
 
 		 203 aa  190  9e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.422269 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4273  nitroreductase  48.19 
 
 		 199 aa  187  8e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4947  nitroreductase  49.48 
 
 		 203 aa  186  3e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.907105  normal  0.53209 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4899  nitroreductase  48.96 
 
 		 203 aa  183  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.913687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1659  nitroreductase  52.08 
 
 		 233 aa  182  3e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00583847  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4435  nitroreductase  47.92 
 
 		 203 aa  181  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.676369  normal  0.38334 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2397  nitroreductase  47.89 
 
 		 205 aa  178  4e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2215  nitroreductase  52.6 
 
 		 209 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0324809  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3146  nitroreductase  44.79 
 
 		 200 aa  172  2.9999999999999996e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1732  nitroreductase  52.11 
 
 		 209 aa  170  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.639581  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4328  nitroreductase  45.83 
 
 		 199 aa  163  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.59961  normal  0.455501 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4639  nitroreductase  46.32 
 
 		 189 aa  162  3e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.564298  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0150  hypothetical protein  47.8 
 
 		 214 aa  154  7e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.197759  normal  0.577731 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0345  nitroreductase  44.74 
 
 		 212 aa  151  5e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0289  nitroreductase  42.86 
 
 		 190 aa  140  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1636  nitroreductase  47.75 
 
 		 192 aa  139  1.9999999999999998e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0000151333  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2095  nitroreductase family protein  40.98 
 
 		 189 aa  131  6e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2000  nitroreductase  40 
 
 		 213 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.578725  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3075  nitroreductase  42.93 
 
 		 198 aa  124  1e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5012  nitroreductase  39.78 
 
 		 191 aa  122  4e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0181044  hitchhiker  0.00444875 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2730  nitroreductase  38.81 
 
 		 205 aa  119  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.796867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3562  nitroreductase  35 
 
 		 200 aa  119  3e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2896  nitroreductase  40.64 
 
 		 207 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.318005  normal  0.764115 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0432  nitroreductase  41.18 
 
 		 201 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.181342  normal  0.330733 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4613  nitroreductase  40.41 
 
 		 214 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.250865 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2102  nitroreductase  36.13 
 
 		 200 aa  114  1.0000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0215  nitroreductase  41.3 
 
 		 210 aa  112  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2261  nitroreductase  38.66 
 
 		 201 aa  113  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.746283  normal  0.134626 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0406  nitroreductase  40.64 
 
 		 201 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.699033  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10883  Nitroreductase  35.26 
 
 		 197 aa  112  2.0000000000000002e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0474  nitroreductase  39.36 
 
 		 201 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.573695 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2267  nitroreductase family protein, putative  37.06 
 
 		 203 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1738  nitroreductase family protein  38.5 
 
 		 201 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3172  nitroreductase family protein  38.5 
 
 		 201 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2805  nitroreductase family protein  38.5 
 
 		 201 aa  108  5e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.360066  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3612  nitroreductase family protein  38.5 
 
 		 201 aa  108  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2604  nitroreductase  38.3 
 
 		 201 aa  108  5e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.759207  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0501  nitroreductase  38.3 
 
 		 201 aa  108  5e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0028  nitroreductase family protein  38.5 
 
 		 201 aa  108  5e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.901836  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3601  nitroreductase family protein  38.5 
 
 		 201 aa  108  5e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.735488  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3625  nitroreductase family protein  38.5 
 
 		 201 aa  108  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.159047  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2938  nitroreductase family protein  38.5 
 
 		 201 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3589  nitroreductase  38.5 
 
 		 201 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0427  oxidoreductase  35.64 
 
 		 205 aa  105  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3531  nitroreductase  35.64 
 
 		 197 aa  104  8e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.12812  normal  0.174487 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0458  nitroreductase  32.62 
 
 		 195 aa  99.4  3e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.348313  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0491  nitroreductase  34.39 
 
 		 315 aa  98.2  7e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.807689 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5505  nitroreductase  34.95 
 
 		 194 aa  97.1  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0533827 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36390  nitroreductase  35.11 
 
 		 199 aa  93.6  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0264  nitroreductase  35.67 
 
 		 187 aa  92.8  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.284109  hitchhiker  0.00114487 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2404  nitroreductase  36.69 
 
 		 151 aa  92.8  3e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4890  nitroreductase  33.85 
 
 		 199 aa  92  5e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4979  nitroreductase  33.85 
 
 		 199 aa  92  5e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5258  nitroreductase  34.38 
 
 		 199 aa  92  5e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.656936 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2838  nitroreductase  30.89 
 
 		 223 aa  90.1  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0225  nitroreductase  37.78 
 
 		 200 aa  87.8  8e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.936652  normal  0.851937 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1303  nitroreductase  32.95 
 
 		 199 aa  87.4  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.805588 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0551  nitroreductase  33.92 
 
 		 321 aa  86.7  2e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0537  nitroreductase  33.92 
 
 		 321 aa  86.3  2e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1207  nitroreductase family protein  31.76 
 
 		 195 aa  84  0.000000000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1829  nitroreductase  30.89 
 
 		 200 aa  81.6  0.000000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00202262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0057  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.73 
 
 		 330 aa  75.5  0.0000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1639  nitroreductase  27.66 
 
 		 184 aa  72.8  0.000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1513  nitroreductase  33.77 
 
 		 180 aa  68.9  0.00000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000744029 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0153  nitroreductase  31.29 
 
 		 174 aa  67.8  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027489  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15950  nitroreductase  27.66 
 
 		 188 aa  66.6  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  27.72 
 
 		 177 aa  63.5  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  30.32 
 
 		 174 aa  63.5  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0509  nitroreductase  31.61 
 
 		 181 aa  62  0.000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0528  NADH dehydrogenase  30.05 
 
 		 206 aa  62  0.000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.688745 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0589  nitroreductase  28.99 
 
 		 192 aa  61.6  0.000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  29.93 
 
 		 163 aa  61.6  0.000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0221  nitroreductase  28.72 
 
 		 180 aa  60.1  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.602782  normal  0.0189765 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0212  nitroreductase  29.48 
 
 		 184 aa  60.5  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.362808  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4824  NADH dehydrogenase  28.49 
 
 		 208 aa  59.3  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0664  nitroreductase  26.19 
 
 		 180 aa  58.9  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.237638  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0073  nitroreductase family protein  32.85 
 
 		 178 aa  57.4  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  27.81 
 
 		 170 aa  57.4  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  27.39 
 
 		 170 aa  56.6  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0545  nitroreductase  34.18 
 
 		 172 aa  57  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.361368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1072  nitroreductase  28.68 
 
 		 251 aa  56.2  0.0000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000226333  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>