289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0345 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0345  nitroreductase  100 
 
 		 212 aa  433  1e-120  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1566  nitroreductase  47.54 
 
 		 197 aa  168  7e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00494476 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1538  nitroreductase  46.81 
 
 		 203 aa  164  9e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.422269 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3919  nitroreductase family protein  46.45 
 
 		 197 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1391  nitroreductase  46.15 
 
 		 197 aa  160  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4588  nitroreductase  45.05 
 
 		 197 aa  157  9e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0014  nitroreductase family protein  45.21 
 
 		 198 aa  157  9e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1300  nitroreductase  45.05 
 
 		 197 aa  157  1e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4118  nitroreductase  44.51 
 
 		 197 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3146  nitroreductase  40.31 
 
 		 200 aa  152  2.9999999999999998e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3221  nitroreductase  44.39 
 
 		 198 aa  152  4e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2245  nitroreductase  44.74 
 
 		 197 aa  151  5.9999999999999996e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3177  putative NADH dehydrogenase/NAD(P)H nitroreductase  44.62 
 
 		 204 aa  151  5.9999999999999996e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.999951  normal  0.135022 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3370  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  44.26 
 
 		 199 aa  150  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0510232  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0111  putative nitroreductase  41.67 
 
 		 198 aa  149  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4273  nitroreductase  41.27 
 
 		 199 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3947  nitroreductase  42.86 
 
 		 199 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5063  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  42.33 
 
 		 199 aa  142  3e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.772676  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2772  nitroreductase  39.89 
 
 		 200 aa  142  5e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1442  nitroreductase  42.7 
 
 		 195 aa  140  9.999999999999999e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1636  nitroreductase  44.97 
 
 		 192 aa  139  3e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0000151333  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1571  nitroreductase  40.96 
 
 		 199 aa  139  3e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.160224  normal  0.163104 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0289  nitroreductase  44.09 
 
 		 190 aa  138  7e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2397  nitroreductase  42.39 
 
 		 205 aa  135  4e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2200  nitroreductase  41.18 
 
 		 199 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0875675  normal  0.438667 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4639  nitroreductase  41.62 
 
 		 189 aa  133  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.564298  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1159  nitroreductase  40.11 
 
 		 199 aa  132  5e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.250977  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4328  nitroreductase  40 
 
 		 199 aa  131  6e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.59961  normal  0.455501 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1659  nitroreductase  47.34 
 
 		 233 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00583847  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4899  nitroreductase  37.76 
 
 		 203 aa  122  3e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.913687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4435  nitroreductase  37.76 
 
 		 203 aa  121  8e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.676369  normal  0.38334 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4947  nitroreductase  37.77 
 
 		 203 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.907105  normal  0.53209 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2102  nitroreductase  39.16 
 
 		 200 aa  119  3e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0150  hypothetical protein  43.58 
 
 		 214 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.197759  normal  0.577731 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2938  nitroreductase family protein  41.3 
 
 		 201 aa  116  3e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3601  nitroreductase family protein  41.3 
 
 		 201 aa  115  6e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.735488  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3625  nitroreductase family protein  41.3 
 
 		 201 aa  115  6e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.159047  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2805  nitroreductase family protein  41.3 
 
 		 201 aa  115  6e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.360066  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3612  nitroreductase family protein  41.3 
 
 		 201 aa  115  6e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0028  nitroreductase family protein  41.3 
 
 		 201 aa  115  6e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.901836  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1738  nitroreductase family protein  41.3 
 
 		 201 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3172  nitroreductase family protein  41.3 
 
 		 201 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2215  nitroreductase  46.28 
 
 		 209 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0324809  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1732  nitroreductase  46.15 
 
 		 209 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.639581  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0427  oxidoreductase  38.86 
 
 		 205 aa  112  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2000  nitroreductase  39.56 
 
 		 213 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.578725  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3589  nitroreductase  39.46 
 
 		 201 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2604  nitroreductase  39.46 
 
 		 201 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.759207  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0501  nitroreductase  39.46 
 
 		 201 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0474  nitroreductase  39.46 
 
 		 201 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.573695 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2896  nitroreductase  39.46 
 
 		 207 aa  109  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.318005  normal  0.764115 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0432  nitroreductase  40 
 
 		 201 aa  109  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.181342  normal  0.330733 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0406  nitroreductase  40 
 
 		 201 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.699033  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2730  nitroreductase  37.11 
 
 		 205 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.796867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2261  nitroreductase  39.57 
 
 		 201 aa  108  8.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.746283  normal  0.134626 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5505  nitroreductase  40.11 
 
 		 194 aa  107  9.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0533827 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3531  nitroreductase  38.92 
 
 		 197 aa  107  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.12812  normal  0.174487 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3562  nitroreductase  34.05 
 
 		 200 aa  107  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5258  nitroreductase  38.42 
 
 		 199 aa  106  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.656936 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4890  nitroreductase  37.37 
 
 		 199 aa  105  7e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4979  nitroreductase  37.37 
 
 		 199 aa  105  7e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2267  nitroreductase family protein, putative  37.63 
 
 		 203 aa  103  2e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0491  nitroreductase  37.57 
 
 		 315 aa  103  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.807689 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36390  nitroreductase  36.67 
 
 		 199 aa  103  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0458  nitroreductase  36.36 
 
 		 195 aa  99.8  3e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.348313  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1303  nitroreductase  37.43 
 
 		 199 aa  98.2  7e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.805588 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0215  nitroreductase  40.7 
 
 		 210 aa  98.2  9e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2095  nitroreductase family protein  33.51 
 
 		 189 aa  94.7  8e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0225  nitroreductase  36.61 
 
 		 200 aa  94.4  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.936652  normal  0.851937 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5012  nitroreductase  31.11 
 
 		 191 aa  91.3  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0181044  hitchhiker  0.00444875 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3075  nitroreductase  35.03 
 
 		 198 aa  89.4  3e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0264  nitroreductase  35.54 
 
 		 187 aa  88.6  6e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.284109  hitchhiker  0.00114487 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10883  Nitroreductase  30.05 
 
 		 197 aa  87.8  1e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4613  nitroreductase  36.81 
 
 		 214 aa  84.7  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.250865 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2838  nitroreductase  32.14 
 
 		 223 aa  84.3  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1829  nitroreductase  36.41 
 
 		 200 aa  82.8  0.000000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00202262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0551  nitroreductase  32.35 
 
 		 321 aa  78.2  0.00000000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0537  nitroreductase  31.76 
 
 		 321 aa  77.4  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15950  nitroreductase  26.16 
 
 		 188 aa  73.6  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1207  nitroreductase family protein  26.04 
 
 		 195 aa  72.8  0.000000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0057  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.16 
 
 		 330 aa  72  0.000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1639  nitroreductase  24.39 
 
 		 184 aa  71.2  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0589  nitroreductase  29.44 
 
 		 192 aa  70.9  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  30.17 
 
 		 178 aa  68.2  0.00000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1652  nitroreductase  28.02 
 
 		 171 aa  67.4  0.0000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.177323  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  34.75 
 
 		 167 aa  65.9  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  30.49 
 
 		 163 aa  64.7  0.0000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2404  nitroreductase  34.56 
 
 		 151 aa  64.7  0.0000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  33.52 
 
 		 167 aa  64.3  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  28.41 
 
 		 179 aa  63.5  0.000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1660  nitroreductase  30.34 
 
 		 175 aa  62.8  0.000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.283139  normal  0.036754 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  29.48 
 
 		 174 aa  63.2  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  24.85 
 
 		 170 aa  61.2  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0545  nitroreductase  32.5 
 
 		 172 aa  60.8  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.361368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0073  nitroreductase family protein  28.33 
 
 		 178 aa  60.1  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  33.56 
 
 		 176 aa  60.5  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1106  nitro/flavin reductase  29.56 
 
 		 248 aa  60.8  0.00000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000115125  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  28.14 
 
 		 166 aa  58.5  0.00000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1605  NADPH-flavin oxidoreductase  29.93 
 
 		 169 aa  57  0.0000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1895  nitroreductase  23.63 
 
 		 191 aa  57.4  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>