142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_0140 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_0140  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit domain protein  100 
 
 
867 aa  1724    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  7.0838e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2548  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.95 
 
 
399 aa  221  3.9999999999999997e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0545  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.91 
 
 
697 aa  196  2e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0546  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.19 
 
 
749 aa  154  8e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4002  hypothetical protein  27.68 
 
 
867 aa  148  6e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0060  hypothetical protein  28.02 
 
 
368 aa  123  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.272206 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1362  hypothetical protein  29.03 
 
 
390 aa  102  2e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0609018  hitchhiker  0.00000046022 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0121  Radical SAM domain protein  62.03 
 
 
461 aa  99.4  3e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000759639  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0214  iron-sulfur cluster-binding protein/coenzyme F420-reducing hydrogenase, beta subunit, putative  25.22 
 
 
428 aa  98.6  4e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0139  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit  24.36 
 
 
428 aa  94.4  8e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.668002  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0960  putative WfaX  28.26 
 
 
348 aa  92  5e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1409  hypothetical protein  27.05 
 
 
376 aa  89.4  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.872031  hitchhiker  0.0084702 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2894  hypothetical protein  22.98 
 
 
329 aa  88.6  5e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1607  hypothetical protein  27.51 
 
 
367 aa  85.9  0.000000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.634641 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0961  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.24 
 
 
407 aa  80.1  0.0000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.925835  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0298  hypothetical protein  24.09 
 
 
367 aa  77  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0585  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit  26.33 
 
 
395 aa  76.6  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00081136  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2549  hypothetical protein  27.12 
 
 
383 aa  73.2  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0120  Methyltransferase type 12  70 
 
 
619 aa  68.6  0.0000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000561606  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0959  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  21.01 
 
 
453 aa  66.2  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.848293  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2618  hypothetical protein  20.84 
 
 
358 aa  66.6  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.568711  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0955  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  21.18 
 
 
463 aa  62.8  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.157749  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2095  hypothetical protein  23.5 
 
 
394 aa  62  0.00000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1786  hypothetical protein  21.98 
 
 
298 aa  60.8  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0700  glycosyl transferase family 8  51.85 
 
 
336 aa  58.9  0.0000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000278509  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0123  glycosyl transferase family 2  62.79 
 
 
480 aa  58.5  0.0000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.000000103201  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4135  hypothetical protein  21.2 
 
 
440 aa  58.2  0.0000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2371  F420H2 dehydrogenase subunit F  21.12 
 
 
343 aa  58.2  0.0000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0828  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  20.24 
 
 
836 aa  57  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.241556 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3682  hypothetical protein  22.74 
 
 
366 aa  55.8  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00939506  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0255  F420H2 dehydrogenase subunit F  22.52 
 
 
346 aa  54.3  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0705  glycosyl transferase family 8  45 
 
 
347 aa  53.9  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000314752  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0704  glycosyl transferase family 8  45 
 
 
331 aa  52.8  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000224419  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0347  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  46.67 
 
 
269 aa  53.5  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2707  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit domain protein  24.19 
 
 
341 aa  53.5  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.889848  normal  0.835032 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3050  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.62 
 
 
432 aa  52.8  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1226  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.33 
 
 
432 aa  52.8  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1494  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  47.17 
 
 
57 aa  52.4  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0778  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  24.92 
 
 
618 aa  52  0.00005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.542223  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0084  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  51.11 
 
 
271 aa  51.6  0.00006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0376016  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1292  F420H2 dehydrogenase subunit I  35.71 
 
 
135 aa  51.2  0.00008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000020121  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0397  heterodisulfide reductase, subunit A, selenocysteine-containing  35.71 
 
 
461 aa  51.2  0.00008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0702  glycosyl transferase family 8  41.38 
 
 
334 aa  50.4  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000654129  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3407  F420H2 dehydrogenase subunit I  35.59 
 
 
136 aa  50.1  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00224717  normal  0.799807 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1883  ferredoxin hydrogenase  40.35 
 
 
460 aa  50.4  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0619  nitrite and sulphite reductase  28 
 
 
639 aa  49.7  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00799056  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0528  hypothetical protein  37.25 
 
 
57 aa  50.1  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.625132 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0830  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.29 
 
 
435 aa  49.7  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3879  hypothetical protein  21.33 
 
 
354 aa  49.7  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1568  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  37.74 
 
 
58 aa  49.3  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1179  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.29 
 
 
557 aa  49.3  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.6315 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0559  NADH dehydrogenase (quinone)  45.65 
 
 
624 aa  49.7  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.382532  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0964  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit-like protein  19.94 
 
 
400 aa  48.9  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0907338  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0492  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.38 
 
 
213 aa  48.9  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.363621 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1222  putative oxidoreductase  30.34 
 
 
616 aa  48.9  0.0004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0767368  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02630  dissimilatory sulfite reductase (desulfoviridin), alpha/beta subunit  39.13 
 
 
57 aa  48.9  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.862545 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2122  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  41.3 
 
 
421 aa  48.9  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00612142  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06770  3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase (ferredoxin), delta subunit  35.48 
 
 
70 aa  48.9  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1398  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.62 
 
 
57 aa  48.5  0.0005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0588445  normal  0.318627 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0759  ferredoxin  41.18 
 
 
60 aa  48.1  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000247622 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0375  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.29 
 
 
57 aa  48.1  0.0006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1951  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.33 
 
 
305 aa  48.1  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1302  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  44 
 
 
167 aa  48.1  0.0008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0573  hypothetical protein  41.18 
 
 
198 aa  47.8  0.0008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.575358  decreased coverage  0.000394368 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0226  NADH dehydrogenase (quinone)  44.23 
 
 
632 aa  48.1  0.0008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.096685  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0736  ferredoxin  42 
 
 
59 aa  47.4  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1646  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.71 
 
 
321 aa  47.4  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.187801  normal  0.738007 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1379  ferredoxin  33.33 
 
 
265 aa  47.4  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000430002  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1265  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.29 
 
 
58 aa  47.4  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.755601  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1188  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  40.68 
 
 
289 aa  47.4  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.445325  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0966  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.13 
 
 
211 aa  47.8  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0635309 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0143  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.93 
 
 
1010 aa  47  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1899  NADH dehydrogenase subunit I  38 
 
 
169 aa  47  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00550248  normal  0.26939 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0524  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40 
 
 
368 aa  47  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0168  glycyl-radical enzyme activating protein family  25.11 
 
 
303 aa  47.8  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.465492  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1096  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  44.44 
 
 
266 aa  47.8  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0514529  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0181  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.25 
 
 
355 aa  47.4  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000413474  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2511  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  41.3 
 
 
672 aa  47.4  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1601  putative oxidoreductase  35.38 
 
 
615 aa  47.8  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1057  MauM/NapG family ferredoxin-type protein  44 
 
 
222 aa  47.4  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2106  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  43.64 
 
 
203 aa  47  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0014  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.69 
 
 
1116 aa  46.2  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.952368 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22790  Fe-S-cluster-containing hydrogenase subunit  39.58 
 
 
219 aa  47  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2971  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.17 
 
 
1006 aa  47  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.378753  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3013  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.17 
 
 
1006 aa  47  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.672431  normal  0.187038 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0477  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.57 
 
 
435 aa  46.6  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00748244  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2176  coenzyme F420 hydrogenase  40.38 
 
 
263 aa  47  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0137  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.93 
 
 
1010 aa  46.2  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3941  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  41.67 
 
 
315 aa  46.6  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000105876  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1301  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  41.18 
 
 
375 aa  46.6  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3575  methyl-viologen-reducing hydrogenase delta subunit  43.4 
 
 
736 aa  46.6  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0919  NADH dehydrogenase (quinone)  45.83 
 
 
596 aa  46.6  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0885  putative oxidoreductase  36.51 
 
 
612 aa  47  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1054  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.9 
 
 
180 aa  46.2  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0481  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34 
 
 
96 aa  45.8  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1212  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  40.58 
 
 
441 aa  46.2  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.72306  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1368  NADH dehydrogenase (quinone)  43.48 
 
 
626 aa  46.2  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1318  NADH dehydrogenase (quinone)  43.48 
 
 
626 aa  46.2  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1086  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  42.22 
 
 
286 aa  46.2  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0696553 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0472  NADH dehydrogenase (quinone)  42.55 
 
 
594 aa  45.8  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.524488  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>