More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5299 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_5299  nitroreductase  100 
 
 		 274 aa  534  1e-151  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.367904  normal  0.0165662 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1130  nitroreductase  66.91 
 
 		 286 aa  317  9e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3290  putative nitroreductase family protein  64.04 
 
 		 284 aa  310  2e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.106702 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4153  nitroreductase  53.01 
 
 		 273 aa  266  2e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000365143  normal  0.488904 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2655  nitroreductase  54.24 
 
 		 273 aa  258  7e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.263589  normal  0.516576 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1852  nitroreductase  54.37 
 
 		 288 aa  251  9.000000000000001e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1372  nitroreductase family protein  55.64 
 
 		 273 aa  241  1e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4035  nitroreductase  46.13 
 
 		 273 aa  240  2e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.55178 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7190  Nitroreductase  54.72 
 
 		 253 aa  240  2e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.561189  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2490  nitroreductase family protein  54.75 
 
 		 274 aa  236  2e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1161  nitroreductase  55.26 
 
 		 273 aa  231  7.000000000000001e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.395366  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0516  nitroreductase  52.94 
 
 		 276 aa  228  1e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3098  nitroreductase  54.96 
 
 		 304 aa  218  6e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45940  Nitroreductase-like protein  52.04 
 
 		 273 aa  205  8e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.43348  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08360  conserved hypothetical protein  38.46 
 
 		 285 aa  181  1e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.811217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0371  nitroreductase  36.9 
 
 		 261 aa  158  8e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06664  nitroreductase A  37.2 
 
 		 257 aa  144  1e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001121  NADPH-flavin oxidoreductase  38.16 
 
 		 240 aa  144  1e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000890353  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0613  NADPH-flavin oxidoreductase  33.2 
 
 		 251 aa  142  6e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00207228  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1365  nitroreductase A  38.73 
 
 		 240 aa  142  7e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3660  nitroreductase family protein  37.39 
 
 		 244 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.930381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3889  nitroreductase  33.73 
 
 		 248 aa  140  1.9999999999999998e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0202  nitroreductase  39.62 
 
 		 243 aa  139  4.999999999999999e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.779167  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1682  nitroreductase family protein  37.39 
 
 		 244 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1528  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  36.49 
 
 		 244 aa  139  7e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.165515  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1647  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  36.49 
 
 		 244 aa  139  7e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2607  nitroreductase  33.08 
 
 		 253 aa  138  8.999999999999999e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.921549  normal  0.767551 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1713  nitroreductase family protein  36.49 
 
 		 244 aa  138  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1245  nitroreductase A  34.25 
 
 		 242 aa  137  2e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1491  oxygen-insensitive NADPH nitroreductase  36.49 
 
 		 244 aa  137  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0062  NAD(P)H-flavin oxidoreductase, putative  39.02 
 
 		 251 aa  137  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.454092  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1790  nitroreductase family protein  36.49 
 
 		 244 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1736  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  36.04 
 
 		 244 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0685688  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1336  nitroreductase  36.49 
 
 		 244 aa  135  9e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1500  oxygen-insensitive NADPH nitroreductase  36.04 
 
 		 244 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00104852  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1532  nitroreductase  36.04 
 
 		 244 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.509965  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0441  nitroreductase  37.81 
 
 		 251 aa  131  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000237608  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0430  nitroreductase  37.81 
 
 		 251 aa  131  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000330176  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0249  nitroreductase A  33.86 
 
 		 240 aa  129  4.0000000000000003e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.807471  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00856  nitroreductase A, NADPH-dependent, FMN-dependent  38.24 
 
 		 240 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2791  nitroreductase  38.24 
 
 		 240 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00862  hypothetical protein  38.24 
 
 		 240 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0923  nitroreductase A  38.24 
 
 		 240 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0954  nitroreductase A  38.24 
 
 		 240 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2745  nitroreductase A  38.24 
 
 		 240 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.154506 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2481  nitroreductase A  38.24 
 
 		 240 aa  126  3e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0878  nitroreductase A  38.73 
 
 		 240 aa  126  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1005  nitroreductase A  38.24 
 
 		 240 aa  125  8.000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.224676 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2492  nitroreductase  35.16 
 
 		 249 aa  124  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0493  nitroreductase  29.46 
 
 		 269 aa  122  8e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0911  nitroreductase A  39.22 
 
 		 240 aa  118  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1008  nitroreductase A  39.22 
 
 		 240 aa  118  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0947  nitroreductase A  39.22 
 
 		 240 aa  118  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0979  nitroreductase A  39.22 
 
 		 240 aa  118  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.711785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1027  nitroreductase A  38.73 
 
 		 240 aa  115  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.515962  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2290  nitroreductase  42.16 
 
 		 240 aa  115  6.9999999999999995e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0690  nitroreductase  30.73 
 
 		 246 aa  115  8.999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0134674  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1955  nitroreductase A  37.25 
 
 		 239 aa  113  3e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.45348  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1560  nitroreductase  29.53 
 
 		 253 aa  114  3e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1689  nitroreductase A  39.71 
 
 		 239 aa  112  6e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.589123  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0797  nitroreductase  29.71 
 
 		 240 aa  112  8.000000000000001e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3602  nitroreductase  32.69 
 
 		 246 aa  110  3e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.263517  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0381  nitroreductase  31.38 
 
 		 246 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.53738  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0996  nitroreductase  28.85 
 
 		 250 aa  108  7.000000000000001e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1079  nitroreductase A  32.85 
 
 		 240 aa  108  8.000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0338  nitroreductase  32.37 
 
 		 246 aa  107  3e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2389  nitroreductase  38.73 
 
 		 240 aa  106  4e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8680  nitroreductase  36.73 
 
 		 282 aa  100  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.281057  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1502  Nitroreductase  34.18 
 
 		 254 aa  98.2  1e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1106  nitro/flavin reductase  31.34 
 
 		 248 aa  98.2  1e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000115125  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3965  nitroreductase  31.14 
 
 		 265 aa  97.8  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.696228 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1309  nitroreductase family protein  32.23 
 
 		 299 aa  95.5  8e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1072  nitroreductase  28.71 
 
 		 251 aa  92.4  7e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000226333  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2300  nitroreductase  32.45 
 
 		 317 aa  89  8e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0351081 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1439  nitroreductase  31.72 
 
 		 238 aa  83.6  0.000000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0391  nitroreductase  32.11 
 
 		 316 aa  82.8  0.000000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  30.32 
 
 		 170 aa  80.9  0.00000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  25.49 
 
 		 204 aa  79.3  0.00000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  31.28 
 
 		 183 aa  76.6  0.0000000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1816  nitroreductase  29.8 
 
 		 238 aa  75.5  0.0000000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.545584 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  28.22 
 
 		 186 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1770  nitroreductase  26.92 
 
 		 247 aa  74.7  0.000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1230  nitroreductase  24.64 
 
 		 248 aa  74.7  0.000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  35.97 
 
 		 174 aa  73.9  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  28.65 
 
 		 178 aa  73.6  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0709  nitroreductase  31.07 
 
 		 215 aa  73.6  0.000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0182  NADH dehydrogenase  37.62 
 
 		 206 aa  72  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0079  nitroreductase  32.68 
 
 		 175 aa  70.9  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.423186  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1357  nitroreductase  29.94 
 
 		 214 aa  70.1  0.00000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.374254 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  27.23 
 
 		 184 aa  70.1  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  26.63 
 
 		 186 aa  68.9  0.00000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4759  nitroreductase  27.27 
 
 		 221 aa  68.6  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000691202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0755  nitroreductase  25.2 
 
 		 245 aa  68.2  0.0000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  26.34 
 
 		 176 aa  67  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0813  nitroreductase  36.52 
 
 		 173 aa  66.6  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  29.59 
 
 		 186 aa  66.2  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_585  nitroreductase  27.92 
 
 		 169 aa  65.1  0.000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.179153  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1660  nitroreductase  33.8 
 
 		 175 aa  65.5  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.283139  normal  0.036754 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  30.18 
 
 		 192 aa  63.5  0.000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1003  nitroreductase  31.25 
 
 		 270 aa  62.8  0.000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.91406  hitchhiker  0.00384505 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>