214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3403 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_3403  nitroreductase  100 
 
 
265 aa  548  1e-155  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1083  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  52.92 
 
 
269 aa  310  1e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1889  nitroreductase  51.81 
 
 
261 aa  287  1e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.847236  normal  0.49953 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1900  nitroreductase  49.24 
 
 
276 aa  286  2e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.743117 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1902  nitroreductase  50.97 
 
 
261 aa  285  4e-76  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.453048  hitchhiker  0.00100837 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1686  nitroreductase  50.58 
 
 
276 aa  279  3e-74  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0333  hypothetical protein  29.39 
 
 
237 aa  82.8  0.000000000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  27.43 
 
 
186 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0371  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  25.91 
 
 
227 aa  68.9  0.00000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  45.31 
 
 
186 aa  66.2  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1139  hypothetical protein  25.63 
 
 
343 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2649  nitroreductase  26.45 
 
 
192 aa  64.3  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0573  nitroreductase family protein  27.88 
 
 
228 aa  62.8  0.000000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2581  nitroreductase  27.34 
 
 
236 aa  60.8  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00210488  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0353  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  25.29 
 
 
212 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.261778  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  45.31 
 
 
188 aa  60.1  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0087  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  24.43 
 
 
213 aa  58.2  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0603  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  24.47 
 
 
210 aa  57.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1736  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  25.1 
 
 
236 aa  57.8  0.0000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.321705 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  40.62 
 
 
186 aa  57.8  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  46.15 
 
 
167 aa  57  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1003  hypothetical protein  26.4 
 
 
330 aa  56.6  0.0000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3407  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  24.27 
 
 
222 aa  56.2  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  40.62 
 
 
184 aa  56.2  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1226  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  22.47 
 
 
222 aa  56.2  0.0000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  42.19 
 
 
170 aa  55.8  0.0000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1408  nitroreductase  27.8 
 
 
217 aa  55.5  0.0000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0271  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  26.67 
 
 
233 aa  55.5  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0381  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  25.11 
 
 
213 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.199086  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1720  nitroreductase  38.55 
 
 
196 aa  54.3  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2878  Cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  24.8 
 
 
279 aa  54.7  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.348827  normal  0.405788 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4962  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  25.94 
 
 
207 aa  54.3  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.445827  normal  0.0961797 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  42.37 
 
 
177 aa  54.3  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0106  nitroreductase  22.5 
 
 
200 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.76235 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  43.64 
 
 
169 aa  53.9  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5999  nitroreductase  23.53 
 
 
218 aa  52.8  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0109  nitroreductase  22.08 
 
 
200 aa  52.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  26.45 
 
 
190 aa  52.4  0.000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2051  nitroreductase family protein  21.57 
 
 
219 aa  52  0.000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000565957  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0862  nitroreductase family protein  21.57 
 
 
219 aa  52  0.000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00254558  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3169  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  21.57 
 
 
219 aa  52  0.000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00240689  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2289  nitroreductase family protein  22.83 
 
 
221 aa  52  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0221  nitroreductase  37.7 
 
 
180 aa  51.6  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.602782  normal  0.0189765 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3222  nitroreductase family protein  21.31 
 
 
411 aa  51.6  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00153701  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1136  nitroreductase  27.72 
 
 
200 aa  52  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.710664  normal  0.0578189 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  34.52 
 
 
190 aa  51.6  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2694  nitroreductase family protein  21.31 
 
 
351 aa  51.6  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.990195  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5585  hypothetical protein  23.95 
 
 
343 aa  51.6  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.582272  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4448  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  27.65 
 
 
209 aa  51.6  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.178194 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6194  hypothetical protein  25.11 
 
 
335 aa  50.8  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.325627  normal  0.125602 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7192  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  25.25 
 
 
228 aa  51.2  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3208  nitroreductase family protein  21.31 
 
 
394 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1137  nitroreductase  28 
 
 
209 aa  50.4  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.038928 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  37.29 
 
 
170 aa  50.1  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  37.5 
 
 
187 aa  50.4  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1646  nitroreductase  23.91 
 
 
200 aa  50.1  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3598  hypothetical protein  21.49 
 
 
230 aa  50.1  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1657  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  21.96 
 
 
223 aa  50.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0879001 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1696  nitroreductase  23.66 
 
 
213 aa  50.1  0.00004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.451691 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0382  nitroreductase  40.62 
 
 
213 aa  50.1  0.00004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000218228  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3427  nitroreductase  20.65 
 
 
213 aa  49.7  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3218  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  21.93 
 
 
230 aa  49.7  0.00005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0926  nitroreductase  25.74 
 
 
223 aa  49.7  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1220  nitroreductase family protein  30.28 
 
 
200 aa  49.3  0.00006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.168432  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3956  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  21.93 
 
 
230 aa  49.3  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.733345  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5185  nitroreductase  26 
 
 
221 aa  49.3  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0863183  normal  0.13215 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1010  nitroreductase  24.48 
 
 
361 aa  49.3  0.00007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.869828  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  33.85 
 
 
168 aa  49.3  0.00007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  38.81 
 
 
183 aa  48.9  0.00008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2012  nitroreductase  25.7 
 
 
223 aa  48.9  0.00008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142493  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1628  nitroreductase  40.28 
 
 
207 aa  48.9  0.00009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.627423 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3978  nitroreductase  36.99 
 
 
209 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0811138 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1204  nitroreductase  36.51 
 
 
174 aa  48.5  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.460953  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2980  nitroreductase  43.4 
 
 
189 aa  48.5  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.800922  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4783  nitroreductase  35.94 
 
 
217 aa  48.1  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0866516 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4995  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  21.43 
 
 
219 aa  47.4  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.104109  hitchhiker  0.00247191 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2975  nitroreductase  41.82 
 
 
169 aa  47.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.522963 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1523  NAD(P)H-flavin oxidoreductase, putative  27.23 
 
 
191 aa  48.1  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1006  nitroreductase  32.63 
 
 
202 aa  47.8  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269661  normal  0.607301 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1327  nitroreductase family protein  22.73 
 
 
270 aa  47.4  0.0002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4320  nitroreductase  25.82 
 
 
224 aa  47.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3213  hypothetical protein  23.14 
 
 
343 aa  47.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0019  nitroreductase  23.11 
 
 
196 aa  47.4  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2315  hypothetical protein  23.97 
 
 
343 aa  47.4  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1401  nitroreductase family protein  20.66 
 
 
368 aa  47  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000248129  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1459  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  21.49 
 
 
240 aa  47.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5600  nitroreductase  23.89 
 
 
343 aa  47  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.581442  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  40.35 
 
 
179 aa  47  0.0004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  37.5 
 
 
165 aa  46.6  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  36.07 
 
 
167 aa  46.6  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0657  nitroreductase family protein  31.67 
 
 
201 aa  46.6  0.0004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2657  nitroreductase  36 
 
 
202 aa  47  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.752481  normal  0.637011 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1048  nitroreductase  26.25 
 
 
219 aa  46.6  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.043093 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1084  nitroreductase family protein  31.67 
 
 
201 aa  46.6  0.0004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1856  nitroreductase  40.91 
 
 
350 aa  46.2  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2969  nitroreductase  35.94 
 
 
209 aa  46.2  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000187798  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1374  nitroreductase  36.23 
 
 
202 aa  46.2  0.0005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0794  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  20.9 
 
 
247 aa  46.6  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0824  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  20.9 
 
 
247 aa  46.2  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.307399  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1213  nitroreductase  36.49 
 
 
221 aa  46.2  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.718567 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>