207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II1079 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011313  VSAL_II1079  nitroreductase A  100 
 
 		 240 aa  501  1e-141  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001121  NADPH-flavin oxidoreductase  68.78 
 
 		 240 aa  347  8e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000890353  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06664  nitroreductase A  67.65 
 
 		 257 aa  344  8.999999999999999e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0249  nitroreductase A  68.75 
 
 		 240 aa  328  3e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.807471  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1245  nitroreductase A  53.75 
 
 		 242 aa  252  4.0000000000000004e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2745  nitroreductase A  52.08 
 
 		 240 aa  247  1e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.154506 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0954  nitroreductase A  52.08 
 
 		 240 aa  247  1e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00856  nitroreductase A, NADPH-dependent, FMN-dependent  52.08 
 
 		 240 aa  246  2e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2791  nitroreductase  52.08 
 
 		 240 aa  246  2e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00862  hypothetical protein  52.08 
 
 		 240 aa  246  2e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2481  nitroreductase A  52.08 
 
 		 240 aa  246  2e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0923  nitroreductase A  52.08 
 
 		 240 aa  246  2e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1365  nitroreductase A  47.92 
 
 		 240 aa  245  4.9999999999999997e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0878  nitroreductase A  51.67 
 
 		 240 aa  244  6e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1005  nitroreductase A  51.67 
 
 		 240 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.224676 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0911  nitroreductase A  50 
 
 		 240 aa  234  7e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1008  nitroreductase A  50 
 
 		 240 aa  234  7e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0947  nitroreductase A  50 
 
 		 240 aa  234  7e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0979  nitroreductase A  50 
 
 		 240 aa  234  7e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.711785  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2389  nitroreductase  49.58 
 
 		 240 aa  232  4.0000000000000004e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1027  nitroreductase A  49.58 
 
 		 240 aa  231  6e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.515962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1955  nitroreductase A  47.5 
 
 		 239 aa  224  7e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.45348  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1689  nitroreductase A  47.92 
 
 		 239 aa  220  9.999999999999999e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.589123  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0371  nitroreductase  42.45 
 
 		 261 aa  216  2e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2290  nitroreductase  47.08 
 
 		 240 aa  212  4.9999999999999996e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0202  nitroreductase  42.62 
 
 		 243 aa  210  2e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.779167  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0493  nitroreductase  38.76 
 
 		 269 aa  203  2e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2607  nitroreductase  40.8 
 
 		 253 aa  195  5.000000000000001e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.921549  normal  0.767551 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3889  nitroreductase  37.96 
 
 		 248 aa  184  9e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2492  nitroreductase  41.04 
 
 		 249 aa  181  1e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1532  nitroreductase  40 
 
 		 244 aa  177  1e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.509965  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1491  oxygen-insensitive NADPH nitroreductase  39.59 
 
 		 244 aa  176  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1682  nitroreductase family protein  39.26 
 
 		 244 aa  176  3e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1500  oxygen-insensitive NADPH nitroreductase  39.18 
 
 		 244 aa  176  4e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00104852  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1713  nitroreductase family protein  39.18 
 
 		 244 aa  176  4e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3660  nitroreductase family protein  38.78 
 
 		 244 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.930381  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1528  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  38.78 
 
 		 244 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.165515  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1647  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  38.78 
 
 		 244 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1790  nitroreductase family protein  38.78 
 
 		 244 aa  171  1e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1736  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  37.96 
 
 		 244 aa  167  9e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0685688  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1336  nitroreductase  37.19 
 
 		 244 aa  167  2e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0430  nitroreductase  36.33 
 
 		 251 aa  154  1e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000330176  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0441  nitroreductase  36.33 
 
 		 251 aa  154  1e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000237608  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0613  NADPH-flavin oxidoreductase  34.43 
 
 		 251 aa  149  3e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00207228  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4035  nitroreductase  35.97 
 
 		 273 aa  149  5e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.55178 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0062  NAD(P)H-flavin oxidoreductase, putative  33.47 
 
 		 251 aa  139  3e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.454092  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08360  conserved hypothetical protein  31.87 
 
 		 285 aa  137  1e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.811217  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1372  nitroreductase family protein  34.66 
 
 		 273 aa  137  1e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0996  nitroreductase  34.96 
 
 		 250 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3290  putative nitroreductase family protein  33.63 
 
 		 284 aa  132  5e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.106702 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4153  nitroreductase  32.81 
 
 		 273 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000365143  normal  0.488904 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1560  nitroreductase  33.47 
 
 		 253 aa  130  3e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2655  nitroreductase  34.04 
 
 		 273 aa  129  6e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.263589  normal  0.516576 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0690  nitroreductase  35.59 
 
 		 246 aa  125  4.0000000000000003e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0134674  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1106  nitro/flavin reductase  32.61 
 
 		 248 aa  125  5e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000115125  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1852  nitroreductase  33.07 
 
 		 288 aa  124  1e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2490  nitroreductase family protein  34.52 
 
 		 274 aa  123  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3098  nitroreductase  32.11 
 
 		 304 aa  122  4e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1161  nitroreductase  36.24 
 
 		 273 aa  117  9.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.395366  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1130  nitroreductase  30.16 
 
 		 286 aa  118  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45940  Nitroreductase-like protein  34.78 
 
 		 273 aa  114  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.43348  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0516  nitroreductase  33.47 
 
 		 276 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3602  nitroreductase  31.02 
 
 		 246 aa  113  3e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.263517  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7190  Nitroreductase  28.69 
 
 		 253 aa  112  6e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.561189  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0797  nitroreductase  30.25 
 
 		 240 aa  108  6e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5299  nitroreductase  29.13 
 
 		 274 aa  105  6e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.367904  normal  0.0165662 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2300  nitroreductase  30.36 
 
 		 317 aa  105  6e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0351081 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1770  nitroreductase  28.51 
 
 		 247 aa  105  7e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1309  nitroreductase family protein  31.58 
 
 		 299 aa  102  4e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1502  Nitroreductase  30.21 
 
 		 254 aa  98.6  8e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0338  nitroreductase  29.91 
 
 		 246 aa  98.2  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3965  nitroreductase  29.79 
 
 		 265 aa  97.4  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.696228 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0381  nitroreductase  29.91 
 
 		 246 aa  97.1  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.53738  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0391  nitroreductase  29.38 
 
 		 316 aa  97.1  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8680  nitroreductase  26.53 
 
 		 282 aa  95.1  8e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.281057  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0755  nitroreductase  28.4 
 
 		 245 aa  94.4  1e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1816  nitroreductase  30 
 
 		 238 aa  93.6  2e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.545584 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1439  nitroreductase  34.07 
 
 		 238 aa  93.2  3e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1072  nitroreductase  28.38 
 
 		 251 aa  91.7  1e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000226333  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1230  nitroreductase  28.4 
 
 		 248 aa  91.7  1e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0889  nitroreductase  30.56 
 
 		 238 aa  79  0.00000000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.351311 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  34.08 
 
 		 167 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0221  nitroreductase  30.49 
 
 		 180 aa  73.2  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.602782  normal  0.0189765 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1633  nitroreductase  32.75 
 
 		 238 aa  73.2  0.000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0709  nitroreductase  31.4 
 
 		 215 aa  72.4  0.000000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1003  nitroreductase  26.86 
 
 		 270 aa  72  0.000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.91406  hitchhiker  0.00384505 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  28.32 
 
 		 170 aa  71.6  0.000000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  29.56 
 
 		 165 aa  71.2  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  31.28 
 
 		 167 aa  68.6  0.00000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1357  nitroreductase  31.76 
 
 		 214 aa  68.6  0.00000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.374254 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  29.26 
 
 		 177 aa  67.4  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  28.4 
 
 		 192 aa  67.4  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2187  nitroreductase  30.46 
 
 		 173 aa  66.6  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.530109 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  25.54 
 
 		 176 aa  66.2  0.0000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  26.23 
 
 		 166 aa  65.5  0.0000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  28.14 
 
 		 176 aa  65.1  0.0000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3299  NADPH-flavin oxidoreductase  28.57 
 
 		 169 aa  65.1  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.47744  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  27.71 
 
 		 174 aa  64.7  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  28.48 
 
 		 163 aa  63.5  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1011  nitroreductase  30.07 
 
 		 329 aa  63.2  0.000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>