More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_0889 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_0889  nitroreductase  100 
 
 
238 aa  481  1e-135  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.351311 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1439  nitroreductase  68.49 
 
 
238 aa  328  6e-89  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1816  nitroreductase  67.93 
 
 
238 aa  318  3.9999999999999996e-86  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.545584 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1633  nitroreductase  70.94 
 
 
238 aa  281  5.000000000000001e-75  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2300  nitroreductase  38.82 
 
 
317 aa  179  4e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0351081 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0391  nitroreductase  39.24 
 
 
316 aa  178  7e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1713  nitroreductase family protein  36.07 
 
 
244 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1528  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  35.62 
 
 
244 aa  153  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.165515  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1647  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  35.62 
 
 
244 aa  153  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1500  oxygen-insensitive NADPH nitroreductase  35.62 
 
 
244 aa  152  4e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00104852  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1491  oxygen-insensitive NADPH nitroreductase  35.62 
 
 
244 aa  152  4e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3660  nitroreductase family protein  38.22 
 
 
244 aa  150  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.930381  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1682  nitroreductase family protein  38.22 
 
 
244 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1790  nitroreductase family protein  37.7 
 
 
244 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1532  nitroreductase  37.17 
 
 
244 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.509965  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1736  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  33.79 
 
 
244 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0685688  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1336  nitroreductase  34.62 
 
 
244 aa  135  8e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0371  nitroreductase  35.38 
 
 
261 aa  134  9e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3889  nitroreductase  30.84 
 
 
248 aa  127  1.0000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0441  nitroreductase  35.08 
 
 
251 aa  126  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000237608  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0430  nitroreductase  35.08 
 
 
251 aa  126  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000330176  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0062  NAD(P)H-flavin oxidoreductase, putative  31.76 
 
 
251 aa  125  5e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.454092  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001121  NADPH-flavin oxidoreductase  31.93 
 
 
240 aa  124  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000890353  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1560  nitroreductase  34.66 
 
 
253 aa  124  1e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0613  NADPH-flavin oxidoreductase  32.2 
 
 
251 aa  123  2e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00207228  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0202  nitroreductase  31.02 
 
 
243 aa  123  3e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.779167  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2607  nitroreductase  34.95 
 
 
253 aa  122  4e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.921549  normal  0.767551 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4035  nitroreductase  32.42 
 
 
273 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.55178 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06664  nitroreductase A  35.71 
 
 
257 aa  119  3e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0996  nitroreductase  27.57 
 
 
250 aa  117  9.999999999999999e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1106  nitro/flavin reductase  35.05 
 
 
248 aa  117  9.999999999999999e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000115125  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2492  nitroreductase  38.46 
 
 
249 aa  116  3e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1245  nitroreductase A  35.26 
 
 
242 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1502  Nitroreductase  35.14 
 
 
254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4153  nitroreductase  33.33 
 
 
273 aa  108  8.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000365143  normal  0.488904 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1003  nitroreductase  34.71 
 
 
270 aa  106  2e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.91406  hitchhiker  0.00384505 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08360  conserved hypothetical protein  28.87 
 
 
285 aa  105  8e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.811217  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1365  nitroreductase A  31.87 
 
 
240 aa  105  9e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1955  nitroreductase A  33.52 
 
 
239 aa  105  9e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.45348  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2481  nitroreductase A  34.62 
 
 
240 aa  103  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00856  nitroreductase A, NADPH-dependent, FMN-dependent  34.62 
 
 
240 aa  103  3e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2791  nitroreductase  34.62 
 
 
240 aa  103  3e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2745  nitroreductase A  34.62 
 
 
240 aa  103  3e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.154506 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0923  nitroreductase A  34.62 
 
 
240 aa  103  3e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0755  nitroreductase  31.02 
 
 
245 aa  103  3e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00862  hypothetical protein  34.62 
 
 
240 aa  103  3e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0954  nitroreductase A  34.62 
 
 
240 aa  103  3e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1689  nitroreductase A  34.62 
 
 
239 aa  102  4e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.589123  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1005  nitroreductase A  34.62 
 
 
240 aa  101  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.224676 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2389  nitroreductase  34.07 
 
 
240 aa  101  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0878  nitroreductase A  34.07 
 
 
240 aa  100  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1309  nitroreductase family protein  31.28 
 
 
299 aa  100  2e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1230  nitroreductase  29.84 
 
 
248 aa  100  3e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7190  Nitroreductase  30.65 
 
 
253 aa  97.4  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.561189  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1072  nitroreductase  34.66 
 
 
251 aa  97.8  1e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000226333  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2655  nitroreductase  34.46 
 
 
273 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.263589  normal  0.516576 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1852  nitroreductase  34.57 
 
 
288 aa  96.7  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2290  nitroreductase  34.27 
 
 
240 aa  95.9  5e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0690  nitroreductase  29.38 
 
 
246 aa  95.1  8e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0134674  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1079  nitroreductase A  31.17 
 
 
240 aa  94.4  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0493  nitroreductase  29.19 
 
 
269 aa  94.4  1e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3098  nitroreductase  36.02 
 
 
304 aa  94  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3602  nitroreductase  29.5 
 
 
246 aa  94  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.263517  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0249  nitroreductase A  34.43 
 
 
240 aa  94  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.807471  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3290  putative nitroreductase family protein  33.51 
 
 
284 aa  92.8  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.106702 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0797  nitroreductase  26.88 
 
 
240 aa  91.7  1e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0947  nitroreductase A  31.72 
 
 
240 aa  89.4  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1372  nitroreductase family protein  32.31 
 
 
273 aa  89.4  5e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1008  nitroreductase A  31.72 
 
 
240 aa  89.4  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0979  nitroreductase A  31.72 
 
 
240 aa  89.4  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.711785  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0911  nitroreductase A  31.72 
 
 
240 aa  89.4  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1027  nitroreductase A  31.72 
 
 
240 aa  88.6  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.515962  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  30.81 
 
 
163 aa  86.7  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  31.41 
 
 
170 aa  84  0.000000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5299  nitroreductase  35.96 
 
 
274 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.367904  normal  0.0165662 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45940  Nitroreductase-like protein  36.87 
 
 
273 aa  82.4  0.000000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.43348  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1130  nitroreductase  33.16 
 
 
286 aa  82  0.000000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  29.35 
 
 
176 aa  80.1  0.00000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3965  nitroreductase  31.44 
 
 
265 aa  80.1  0.00000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.696228 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0516  nitroreductase  32.09 
 
 
276 aa  77.8  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0338  nitroreductase  27.72 
 
 
246 aa  77.4  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1518  nitroreductase  30.48 
 
 
170 aa  75.9  0.0000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0381  nitroreductase  27.72 
 
 
246 aa  75.9  0.0000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.53738  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1200  nitroreductase  29.51 
 
 
188 aa  75.9  0.0000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  29.57 
 
 
168 aa  75.5  0.0000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  29.89 
 
 
174 aa  74.3  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2490  nitroreductase family protein  35.26 
 
 
274 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  28.22 
 
 
204 aa  73.2  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1161  nitroreductase  37.41 
 
 
273 aa  70.5  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.395366  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  27.71 
 
 
176 aa  70.1  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  29.09 
 
 
183 aa  69.7  0.00000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8680  nitroreductase  33.54 
 
 
282 aa  69.3  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.281057  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1652  nitroreductase  26.78 
 
 
171 aa  69.3  0.00000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.177323  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  27.17 
 
 
165 aa  68.2  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  28.23 
 
 
194 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1513  nitroreductase  29.26 
 
 
180 aa  67.4  0.0000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000744029 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  28.34 
 
 
167 aa  67  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1862  nitroreductase  26.49 
 
 
197 aa  66.6  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0813  nitroreductase  30.9 
 
 
173 aa  65.9  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  26.07 
 
 
194 aa  65.9  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>