249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0053 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0053  nitroreductase  100 
 
 		 188 aa  387  1e-107  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0498  hypothetical protein  36.31 
 
 		 183 aa  105  4e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.228432  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1301  nitroreductase  36.52 
 
 		 195 aa  105  5e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1291  nitroreductase  33.53 
 
 		 191 aa  102  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_12251  hypothetical protein  35.71 
 
 		 183 aa  103  2e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13071  hypothetical protein  35.96 
 
 		 183 aa  102  4e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.212182  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2428  nitroreductase  31.38 
 
 		 200 aa  89  4e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1450  nitroreductase  34.52 
 
 		 192 aa  86.3  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.761824  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04940  Nitroreductase family protein  36.61 
 
 		 185 aa  85.5  4e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.680935  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3073  nitroreductase  34.71 
 
 		 201 aa  85.1  5e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000978726  normal  0.396217 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0644  nitroreductase  33.85 
 
 		 186 aa  81.3  0.000000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0831  nitroreductase family protein  33.33 
 
 		 186 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.046086  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0730  nitroreductase family protein  33.33 
 
 		 186 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0679  nitroreductase family protein  33.33 
 
 		 186 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0821  nitroreductase family protein  33.14 
 
 		 186 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0766  nitroreductase family protein  33.33 
 
 		 186 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0679  nitroreductase  33.14 
 
 		 186 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0928  nitroreductase family protein  34.46 
 
 		 186 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4513  nitroreductase family protein  33.9 
 
 		 186 aa  78.6  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000206463 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2170  nitroreductase  33.73 
 
 		 204 aa  79  0.00000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0667  nitroreductase family protein  33.33 
 
 		 186 aa  78.2  0.00000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2649  nitroreductase  31.67 
 
 		 192 aa  74.3  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1628  nitroreductase  30.86 
 
 		 207 aa  72.4  0.000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.627423 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4738  nitroreductase  31.07 
 
 		 184 aa  70.9  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3170  nitroreductase  29.13 
 
 		 210 aa  69.7  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1800  nitroreductase  29.51 
 
 		 182 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.493936  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1682  hypothetical protein  24.29 
 
 		 183 aa  69.3  0.00000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.5074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1808  nitroreductase  29.51 
 
 		 182 aa  68.9  0.00000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0566  hypothetical protein  26.8 
 
 		 182 aa  68.9  0.00000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.121072  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2478  nitroreductase  29.51 
 
 		 182 aa  68.9  0.00000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.981358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1833  nitroreductase  28.24 
 
 		 182 aa  68.6  0.00000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0967243  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1847  nitroreductase  28.96 
 
 		 182 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1891  nitroreductase  26.44 
 
 		 182 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1665  nitroreductase  26.82 
 
 		 182 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1740  nitroreductase  26.44 
 
 		 182 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01734  predicted oxidoreductase  26.47 
 
 		 183 aa  65.1  0.0000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00353733  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1877  nitroreductase  26.47 
 
 		 183 aa  65.1  0.0000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000380394  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1849  hypothetical protein  26.47 
 
 		 183 aa  65.1  0.0000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000672951  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2020  hypothetical protein  26.47 
 
 		 183 aa  65.1  0.0000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000242439  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0639  nitroreductase  28.73 
 
 		 161 aa  65.1  0.0000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1988  hypothetical protein  26.47 
 
 		 183 aa  65.1  0.0000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00470911  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2485  hypothetical protein  26.47 
 
 		 183 aa  65.1  0.0000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.175131  normal  0.297695 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1867  hypothetical protein  26.47 
 
 		 183 aa  65.1  0.0000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0147803  decreased coverage  0.00000404862 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01722  hypothetical protein  26.47 
 
 		 183 aa  65.1  0.0000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00796019  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1423  hypothetical protein  24.29 
 
 		 183 aa  64.7  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.566409 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1407  hypothetical protein  24.29 
 
 		 183 aa  64.7  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0175478  normal  0.348646 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2494  nitroreductase  26.82 
 
 		 182 aa  64.7  0.0000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.838709  hitchhiker  0.00693244 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2304  nitroreductase  26.82 
 
 		 182 aa  64.7  0.0000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0131618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2164  nitroreductase  25.71 
 
 		 190 aa  64.7  0.0000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1919  hypothetical protein  28.24 
 
 		 186 aa  64.7  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1971  hypothetical protein  23.78 
 
 		 183 aa  63.9  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.3707  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4233  nitroreductase  25.14 
 
 		 209 aa  63.9  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.064349  normal  0.419848 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2374  nitroreductase  26.82 
 
 		 182 aa  64.3  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.611093  normal  0.915737 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1390  hypothetical protein  24.29 
 
 		 183 aa  63.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.184229  normal  0.505181 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22710  hypothetical protein  27.51 
 
 		 186 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0282238 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1426  hypothetical protein  27.22 
 
 		 183 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00297236  normal  0.808801 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0762  nitroreductase family protein  28.02 
 
 		 207 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3978  nitroreductase  28.39 
 
 		 209 aa  62.4  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0811138 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2050  hypothetical protein  24.29 
 
 		 183 aa  62.8  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.658191  normal  0.425687 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1879  hypothetical protein  24.29 
 
 		 183 aa  62.4  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000572902  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2267  hypothetical protein  22.53 
 
 		 183 aa  62.4  0.000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3795  nitroreductase  25.86 
 
 		 185 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000177685 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0973  nitroreductase  25 
 
 		 348 aa  62  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2708  nitroreductase family protein  27.65 
 
 		 182 aa  62  0.000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0787  nitroreductase family protein  27.62 
 
 		 177 aa  61.2  0.000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0290068  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002916  protein ydjA  23.26 
 
 		 182 aa  61.2  0.000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1923  nitroreductase family protein  27.47 
 
 		 207 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4506  nitroreductase  27.01 
 
 		 185 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0671  nitroreductase family protein  27.47 
 
 		 207 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1783  nitroreductase family protein  27.47 
 
 		 207 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2050  nitroreductase family protein  27.47 
 
 		 207 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2209  hypothetical protein  24.74 
 
 		 183 aa  60.5  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.601257  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1405  nitroreductase  27.01 
 
 		 185 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.000113316  normal  0.729658 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0775  nitroreductase family protein  27.47 
 
 		 207 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2043  nitroreductase family protein  27.47 
 
 		 207 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.144976  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1068  nitroreductase family protein  27.47 
 
 		 207 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7221  nitroreductase  24.59 
 
 		 221 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2590  nitroreductase family protein  24.49 
 
 		 198 aa  59.7  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.236049  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1532  nitroreductase  27.5 
 
 		 182 aa  60.1  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2747  nitroreductase  28.74 
 
 		 182 aa  59.3  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.501163 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4012  nitroreductase  25.86 
 
 		 185 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.147997  hitchhiker  0.000154736 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1600  nitroreductase  30.06 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0930  nitroreductase  25.29 
 
 		 235 aa  58.9  0.00000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00302341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  23.28 
 
 		 190 aa  58.2  0.00000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1617  nitroreductase  22.92 
 
 		 183 aa  57.8  0.00000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1856  nitroreductase  25.76 
 
 		 350 aa  57.8  0.00000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01646  putative nitroreductase  24.85 
 
 		 183 aa  57.4  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00644737  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0837  nitroreductase family protein  33.33 
 
 		 151 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.89702e-58 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2468  nitroreductase family protein  30.56 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.797111  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1981  hypothetical protein  23.3 
 
 		 183 aa  56.2  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000959579  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1095  nitroreductase  25.7 
 
 		 219 aa  57  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.42931 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2345  hypothetical protein  23.3 
 
 		 183 aa  56.2  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000126395  hitchhiker  0.00560319 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  27.42 
 
 		 167 aa  56.2  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0221  nitroreductase  28.4 
 
 		 180 aa  56.2  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.602782  normal  0.0189765 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  26.23 
 
 		 170 aa  55.8  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2090  hypothetical protein  23.3 
 
 		 183 aa  56.2  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.363519  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1720  nitroreductase  24 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4125  nitroreductase  33.57 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2187  nitroreductase  24.59 
 
 		 173 aa  55.5  0.0000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.530109 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1967  hypothetical protein  24.71 
 
 		 183 aa  55.1  0.0000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>