120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1301 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1301  nitroreductase  100 
 
 		 195 aa  399  9.999999999999999e-111  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13071  hypothetical protein  36.14 
 
 		 183 aa  107  9.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.212182  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0053  nitroreductase  36.52 
 
 		 188 aa  105  5e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0498  hypothetical protein  37.72 
 
 		 183 aa  102  2e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.228432  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_12251  hypothetical protein  37.13 
 
 		 183 aa  100  1e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36608  predicted protein  32.85 
 
 		 347 aa  86.7  2e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.236222  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0644  nitroreductase  31.98 
 
 		 186 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1628  nitroreductase  32.72 
 
 		 207 aa  77.8  0.00000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.627423 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1600  nitroreductase  30 
 
 		 192 aa  75.1  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0821  nitroreductase family protein  30.23 
 
 		 186 aa  75.5  0.0000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0667  nitroreductase family protein  29.65 
 
 		 186 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0831  nitroreductase family protein  29.65 
 
 		 186 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.046086  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0679  nitroreductase family protein  29.65 
 
 		 186 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0679  nitroreductase  29.89 
 
 		 186 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0730  nitroreductase family protein  29.65 
 
 		 186 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0766  nitroreductase family protein  29.65 
 
 		 186 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3073  nitroreductase  30.39 
 
 		 201 aa  72.4  0.000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000978726  normal  0.396217 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0928  nitroreductase family protein  29.07 
 
 		 186 aa  72.4  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4513  nitroreductase family protein  29.65 
 
 		 186 aa  72  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000206463 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2428  nitroreductase  32 
 
 		 200 aa  71.6  0.000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3170  nitroreductase  30.16 
 
 		 210 aa  68.6  0.00000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1665  nitroreductase  30.39 
 
 		 182 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4738  nitroreductase  32.57 
 
 		 184 aa  65.5  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1800  nitroreductase  27.96 
 
 		 182 aa  65.1  0.0000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.493936  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1808  nitroreductase  27.96 
 
 		 182 aa  64.7  0.0000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2478  nitroreductase  27.96 
 
 		 182 aa  64.7  0.0000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.981358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2170  nitroreductase  27.89 
 
 		 204 aa  64.7  0.0000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1847  nitroreductase  27.96 
 
 		 182 aa  64.3  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1291  nitroreductase  28.17 
 
 		 191 aa  63.2  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2649  nitroreductase  30.16 
 
 		 192 aa  63.2  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2304  nitroreductase  28.95 
 
 		 182 aa  62  0.000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0131618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2494  nitroreductase  27.63 
 
 		 182 aa  59.3  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.838709  hitchhiker  0.00693244 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2374  nitroreductase  27.63 
 
 		 182 aa  58.9  0.00000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.611093  normal  0.915737 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04940  Nitroreductase family protein  28.66 
 
 		 185 aa  58.2  0.00000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.680935  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1833  nitroreductase  27.54 
 
 		 182 aa  58.5  0.00000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0967243  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2708  nitroreductase family protein  27.63 
 
 		 182 aa  57.8  0.00000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3795  nitroreductase  27.34 
 
 		 185 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000177685 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1740  nitroreductase  25.41 
 
 		 182 aa  56.6  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4506  nitroreductase  26.62 
 
 		 185 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1828  nitroreductase  26.97 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1405  nitroreductase  26.62 
 
 		 185 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.000113316  normal  0.729658 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4012  nitroreductase  26.62 
 
 		 185 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.147997  hitchhiker  0.000154736 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  23.66 
 
 		 190 aa  55.5  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1919  hypothetical protein  26.72 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36390  nitroreductase  32.62 
 
 		 199 aa  54.7  0.0000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22710  hypothetical protein  25.95 
 
 		 186 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0282238 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0639  nitroreductase  27.42 
 
 		 161 aa  53.9  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7221  nitroreductase  27.89 
 
 		 221 aa  53.1  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0545  nitroreductase  25.83 
 
 		 172 aa  52.8  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.361368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1532  nitroreductase  26.74 
 
 		 182 aa  52.4  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002916  protein ydjA  24.04 
 
 		 182 aa  51.6  0.000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1390  hypothetical protein  24.84 
 
 		 183 aa  51.2  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.184229  normal  0.505181 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2050  hypothetical protein  24.84 
 
 		 183 aa  51.2  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.658191  normal  0.425687 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2747  nitroreductase  25.81 
 
 		 182 aa  50.4  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.501163 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01734  predicted oxidoreductase  24.84 
 
 		 183 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00353733  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1877  nitroreductase  24.84 
 
 		 183 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000380394  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1480  nitroreductase  25.35 
 
 		 188 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0228393  normal  0.126132 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1469  nitroreductase  30.88 
 
 		 188 aa  50.4  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0566  hypothetical protein  28 
 
 		 182 aa  49.7  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.121072  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0829  nitroreductase  29.2 
 
 		 179 aa  50.1  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.12062  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0846  nitroreductase  29.2 
 
 		 179 aa  50.1  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0164733  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1849  hypothetical protein  24.84 
 
 		 183 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000672951  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1988  hypothetical protein  24.84 
 
 		 183 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00470911  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1867  hypothetical protein  24.84 
 
 		 183 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0147803  decreased coverage  0.00000404862 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2020  hypothetical protein  24.84 
 
 		 183 aa  50.1  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000242439  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1407  hypothetical protein  24.22 
 
 		 183 aa  50.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0175478  normal  0.348646 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1423  hypothetical protein  24.22 
 
 		 183 aa  50.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.566409 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2485  hypothetical protein  24.84 
 
 		 183 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.175131  normal  0.297695 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01722  hypothetical protein  24.84 
 
 		 183 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00796019  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2315  nitroreductase  26.04 
 
 		 182 aa  49.3  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1426  hypothetical protein  24.84 
 
 		 183 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00297236  normal  0.808801 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1981  hypothetical protein  26.06 
 
 		 183 aa  49.3  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000959579  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2345  hypothetical protein  26.06 
 
 		 183 aa  49.3  0.00004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000126395  hitchhiker  0.00560319 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2090  hypothetical protein  26.06 
 
 		 183 aa  48.9  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.363519  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1354  nitroreductase  25.47 
 
 		 186 aa  48.9  0.00005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000836569  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1450  nitroreductase  26.21 
 
 		 192 aa  48.5  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.761824  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1971  hypothetical protein  25.15 
 
 		 183 aa  47.4  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.3707  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3161  nitroreductase  25.13 
 
 		 195 aa  47.4  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.497099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10311  oxidoreductase  27.59 
 
 		 223 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.655212 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1879  hypothetical protein  23.6 
 
 		 183 aa  47.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000572902  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1617  nitroreductase  24.11 
 
 		 183 aa  46.6  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2267  hypothetical protein  27.54 
 
 		 183 aa  47  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0266  nitroreductase  24.59 
 
 		 187 aa  47  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01646  putative nitroreductase  23.53 
 
 		 183 aa  47  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00644737  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5045  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  26.74 
 
 		 584 aa  46.6  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.87863  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4783  nitroreductase  26.5 
 
 		 217 aa  46.2  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0866516 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  24.43 
 
 		 177 aa  45.8  0.0004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1682  hypothetical protein  25.9 
 
 		 183 aa  45.8  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.5074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4233  nitroreductase  25.37 
 
 		 209 aa  45.8  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.064349  normal  0.419848 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2209  hypothetical protein  24.39 
 
 		 183 aa  45.8  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.601257  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0019  nitroreductase  21.35 
 
 		 196 aa  45.1  0.0006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3592  nitroreductase  25 
 
 		 186 aa  45.1  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0449801  normal  0.683239 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4125  nitroreductase  27.43 
 
 		 186 aa  45.1  0.0007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0837  nitroreductase family protein  28.1 
 
 		 151 aa  45.1  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.89702e-58 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2175  nitroreductase  26.52 
 
 		 188 aa  44.7  0.0008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0482  nitroreductase family protein  20.11 
 
 		 180 aa  44.7  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1448  hypothetical protein  28.4 
 
 		 176 aa  44.3  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.848866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3956  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  25.28 
 
 		 230 aa  44.3  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.733345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1891  nitroreductase  24.29 
 
 		 182 aa  43.9  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0706  nitroreductase  25.41 
 
 		 168 aa  43.5  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.272775 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>