More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1600 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1600  nitroreductase  100 
 
 		 192 aa  403  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1450  nitroreductase  41.75 
 
 		 192 aa  145  3e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.761824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2649  nitroreductase  41.18 
 
 		 192 aa  137  7.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04940  Nitroreductase family protein  39.04 
 
 		 185 aa  134  6.0000000000000005e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.680935  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2428  nitroreductase  39.78 
 
 		 200 aa  134  9e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1628  nitroreductase  34.38 
 
 		 207 aa  119  1.9999999999999998e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.627423 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3073  nitroreductase  38.95 
 
 		 201 aa  116  1.9999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000978726  normal  0.396217 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3170  nitroreductase  33.33 
 
 		 210 aa  105  4e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1061  nitroreductase  27.62 
 
 		 208 aa  92.8  3e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.425769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1291  nitroreductase  31.58 
 
 		 191 aa  90.5  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0928  nitroreductase family protein  31.55 
 
 		 186 aa  90.1  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4513  nitroreductase family protein  31.02 
 
 		 186 aa  89.7  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000206463 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0730  nitroreductase family protein  31.02 
 
 		 186 aa  88.6  5e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0766  nitroreductase family protein  31.02 
 
 		 186 aa  88.6  5e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0831  nitroreductase family protein  31.02 
 
 		 186 aa  88.6  6e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.046086  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0679  nitroreductase family protein  31.02 
 
 		 186 aa  88.6  6e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1354  nitroreductase  30.49 
 
 		 186 aa  88.2  6e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000836569  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0679  nitroreductase  29.03 
 
 		 186 aa  88.2  6e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0667  nitroreductase family protein  31.02 
 
 		 186 aa  87  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2747  nitroreductase  33.12 
 
 		 182 aa  86.3  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.501163 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0644  nitroreductase  29.73 
 
 		 186 aa  86.7  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002916  protein ydjA  28.74 
 
 		 182 aa  86.3  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0821  nitroreductase family protein  28.49 
 
 		 186 aa  85.9  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0566  hypothetical protein  30.22 
 
 		 182 aa  85.5  4e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.121072  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0450  nitroreductase  27.37 
 
 		 187 aa  85.1  6e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.58966 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1665  nitroreductase  31.72 
 
 		 182 aa  84.7  8e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1919  hypothetical protein  29.41 
 
 		 186 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4738  nitroreductase  33.14 
 
 		 184 aa  83.6  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2209  hypothetical protein  28.87 
 
 		 183 aa  83.6  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.601257  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2090  hypothetical protein  28.87 
 
 		 183 aa  82  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.363519  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1967  hypothetical protein  28.57 
 
 		 183 aa  82  0.000000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2721  hypothetical protein  28.03 
 
 		 183 aa  81.6  0.000000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.6916  hitchhiker  0.00284611 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2674  nitroreductase  29.05 
 
 		 194 aa  81.6  0.000000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1981  hypothetical protein  29.58 
 
 		 183 aa  81.6  0.000000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000959579  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2345  hypothetical protein  29.58 
 
 		 183 aa  81.6  0.000000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000126395  hitchhiker  0.00560319 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2170  nitroreductase  28.8 
 
 		 204 aa  81.3  0.000000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2494  nitroreductase  31.03 
 
 		 182 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.838709  hitchhiker  0.00693244 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1818  nitroreductase  28.14 
 
 		 208 aa  79.7  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0266  nitroreductase  26.06 
 
 		 187 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2304  nitroreductase  30.34 
 
 		 182 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0131618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22710  hypothetical protein  29.27 
 
 		 186 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0282238 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2374  nitroreductase  30.34 
 
 		 182 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.611093  normal  0.915737 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01734  predicted oxidoreductase  29.58 
 
 		 183 aa  79  0.00000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00353733  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1877  nitroreductase  29.58 
 
 		 183 aa  79  0.00000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000380394  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1867  hypothetical protein  29.58 
 
 		 183 aa  79  0.00000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0147803  decreased coverage  0.00000404862 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1988  hypothetical protein  29.58 
 
 		 183 aa  79  0.00000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00470911  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01722  hypothetical protein  29.58 
 
 		 183 aa  79  0.00000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00796019  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2020  hypothetical protein  29.58 
 
 		 183 aa  79  0.00000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000242439  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1849  hypothetical protein  29.58 
 
 		 183 aa  79  0.00000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000672951  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2485  hypothetical protein  29.58 
 
 		 183 aa  79  0.00000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.175131  normal  0.297695 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1426  hypothetical protein  29.58 
 
 		 183 aa  79  0.00000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00297236  normal  0.808801 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1783  nitroreductase family protein  23.78 
 
 		 207 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2050  nitroreductase family protein  23.78 
 
 		 207 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1068  nitroreductase family protein  23.78 
 
 		 207 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0775  nitroreductase family protein  23.78 
 
 		 207 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2043  nitroreductase family protein  23.78 
 
 		 207 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.144976  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0671  nitroreductase family protein  23.78 
 
 		 207 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0762  nitroreductase family protein  23.78 
 
 		 207 aa  77.8  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6294  nitroreductase  26.67 
 
 		 187 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167962  normal  0.193293 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1800  nitroreductase  29.11 
 
 		 182 aa  77  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.493936  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2708  nitroreductase family protein  31.03 
 
 		 182 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5206  hypothetical protein  26.51 
 
 		 187 aa  76.6  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.130059 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2199  nitroreductase  28.32 
 
 		 188 aa  76.6  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.654603 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1923  nitroreductase family protein  26.14 
 
 		 207 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1847  nitroreductase  29.75 
 
 		 182 aa  77  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3262  nitroreductase  25.6 
 
 		 191 aa  76.3  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.561471  normal  0.0279896 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1971  hypothetical protein  27.46 
 
 		 183 aa  76.3  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.3707  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1682  hypothetical protein  29.58 
 
 		 183 aa  75.9  0.0000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.5074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2267  hypothetical protein  27.46 
 
 		 183 aa  76.3  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2036  nitroreductase  24.7 
 
 		 187 aa  75.9  0.0000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.378927  normal  0.848302 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1891  nitroreductase  29.33 
 
 		 182 aa  75.5  0.0000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1740  nitroreductase  30.19 
 
 		 182 aa  75.1  0.0000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1301  nitroreductase  30 
 
 		 195 aa  75.1  0.0000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2478  nitroreductase  29.11 
 
 		 182 aa  75.1  0.0000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.981358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1808  nitroreductase  29.11 
 
 		 182 aa  75.1  0.0000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2164  nitroreductase  25 
 
 		 190 aa  74.7  0.0000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1833  nitroreductase  28.17 
 
 		 182 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0967243  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1532  nitroreductase  27.46 
 
 		 182 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03042  hypothetical protein  29.67 
 
 		 182 aa  73.6  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1668  nitroreductase  23.49 
 
 		 187 aa  72  0.000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.145589  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7221  nitroreductase  25.87 
 
 		 221 aa  71.2  0.000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1617  nitroreductase  26.76 
 
 		 183 aa  70.9  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1828  nitroreductase  25.27 
 
 		 186 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1457  nitroreductase family protein  27.74 
 
 		 182 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1407  hypothetical protein  28.17 
 
 		 183 aa  69.7  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0175478  normal  0.348646 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1390  hypothetical protein  28.17 
 
 		 183 aa  70.1  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.184229  normal  0.505181 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1423  hypothetical protein  28.17 
 
 		 183 aa  69.7  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.566409 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1101  nitroreductase  24.85 
 
 		 193 aa  69.7  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1879  hypothetical protein  28.17 
 
 		 183 aa  69.7  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000572902  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2050  hypothetical protein  28.17 
 
 		 183 aa  69.7  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.658191  normal  0.425687 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2315  nitroreductase  26.95 
 
 		 182 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1287  aldehyde dehydrogenase  25.29 
 
 		 219 aa  68.9  0.00000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1095  nitroreductase  24.59 
 
 		 219 aa  68.6  0.00000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.42931 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1140  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  28.26 
 
 		 269 aa  68.2  0.00000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0290509  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7206  nitroreductase  26.59 
 
 		 187 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.347325  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01646  putative nitroreductase  25.35 
 
 		 183 aa  67.8  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00644737  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2468  nitroreductase family protein  24.14 
 
 		 216 aa  67  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.797111  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4233  nitroreductase  25 
 
 		 209 aa  67  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.064349  normal  0.419848 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3888  nitroreductase  25.64 
 
 		 169 aa  66.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1008  nitroreductase  26.44 
 
 		 199 aa  66.2  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>