197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0482 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0482  nitroreductase family protein  100 
 
 		 180 aa  376  1e-103  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0829  nitroreductase  73.74 
 
 		 179 aa  283  5.999999999999999e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.12062  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0846  nitroreductase  73.74 
 
 		 179 aa  283  5.999999999999999e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0164733  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0831  nitroreductase family protein  28.99 
 
 		 186 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.046086  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0679  nitroreductase family protein  28.99 
 
 		 186 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0730  nitroreductase family protein  28.99 
 
 		 186 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0667  nitroreductase family protein  28.99 
 
 		 186 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0766  nitroreductase family protein  28.99 
 
 		 186 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0928  nitroreductase family protein  28.99 
 
 		 186 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4513  nitroreductase family protein  27.81 
 
 		 186 aa  78.6  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000206463 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0821  nitroreductase family protein  27.22 
 
 		 186 aa  77  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0644  nitroreductase  26.32 
 
 		 186 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0679  nitroreductase  26.04 
 
 		 186 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0639  nitroreductase  30 
 
 		 161 aa  70.1  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  27.22 
 
 		 190 aa  67  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4506  nitroreductase  25.81 
 
 		 185 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1354  nitroreductase  27.22 
 
 		 186 aa  65.9  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000836569  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0266  nitroreductase  25.7 
 
 		 187 aa  65.9  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4012  nitroreductase  25.27 
 
 		 185 aa  65.1  0.0000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.147997  hitchhiker  0.000154736 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1405  nitroreductase  25.81 
 
 		 185 aa  65.1  0.0000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.000113316  normal  0.729658 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1919  hypothetical protein  27.51 
 
 		 186 aa  65.1  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3754  nitroreductase  28.21 
 
 		 205 aa  64.7  0.0000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.951056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3795  nitroreductase  27.27 
 
 		 185 aa  64.3  0.0000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000177685 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3921  nitroreductase  29.27 
 
 		 300 aa  64.3  0.0000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.159011  normal  0.0804264 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1291  nitroreductase  23.81 
 
 		 191 aa  63.5  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22710  hypothetical protein  27.37 
 
 		 186 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0282238 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2674  nitroreductase  29.27 
 
 		 194 aa  63.5  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1967  hypothetical protein  25.67 
 
 		 183 aa  62.4  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0671  nitroreductase family protein  28.76 
 
 		 207 aa  62  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1783  nitroreductase family protein  30.07 
 
 		 207 aa  62  0.000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2050  nitroreductase family protein  30.07 
 
 		 207 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0775  nitroreductase family protein  30.07 
 
 		 207 aa  62  0.000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1068  nitroreductase family protein  30.07 
 
 		 207 aa  62  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2043  nitroreductase family protein  30.07 
 
 		 207 aa  62  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.144976  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0762  nitroreductase family protein  28.76 
 
 		 207 aa  61.2  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1061  nitroreductase  26.06 
 
 		 208 aa  60.8  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.425769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1828  nitroreductase  23.78 
 
 		 186 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2170  nitroreductase  26.23 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002916  protein ydjA  22.83 
 
 		 182 aa  58.9  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2209  hypothetical protein  25.3 
 
 		 183 aa  58.5  0.00000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.601257  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7221  nitroreductase  28.85 
 
 		 221 aa  57.8  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1923  nitroreductase family protein  27.45 
 
 		 207 aa  57  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15580  Nitroreductase  27.13 
 
 		 186 aa  57  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.978849  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1480  nitroreductase  22.6 
 
 		 188 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0228393  normal  0.126132 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1523  NAD(P)H-flavin oxidoreductase, putative  27.08 
 
 		 191 aa  56.6  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1971  hypothetical protein  24.39 
 
 		 183 aa  55.5  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.3707  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  26.56 
 
 		 187 aa  55.5  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2267  hypothetical protein  24.39 
 
 		 183 aa  55.5  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0566  hypothetical protein  24.29 
 
 		 182 aa  55.1  0.0000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.121072  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4233  nitroreductase  28.03 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.064349  normal  0.419848 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03042  hypothetical protein  24.59 
 
 		 182 aa  54.3  0.0000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1800  nitroreductase  24.39 
 
 		 208 aa  53.5  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2164  nitroreductase  26.06 
 
 		 190 aa  53.9  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0450  nitroreductase  21.88 
 
 		 187 aa  53.5  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.58966 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13071  hypothetical protein  25.44 
 
 		 183 aa  52.8  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.212182  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0698  nitroreductase  25.13 
 
 		 193 aa  52.8  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.129667 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1891  nitroreductase  21.35 
 
 		 182 aa  52.4  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1720  nitroreductase  25.79 
 
 		 196 aa  52.4  0.000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1101  nitroreductase  22.64 
 
 		 193 aa  52  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0077  nitroreductase  25 
 
 		 196 aa  52.4  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1903  nitroreductase  25.13 
 
 		 185 aa  51.6  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1628  nitroreductase  26.16 
 
 		 207 aa  52  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.627423 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2592  nitroreductase  26.35 
 
 		 195 aa  51.2  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.28104 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  27.68 
 
 		 178 aa  51.2  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1056  nitroreductase  22.16 
 
 		 195 aa  51.2  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.545888 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2345  hypothetical protein  21.12 
 
 		 183 aa  50.8  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000126395  hitchhiker  0.00560319 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1981  hypothetical protein  21.12 
 
 		 183 aa  50.8  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000959579  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2317  nitroreductase  26.35 
 
 		 197 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.844939  normal  0.193364 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0837  nitroreductase family protein  27.56 
 
 		 151 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.89702e-58 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1495  hypothetical protein  22.99 
 
 		 187 aa  50.4  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0669321 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2220  nitroreductase family protein  24.39 
 
 		 194 aa  50.4  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.605376  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2090  hypothetical protein  21.12 
 
 		 183 aa  50.8  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.363519  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1833  nitroreductase  24.84 
 
 		 182 aa  50.8  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0967243  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04578  nitroreductase family  24.18 
 
 		 191 aa  50.8  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2747  nitroreductase  22.7 
 
 		 182 aa  50.4  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.501163 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1600  nitroreductase  23.7 
 
 		 192 aa  50.4  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3592  nitroreductase  23.28 
 
 		 186 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0449801  normal  0.683239 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0498  hypothetical protein  25.45 
 
 		 183 aa  49.7  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.228432  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04940  Nitroreductase family protein  28.9 
 
 		 185 aa  50.1  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.680935  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  25.27 
 
 		 167 aa  49.3  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1818  nitroreductase  22.31 
 
 		 208 aa  49.3  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_12251  hypothetical protein  25.45 
 
 		 183 aa  49.3  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1763  nitroreductase  25.53 
 
 		 190 aa  49.3  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01734  predicted oxidoreductase  22.42 
 
 		 183 aa  48.5  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00353733  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1877  nitroreductase  22.42 
 
 		 183 aa  48.5  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000380394  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1849  hypothetical protein  22.42 
 
 		 183 aa  48.5  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000672951  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01722  hypothetical protein  22.42 
 
 		 183 aa  48.5  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00796019  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2036  nitroreductase  24.86 
 
 		 187 aa  48.9  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.378927  normal  0.848302 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1867  hypothetical protein  22.42 
 
 		 183 aa  48.5  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0147803  decreased coverage  0.00000404862 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1426  hypothetical protein  22.42 
 
 		 183 aa  48.9  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00297236  normal  0.808801 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1988  hypothetical protein  22.42 
 
 		 183 aa  48.5  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00470911  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2485  hypothetical protein  22.42 
 
 		 183 aa  48.5  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.175131  normal  0.297695 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2020  hypothetical protein  22.42 
 
 		 183 aa  48.9  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000242439  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2975  nitroreductase  23.75 
 
 		 169 aa  48.5  0.00005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.522963 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2721  hypothetical protein  23.87 
 
 		 183 aa  48.1  0.00007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.6916  hitchhiker  0.00284611 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1665  nitroreductase  22.76 
 
 		 182 aa  48.1  0.00007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  28.22 
 
 		 184 aa  47.8  0.00008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0470  nitroreductase  26.86 
 
 		 171 aa  47.4  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5206  hypothetical protein  24.69 
 
 		 187 aa  47.8  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.130059 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0953  nitroreductase  23.12 
 
 		 193 aa  47  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.102151  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>