160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_0846 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_0829  nitroreductase  100 
 
 
179 aa  373  1e-103  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.12062  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0846  nitroreductase  100 
 
 
179 aa  373  1e-103  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0164733  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0482  nitroreductase family protein  73.74 
 
 
180 aa  283  5.999999999999999e-76  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0831  nitroreductase family protein  31.21 
 
 
186 aa  85.1  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.046086  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0679  nitroreductase family protein  31.21 
 
 
186 aa  85.1  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0730  nitroreductase family protein  31.21 
 
 
186 aa  85.1  5e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0766  nitroreductase family protein  31.21 
 
 
186 aa  85.1  5e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0928  nitroreductase family protein  31.21 
 
 
186 aa  84.7  7e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0667  nitroreductase family protein  31.21 
 
 
186 aa  84.3  9e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4513  nitroreductase family protein  30.51 
 
 
186 aa  83.6  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000206463 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0644  nitroreductase  30.67 
 
 
186 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0821  nitroreductase family protein  29.3 
 
 
186 aa  82.4  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0679  nitroreductase  28.03 
 
 
186 aa  77.8  0.00000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1291  nitroreductase  24.85 
 
 
191 aa  65.5  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0639  nitroreductase  28.9 
 
 
161 aa  65.1  0.0000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1828  nitroreductase  27.53 
 
 
186 aa  62  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0077  nitroreductase  31.46 
 
 
196 aa  61.6  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1354  nitroreductase  30.56 
 
 
186 aa  60.1  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000836569  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2674  nitroreductase  27.04 
 
 
194 aa  59.7  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  27.13 
 
 
190 aa  59.3  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3795  nitroreductase  26.95 
 
 
185 aa  58.5  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000000177685 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1101  nitroreductase  25.17 
 
 
193 aa  58.2  0.00000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1923  nitroreductase family protein  28.36 
 
 
207 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1061  nitroreductase  24.49 
 
 
208 aa  57.4  0.00000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.425769  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4506  nitroreductase  26.74 
 
 
185 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4012  nitroreductase  26.16 
 
 
185 aa  57  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.147997  hitchhiker  0.000154736 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1405  nitroreductase  26.74 
 
 
185 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.000113316  normal  0.729658 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3754  nitroreductase  27.66 
 
 
205 aa  57.4  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.951056  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0837  nitroreductase family protein  28.35 
 
 
151 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.89702e-58 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0266  nitroreductase  27.12 
 
 
187 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2969  nitroreductase  26.85 
 
 
235 aa  56.6  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.788882  normal  0.0360376 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0762  nitroreductase family protein  27.52 
 
 
207 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  27.47 
 
 
176 aa  56.2  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2170  nitroreductase  27.96 
 
 
204 aa  56.2  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1532  nitroreductase  22.46 
 
 
182 aa  55.5  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04940  Nitroreductase family protein  30.06 
 
 
185 aa  55.5  0.0000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.680935  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3921  nitroreductase  27.21 
 
 
300 aa  55.5  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.159011  normal  0.0804264 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0671  nitroreductase family protein  26.8 
 
 
207 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1783  nitroreductase family protein  25.68 
 
 
207 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2050  nitroreductase family protein  26.8 
 
 
207 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0775  nitroreductase family protein  25.68 
 
 
207 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1068  nitroreductase family protein  25.68 
 
 
207 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2043  nitroreductase family protein  25.68 
 
 
207 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.144976  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1033  nitroreductase family protein  25.49 
 
 
194 aa  54.7  0.0000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.680081  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4233  nitroreductase  29.25 
 
 
209 aa  54.3  0.0000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.064349  normal  0.419848 
 
 
-
 
NC_004310  BR1069  nitroreductase family protein  26.49 
 
 
194 aa  53.9  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.600572  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0566  hypothetical protein  22.99 
 
 
182 aa  53.9  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.121072  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1967  hypothetical protein  22.36 
 
 
183 aa  53.5  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2036  nitroreductase  28.11 
 
 
187 aa  53.1  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.378927  normal  0.848302 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3888  nitroreductase  25.33 
 
 
169 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2388  nitroreductase  23.83 
 
 
226 aa  52.4  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1600  nitroreductase  25.84 
 
 
192 aa  52.8  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5206  hypothetical protein  28.32 
 
 
187 aa  52.8  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.130059 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1919  hypothetical protein  27.22 
 
 
186 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0450  nitroreductase  25.95 
 
 
187 aa  52  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.58966 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002916  protein ydjA  26.14 
 
 
182 aa  52  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7221  nitroreductase  26.32 
 
 
221 aa  51.6  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0698  nitroreductase  25 
 
 
193 aa  51.6  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.129667 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0953  nitroreductase  26.16 
 
 
193 aa  51.2  0.000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.102151  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3592  nitroreductase  26.06 
 
 
186 aa  51.2  0.000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0449801  normal  0.683239 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1665  nitroreductase  25.33 
 
 
182 aa  51.2  0.000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2267  hypothetical protein  23.93 
 
 
183 aa  51.2  0.000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1971  hypothetical protein  24.26 
 
 
183 aa  51.2  0.000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.3707  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1480  nitroreductase  27.06 
 
 
188 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0228393  normal  0.126132 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2220  nitroreductase family protein  25 
 
 
194 aa  50.8  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.605376  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1523  NAD(P)H-flavin oxidoreductase, putative  25.27 
 
 
191 aa  50.8  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22710  hypothetical protein  26.77 
 
 
186 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0282238 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2494  nitroreductase  23.03 
 
 
182 aa  50.8  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.838709  hitchhiker  0.00693244 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1818  nitroreductase  24.52 
 
 
208 aa  50.8  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1287  aldehyde dehydrogenase  22.35 
 
 
219 aa  49.7  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1668  nitroreductase  27.68 
 
 
187 aa  49.7  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.145589  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1095  nitroreductase  23.53 
 
 
219 aa  50.1  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.42931 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15580  Nitroreductase  27.47 
 
 
186 aa  50.1  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.978849  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1301  nitroreductase  29.2 
 
 
195 aa  50.1  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1802  nitroreductase family protein  25 
 
 
186 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.649607  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1981  hypothetical protein  21.74 
 
 
183 aa  49.3  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000959579  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2090  hypothetical protein  21.74 
 
 
183 aa  49.3  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.363519  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  27.11 
 
 
184 aa  49.3  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2345  hypothetical protein  21.74 
 
 
183 aa  49.3  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000126395  hitchhiker  0.00560319 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2374  nitroreductase  22.37 
 
 
182 aa  48.9  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.611093  normal  0.915737 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1800  nitroreductase  22.67 
 
 
208 aa  48.9  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2304  nitroreductase  21.94 
 
 
182 aa  48.5  0.00005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0131618  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13071  hypothetical protein  24.4 
 
 
183 aa  48.5  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.212182  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2428  nitroreductase  26.17 
 
 
200 aa  48.5  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01930  nitroreductase  27.27 
 
 
181 aa  48.5  0.00005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2721  hypothetical protein  22.22 
 
 
183 aa  48.5  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.6916  hitchhiker  0.00284611 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1847  nitroreductase  22.58 
 
 
182 aa  48.5  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0053  nitroreductase  27.54 
 
 
188 aa  48.1  0.00007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  30.88 
 
 
187 aa  48.1  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1628  nitroreductase  26.92 
 
 
207 aa  47.8  0.00008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.627423 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2209  hypothetical protein  21.12 
 
 
183 aa  47.8  0.00008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.601257  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1800  nitroreductase  21.71 
 
 
182 aa  47.8  0.00008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.493936  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2627  hypothetical protein  24.1 
 
 
216 aa  47.8  0.00008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.632412  normal  0.0266361 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1270  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  26.14 
 
 
216 aa  47.8  0.00009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2152  nitroreductase  23.03 
 
 
195 aa  47.8  0.00009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2478  nitroreductase  21.71 
 
 
182 aa  47.4  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.981358  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0695  nitroreductase  26.09 
 
 
192 aa  47  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.264494  normal  0.0160033 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1808  nitroreductase  21.71 
 
 
182 aa  47.4  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1891  nitroreductase  19.38 
 
 
182 aa  47.4  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0930  nitroreductase  23.49 
 
 
235 aa  47  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00302341  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>