159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0695 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0695  nitroreductase  100 
 
 		 192 aa  388  1e-107  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.264494  normal  0.0160033 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0371  nitroreductase  59.47 
 
 		 192 aa  220  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.767422  normal  0.408673 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2466  nitroreductase  59.47 
 
 		 192 aa  215  2e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.294476 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0809  hypothetical protein  58.95 
 
 		 192 aa  214  7e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2627  hypothetical protein  62.03 
 
 		 216 aa  206  1e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.632412  normal  0.0266361 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3161  nitroreductase  52.13 
 
 		 195 aa  181  5.0000000000000004e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.497099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3262  nitroreductase  41.58 
 
 		 191 aa  145  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.561471  normal  0.0279896 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1818  nitroreductase  43.92 
 
 		 208 aa  139  3e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1668  nitroreductase  41.76 
 
 		 187 aa  139  3.9999999999999997e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.145589  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2163  nitroreductase  43.45 
 
 		 169 aa  136  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0519328 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2175  nitroreductase  48.95 
 
 		 188 aa  135  3.0000000000000003e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2036  nitroreductase  39.56 
 
 		 187 aa  134  8e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.378927  normal  0.848302 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04578  nitroreductase family  43.09 
 
 		 191 aa  133  1.9999999999999998e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0266  nitroreductase  40.86 
 
 		 187 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6294  nitroreductase  42.02 
 
 		 187 aa  127  8.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167962  normal  0.193293 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0698  nitroreductase  42.39 
 
 		 193 aa  127  1.0000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.129667 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2220  nitroreductase family protein  39.68 
 
 		 194 aa  125  4.0000000000000003e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.605376  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5206  hypothetical protein  38.25 
 
 		 187 aa  125  5e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.130059 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2674  nitroreductase  38.95 
 
 		 194 aa  124  7e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0850  nitroreductase  40 
 
 		 191 aa  124  9e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.811499  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0968  hypothetical protein  39.44 
 
 		 191 aa  124  1e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1011  nitroreductase  38.71 
 
 		 212 aa  123  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2317  nitroreductase  41.24 
 
 		 197 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.844939  normal  0.193364 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3888  nitroreductase  40 
 
 		 169 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3754  nitroreductase  40.86 
 
 		 205 aa  119  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.951056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2152  nitroreductase  39.56 
 
 		 195 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1495  hypothetical protein  38.92 
 
 		 187 aa  119  3e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0669321 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2592  nitroreductase  40.76 
 
 		 195 aa  119  3e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.28104 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2271  nitroreductase  40.86 
 
 		 194 aa  117  7.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.800886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0450  nitroreductase  37.63 
 
 		 187 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.58966 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7206  nitroreductase  39.46 
 
 		 187 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.347325  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2042  nitroreductase  37.5 
 
 		 194 aa  115  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.258273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1056  nitroreductase  41.18 
 
 		 195 aa  115  5e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.545888 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1843  nitroreductase  39.57 
 
 		 194 aa  114  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.32071  normal  0.0306824 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3123  nitroreductase  40.76 
 
 		 187 aa  112  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1635  nitroreductase  41.53 
 
 		 187 aa  110  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.191312  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1069  nitroreductase family protein  37.89 
 
 		 194 aa  108  4.0000000000000004e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.600572  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1033  nitroreductase family protein  37.89 
 
 		 194 aa  107  1e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.680081  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1800  nitroreductase  34.52 
 
 		 208 aa  106  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0191  nitroreductase  37.91 
 
 		 217 aa  104  7e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.104049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2374  nitroreductase  34.29 
 
 		 182 aa  103  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.611093  normal  0.915737 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1061  nitroreductase  36.81 
 
 		 208 aa  103  1e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.425769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0077  nitroreductase  38.04 
 
 		 196 aa  104  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2304  nitroreductase  34.29 
 
 		 182 aa  103  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0131618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1740  nitroreductase  35.84 
 
 		 182 aa  103  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2494  nitroreductase  33.71 
 
 		 182 aa  102  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.838709  hitchhiker  0.00693244 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2478  nitroreductase  32.57 
 
 		 182 aa  100  9e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.981358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1808  nitroreductase  32.57 
 
 		 182 aa  100  9e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02400  nitroreductase  35.37 
 
 		 191 aa  100  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.305369  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1665  nitroreductase  32.57 
 
 		 182 aa  100  1e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1800  nitroreductase  32.57 
 
 		 182 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.493936  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1847  nitroreductase  32 
 
 		 182 aa  99.4  3e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1971  hypothetical protein  35.91 
 
 		 183 aa  97.1  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.3707  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2708  nitroreductase family protein  33.14 
 
 		 182 aa  96.7  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1617  nitroreductase  32.39 
 
 		 183 aa  94.7  7e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1891  nitroreductase  32.92 
 
 		 182 aa  94.7  8e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1802  nitroreductase family protein  34.97 
 
 		 186 aa  93.6  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.649607  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22710  hypothetical protein  39.63 
 
 		 186 aa  94  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0282238 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1833  nitroreductase  31.15 
 
 		 182 aa  94.4  1e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0967243  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0953  nitroreductase  34.24 
 
 		 193 aa  93.6  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.102151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0909  nitroreductase family protein  35.98 
 
 		 184 aa  92.8  2e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.968398  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2267  hypothetical protein  36.02 
 
 		 183 aa  92.8  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1919  hypothetical protein  39.02 
 
 		 186 aa  91.7  6e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2747  nitroreductase  32.72 
 
 		 182 aa  91.3  7e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.501163 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01734  predicted oxidoreductase  32.79 
 
 		 183 aa  89.7  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00353733  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1877  nitroreductase  32.79 
 
 		 183 aa  89.7  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000380394  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4506  nitroreductase  37.65 
 
 		 185 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4012  nitroreductase  37.04 
 
 		 185 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.147997  hitchhiker  0.000154736 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2485  hypothetical protein  32.79 
 
 		 183 aa  89.7  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.175131  normal  0.297695 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1867  hypothetical protein  32.79 
 
 		 183 aa  89.7  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0147803  decreased coverage  0.00000404862 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2020  hypothetical protein  32.79 
 
 		 183 aa  89.7  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000242439  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1405  nitroreductase  37.42 
 
 		 185 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.000113316  normal  0.729658 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1426  hypothetical protein  32.79 
 
 		 183 aa  89.7  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00297236  normal  0.808801 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1763  nitroreductase  32.26 
 
 		 190 aa  90.1  2e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1849  hypothetical protein  32.79 
 
 		 183 aa  89.7  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000672951  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1988  hypothetical protein  32.79 
 
 		 183 aa  89.7  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00470911  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01722  hypothetical protein  32.79 
 
 		 183 aa  89.7  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00796019  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3795  nitroreductase  35.84 
 
 		 185 aa  89.4  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000177685 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1828  nitroreductase  38.65 
 
 		 186 aa  88.6  5e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0566  hypothetical protein  30.98 
 
 		 182 aa  88.6  5e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.121072  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3592  nitroreductase  34.43 
 
 		 186 aa  88.2  6e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0449801  normal  0.683239 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002916  protein ydjA  29.35 
 
 		 182 aa  88.2  7e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2315  nitroreductase  34.16 
 
 		 182 aa  87  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1354  nitroreductase  34.91 
 
 		 186 aa  86.3  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000836569  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1532  nitroreductase  30.18 
 
 		 182 aa  86.7  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1457  nitroreductase family protein  34.86 
 
 		 182 aa  87  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7221  nitroreductase  35.54 
 
 		 221 aa  87  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01646  putative nitroreductase  30.68 
 
 		 183 aa  85.5  4e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00644737  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2209  hypothetical protein  33.95 
 
 		 183 aa  85.5  4e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.601257  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1390  hypothetical protein  32.1 
 
 		 183 aa  85.1  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.184229  normal  0.505181 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2050  hypothetical protein  32.1 
 
 		 183 aa  85.5  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.658191  normal  0.425687 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1407  hypothetical protein  32.1 
 
 		 183 aa  85.1  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0175478  normal  0.348646 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1423  hypothetical protein  32.1 
 
 		 183 aa  85.1  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.566409 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1879  hypothetical protein  32.3 
 
 		 183 aa  84.3  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000572902  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2721  hypothetical protein  33.95 
 
 		 183 aa  84  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.6916  hitchhiker  0.00284611 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0775  nitroreductase family protein  33.15 
 
 		 207 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1068  nitroreductase family protein  33.15 
 
 		 207 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0671  nitroreductase family protein  34.09 
 
 		 207 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2043  nitroreductase family protein  33.15 
 
 		 207 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.144976  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1967  hypothetical protein  33.13 
 
 		 183 aa  83.2  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>