180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2315 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_2315  nitroreductase  100 
 
 		 182 aa  369  1e-101  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1532  nitroreductase  71.43 
 
 		 182 aa  275  2e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2374  nitroreductase  68.68 
 
 		 182 aa  253  7e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.611093  normal  0.915737 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2304  nitroreductase  68.68 
 
 		 182 aa  253  8e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0131618  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2708  nitroreductase family protein  68.13 
 
 		 182 aa  253  9e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2494  nitroreductase  67.58 
 
 		 182 aa  251  5.000000000000001e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.838709  hitchhiker  0.00693244 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1665  nitroreductase  67.58 
 
 		 182 aa  251  5.000000000000001e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1808  nitroreductase  67.03 
 
 		 182 aa  248  2e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2478  nitroreductase  67.03 
 
 		 182 aa  248  2e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.981358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1847  nitroreductase  67.03 
 
 		 182 aa  248  4e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1800  nitroreductase  66.48 
 
 		 182 aa  245  2e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.493936  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1833  nitroreductase  65.93 
 
 		 182 aa  244  4e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0967243  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1891  nitroreductase  64.84 
 
 		 182 aa  242  1.9999999999999999e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1457  nitroreductase family protein  67.03 
 
 		 182 aa  239  2e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1740  nitroreductase  62.64 
 
 		 182 aa  236  2e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2747  nitroreductase  63.19 
 
 		 182 aa  231  4.0000000000000004e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.501163 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002916  protein ydjA  50.55 
 
 		 182 aa  178  4e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01734  predicted oxidoreductase  52.1 
 
 		 183 aa  177  9e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00353733  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1877  nitroreductase  52.1 
 
 		 183 aa  177  9e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000380394  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1867  hypothetical protein  52.1 
 
 		 183 aa  177  9e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0147803  decreased coverage  0.00000404862 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1988  hypothetical protein  52.1 
 
 		 183 aa  177  9e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00470911  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1849  hypothetical protein  52.1 
 
 		 183 aa  177  9e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000672951  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2485  hypothetical protein  52.1 
 
 		 183 aa  177  9e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.175131  normal  0.297695 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2020  hypothetical protein  52.1 
 
 		 183 aa  177  9e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000242439  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01722  hypothetical protein  52.1 
 
 		 183 aa  177  9e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00796019  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1682  hypothetical protein  53.89 
 
 		 183 aa  176  2e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.5074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1426  hypothetical protein  51.5 
 
 		 183 aa  175  3e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00297236  normal  0.808801 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0566  hypothetical protein  49.45 
 
 		 182 aa  174  7e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.121072  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1407  hypothetical protein  48.09 
 
 		 183 aa  172  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0175478  normal  0.348646 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1423  hypothetical protein  48.09 
 
 		 183 aa  172  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.566409 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1879  hypothetical protein  48.63 
 
 		 183 aa  172  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000572902  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2050  hypothetical protein  48.09 
 
 		 183 aa  171  5.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.658191  normal  0.425687 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1390  hypothetical protein  48.09 
 
 		 183 aa  171  6.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.184229  normal  0.505181 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2721  hypothetical protein  48.28 
 
 		 183 aa  169  3e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.6916  hitchhiker  0.00284611 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2209  hypothetical protein  52.1 
 
 		 183 aa  169  3e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.601257  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2590  nitroreductase family protein  46.11 
 
 		 198 aa  166  1e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.236049  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2090  hypothetical protein  45.9 
 
 		 183 aa  166  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.363519  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1971  hypothetical protein  47.9 
 
 		 183 aa  167  1e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.3707  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2345  hypothetical protein  45.36 
 
 		 183 aa  165  4e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000126395  hitchhiker  0.00560319 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1981  hypothetical protein  45.36 
 
 		 183 aa  165  4e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000959579  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2267  hypothetical protein  47.31 
 
 		 183 aa  164  6.9999999999999995e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1967  hypothetical protein  46.45 
 
 		 183 aa  161  5.0000000000000005e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3795  nitroreductase  47.98 
 
 		 185 aa  160  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000177685 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1617  nitroreductase  46.15 
 
 		 183 aa  159  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01646  putative nitroreductase  45.05 
 
 		 183 aa  159  2e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00644737  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4012  nitroreductase  47.4 
 
 		 185 aa  156  1e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.147997  hitchhiker  0.000154736 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4506  nitroreductase  47.4 
 
 		 185 aa  156  1e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1405  nitroreductase  47.4 
 
 		 185 aa  156  1e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.000113316  normal  0.729658 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03042  hypothetical protein  50.55 
 
 		 182 aa  154  5.0000000000000005e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02400  nitroreductase  48.45 
 
 		 191 aa  146  1.0000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.305369  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22710  hypothetical protein  45.45 
 
 		 186 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0282238 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1802  nitroreductase family protein  43.03 
 
 		 186 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.649607  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1354  nitroreductase  46.95 
 
 		 186 aa  138  4.999999999999999e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000836569  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3592  nitroreductase  41.82 
 
 		 186 aa  137  6e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0449801  normal  0.683239 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1919  hypothetical protein  44.24 
 
 		 186 aa  137  6e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1480  nitroreductase  43.03 
 
 		 188 aa  137  7e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0228393  normal  0.126132 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1828  nitroreductase  42.17 
 
 		 186 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15580  Nitroreductase  43.64 
 
 		 186 aa  123  1e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.978849  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2674  nitroreductase  42.42 
 
 		 194 aa  119  3e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7221  nitroreductase  39.88 
 
 		 221 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2199  nitroreductase  39.63 
 
 		 188 aa  118  3.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.654603 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3262  nitroreductase  41.42 
 
 		 191 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.561471  normal  0.0279896 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1668  nitroreductase  37.3 
 
 		 187 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.145589  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0909  nitroreductase family protein  38.65 
 
 		 184 aa  114  1.0000000000000001e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.968398  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1101  nitroreductase  38.46 
 
 		 193 aa  112  3e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5206  hypothetical protein  39.88 
 
 		 187 aa  112  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.130059 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2036  nitroreductase  37.36 
 
 		 187 aa  111  5e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.378927  normal  0.848302 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4233  nitroreductase  38.12 
 
 		 209 aa  110  9e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.064349  normal  0.419848 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1923  nitroreductase family protein  38.04 
 
 		 207 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2163  nitroreductase  40.13 
 
 		 169 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0519328 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3888  nitroreductase  40.4 
 
 		 169 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1783  nitroreductase family protein  37.8 
 
 		 207 aa  108  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2050  nitroreductase family protein  37.8 
 
 		 207 aa  108  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0775  nitroreductase family protein  37.8 
 
 		 207 aa  108  3e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1068  nitroreductase family protein  37.8 
 
 		 207 aa  108  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0671  nitroreductase family protein  37.8 
 
 		 207 aa  108  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2043  nitroreductase family protein  37.8 
 
 		 207 aa  108  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.144976  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0968  hypothetical protein  37.06 
 
 		 191 aa  108  6e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6294  nitroreductase  39.76 
 
 		 187 aa  108  6e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167962  normal  0.193293 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1818  nitroreductase  38.18 
 
 		 208 aa  108  6e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0762  nitroreductase family protein  37.2 
 
 		 207 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1763  nitroreductase  35.43 
 
 		 190 aa  107  1e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0850  nitroreductase  37.06 
 
 		 191 aa  107  1e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.811499  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0266  nitroreductase  37.89 
 
 		 187 aa  104  6e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1004  nitroreductase  32.24 
 
 		 191 aa  102  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.97914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2271  nitroreductase  39.75 
 
 		 194 aa  102  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.800886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04578  nitroreductase family  38.82 
 
 		 191 aa  101  5e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3123  nitroreductase  37.5 
 
 		 187 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0077  nitroreductase  35.19 
 
 		 196 aa  100  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1495  hypothetical protein  37.36 
 
 		 187 aa  99.8  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0669321 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2317  nitroreductase  38.75 
 
 		 197 aa  97.1  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.844939  normal  0.193364 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2627  hypothetical protein  35.33 
 
 		 216 aa  97.1  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.632412  normal  0.0266361 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2592  nitroreductase  38.12 
 
 		 195 aa  95.9  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.28104 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1011  nitroreductase  34.12 
 
 		 212 aa  95.9  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0698  nitroreductase  35.47 
 
 		 193 aa  95.1  4e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.129667 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1095  nitroreductase  32.94 
 
 		 219 aa  94.4  8e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.42931 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1618  nitroreductase  33.53 
 
 		 195 aa  94.4  9e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3161  nitroreductase  33.74 
 
 		 195 aa  93.6  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.497099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7206  nitroreductase  40.24 
 
 		 187 aa  94  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.347325  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1635  nitroreductase  35.88 
 
 		 187 aa  94  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.191312  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>