More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1503 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1503  hydrogenase, Fe-only  100 
 
 		 418 aa  870    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.349556  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1386  hydrogenases, Fe-only  73.03 
 
 		 421 aa  637    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.999103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0081  ferredoxin hydrogenase  66.11 
 
 		 421 aa  570  1e-161  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0848  hydrogenases, Fe-only  55.34 
 
 		 417 aa  446  1.0000000000000001e-124  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2281  ferredoxin hydrogenase  53.58 
 
 		 439 aa  423  1e-117  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1925  ferredoxin hydrogenase  52.13 
 
 		 387 aa  363  2e-99  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0290  hydrogenase, Fe-only  51.37 
 
 		 549 aa  363  4e-99  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.199872  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2138  hydrogenase, Fe-only  46.91 
 
 		 581 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000865974  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4621  hydrogenase, Fe-only  51.74 
 
 		 527 aa  358  9.999999999999999e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3250  hydrogenases, Fe-only  48.09 
 
 		 410 aa  352  8.999999999999999e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.644479  hitchhiker  0.0000163586 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0711  response regulator receiver protein  47.58 
 
 		 410 aa  351  1e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.312278  hitchhiker  0.0000873565 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3920  periplasmic Fe hydrogenase, large subunit  47.84 
 
 		 410 aa  347  2e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0463  hydrogenases, Fe-only  47.04 
 
 		 520 aa  347  2e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0342  hydrogenase, Fe-only  46.38 
 
 		 582 aa  347  3e-94  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0168  hydrogenase, Fe-only  48.69 
 
 		 513 aa  340  2.9999999999999998e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.191335  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1299  hydrogenase, Fe-only  43.61 
 
 		 579 aa  340  2.9999999999999998e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.130328  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0172  hydrogenase, Fe-only  48.84 
 
 		 573 aa  339  7e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0152  hydrogenase, Fe-only  46.63 
 
 		 580 aa  335  7e-91  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2467  hydrogenase, Fe-only  44.68 
 
 		 574 aa  335  1e-90  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1717  Iron hydrogenase, small subunit  47.77 
 
 		 573 aa  335  1e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.118526  normal  0.410336 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3805  hydrogenase, Fe-only  46.03 
 
 		 582 aa  330  4e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3290  hydrogenases, Fe-only  42.86 
 
 		 594 aa  329  5.0000000000000004e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0475  ferredoxin hydrogenase  44.12 
 
 		 458 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0147  [Fe] hydrogenase, large subunit HymC, putative  48.38 
 
 		 573 aa  327  3e-88  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2232  hydrogenase, Fe-only  45.84 
 
 		 582 aa  327  3e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0157  hydrogenase, Fe-only  48.76 
 
 		 523 aa  326  4.0000000000000003e-88  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.434937  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_155  [Fe] hydrogenase, Hym C subunit  48.11 
 
 		 573 aa  326  5e-88  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0224  hydrogenase, Fe-only  48.11 
 
 		 573 aa  325  1e-87  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1017  iron hydrogenase, small subunit  45.94 
 
 		 574 aa  323  3e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1781  hydrogenase, Fe-only  48.18 
 
 		 578 aa  323  5e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1783  hydrogenase, Fe-only  47.9 
 
 		 583 aa  322  7e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1544  hydrogenase, Fe-only  45.79 
 
 		 581 aa  319  6e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.557218 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06330  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 75 kDa subunit  46.52 
 
 		 578 aa  319  6e-86  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00021405  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0747  hydrogenase, Fe-only  47.71 
 
 		 582 aa  317  2e-85  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0533  hydrogenase, Fe-only  46.3 
 
 		 582 aa  317  3e-85  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0310904  normal  0.240554 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0723  hydrogenase, Fe-only  47.44 
 
 		 582 aa  317  3e-85  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0844  hydrogenases, Fe-only  45 
 
 		 576 aa  317  3e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02980  NADH dehydrogenase I subunit G  45.56 
 
 		 570 aa  316  6e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1076  [Fe] hydrogenase  45.65 
 
 		 696 aa  314  1.9999999999999998e-84  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.723256  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2655  iron hydrogenase  41.79 
 
 		 572 aa  313  2.9999999999999996e-84  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1651  hydrogenases, Fe-only  44.83 
 
 		 593 aa  312  6.999999999999999e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.556328  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1548  hydrogenase, Fe-only  45.71 
 
 		 615 aa  312  7.999999999999999e-84  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2341  iron hydrogenase  41.67 
 
 		 572 aa  310  4e-83  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0938  periplasmic [Fe] hydrogenase 1  43.97 
 
 		 696 aa  309  5e-83  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0625857  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01810  NADH dehydrogenase I subunit G  44.01 
 
 		 666 aa  308  9e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000616939  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1601  hydrogenase, Fe-only  44.36 
 
 		 582 aa  306  3e-82  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2436  (Fe) hydrogenase, large subunit HymC, putative  46.01 
 
 		 563 aa  305  1.0000000000000001e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000128912  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1337  hydrogenase, Fe-only  46.67 
 
 		 590 aa  304  2.0000000000000002e-81  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0723  hydrogenase, Fe-only  45.68 
 
 		 578 aa  303  4.0000000000000003e-81  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1883  ferredoxin hydrogenase  40.97 
 
 		 460 aa  300  3e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2159  hydrogenase, Fe-only  44.54 
 
 		 582 aa  299  6e-80  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1605  NAD-reducing iron-only hydrogenase large subunit  44.27 
 
 		 585 aa  297  2e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3829  hydrogenase, Fe-only  42.42 
 
 		 625 aa  298  2e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1149  hydrogenase, Fe-only  41.51 
 
 		 569 aa  296  3e-79  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000253121  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2303  hydrogenase, Fe-only  42.05 
 
 		 562 aa  296  4e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1085  hydrogenase, Fe-only  40.85 
 
 		 577 aa  296  6e-79  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0236  hydrogenase, Fe-only  44.19 
 
 		 586 aa  294  2e-78  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.660897  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1490  hydrogenases, Fe-only  38.85 
 
 		 601 aa  292  7e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1633  NAD-reducing iron-only hydrogenase large subunit  44.78 
 
 		 585 aa  291  1e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000469619  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0150  hydrogenase, Fe-only  42.82 
 
 		 585 aa  288  2e-76  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1384  hydrogenases, Fe-only  44.5 
 
 		 606 aa  284  2.0000000000000002e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3601  hydrogenase, Fe-only  43.01 
 
 		 587 aa  277  2e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0137  hydrogenase, Fe-only  42.05 
 
 		 619 aa  277  2e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0625  hydrogenase, Fe-only  41.65 
 
 		 587 aa  277  3e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000144729  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2056  hydrogenase, Fe-only  41.94 
 
 		 644 aa  276  5e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000410653  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0430  hydrogenase, Fe-only  36.66 
 
 		 566 aa  270  5e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.735126  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3003  hydrogenase, Fe-only  37.71 
 
 		 644 aa  269  8e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2502  iron-containing hydrogenase, Hyd gamma  42.47 
 
 		 598 aa  265  1e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1654  hydrogenases, Fe-only  39.8 
 
 		 659 aa  263  3e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.357121  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2037  hydrogenase, Fe-only  37.95 
 
 		 1150 aa  255  1.0000000000000001e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.163812  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16530  hydrogenase, Fe-only  41.58 
 
 		 569 aa  251  1e-65  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.143158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0087  hydrogenase, Fe-only  36.16 
 
 		 567 aa  246  6e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1593  Fe-hydrogenase  39.36 
 
 		 596 aa  244  3e-63  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0490  hydrogenase large subunit  37.11 
 
 		 653 aa  222  7e-57  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0225  hydrogenase, Fe-only  34.77 
 
 		 667 aa  220  3e-56  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1367  hydrogenase large subunit  35.75 
 
 		 645 aa  206  7e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1319  hydrogenase large subunit  35.75 
 
 		 645 aa  205  9e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0560  hydrogenase, Fe-only  33.59 
 
 		 666 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00291892  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0310  ferredoxin hydrogenase  31.34 
 
 		 462 aa  182  7e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33837  predicted protein  31.65 
 
 		 473 aa  155  2e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.40604 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1277  Fe-hydrogenase large subunit family protein  28.5 
 
 		 493 aa  131  3e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000478337  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2579  [Fe] hydrogenase  29.79 
 
 		 490 aa  125  1e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0477  hydrogenase large subunit  31.12 
 
 		 478 aa  124  5e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02870  Ferredoxin hydrogenase  30.59 
 
 		 456 aa  123  7e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.417058  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2900  [Fe] hydrogenase  29.68 
 
 		 490 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2631  Ferredoxin hydrogenase  27.86 
 
 		 490 aa  121  3e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000219307  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1440  hydrogenase large subunit  31.93 
 
 		 429 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0411  Ferredoxin hydrogenase  28.11 
 
 		 531 aa  115  2.0000000000000002e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0687694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1708  hydrogenase large subunit domain protein  29.26 
 
 		 435 aa  114  3e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02090  hydrogenase large subunit domain protein  28.68 
 
 		 491 aa  113  5e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0884  hydrogenase large subunit domain protein  27.25 
 
 		 507 aa  113  6e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.139599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0413  hydrogenase large subunit  28.21 
 
 		 485 aa  113  6e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0146308  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0725  hydrogenase-like  27.3 
 
 		 483 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000665726  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33268  nuclear architecture related protein  24.49 
 
 		 545 aa  112  2.0000000000000002e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0090  ferredoxin hydrogenase  29.33 
 
 		 484 aa  108  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0836  hydrogenase large subunit domain protein  28.16 
 
 		 482 aa  107  3e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000619385  hitchhiker  0.000460922 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0813  hydrogenase large subunit domain protein  29.94 
 
 		 424 aa  106  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.128167  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3463  putative PAS/PAC sensor protein  23.5 
 
 		 576 aa  103  8e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.158169  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3465  hydrogenase large subunit domain protein  27.62 
 
 		 488 aa  102  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0996  hydrogenase large subunit domain protein  28.08 
 
 		 454 aa  100  5e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000195829  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>