140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_02870 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011899  Hore_02870  Ferredoxin hydrogenase  100 
 
 		 456 aa  941    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.417058  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1440  hydrogenase large subunit  45.91 
 
 		 429 aa  330  3e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0813  hydrogenase large subunit domain protein  50.72 
 
 		 424 aa  325  1e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.128167  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0270  [Fe] hydrogenase  44.44 
 
 		 449 aa  275  2.0000000000000002e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0261  hydrogenase subunit (ferredoxin)  44.2 
 
 		 449 aa  270  4e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.578609  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0884  hydrogenase large subunit domain protein  37.92 
 
 		 507 aa  246  4e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.139599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1708  hydrogenase large subunit domain protein  41.04 
 
 		 435 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2579  [Fe] hydrogenase  41.94 
 
 		 490 aa  234  3e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2900  [Fe] hydrogenase  41.1 
 
 		 490 aa  233  7.000000000000001e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1371  hydrogenase large subunit domain protein  40.58 
 
 		 508 aa  230  3e-59  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000870686  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0836  hydrogenase large subunit domain protein  36.04 
 
 		 482 aa  216  5e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000619385  hitchhiker  0.000460922 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3465  hydrogenase large subunit domain protein  39.67 
 
 		 488 aa  216  8e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0090  ferredoxin hydrogenase  31.45 
 
 		 484 aa  212  1e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0413  hydrogenase large subunit  37.64 
 
 		 485 aa  207  4e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0146308  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0411  Ferredoxin hydrogenase  38.18 
 
 		 531 aa  207  4e-52  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0687694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0996  hydrogenase large subunit domain protein  38.67 
 
 		 454 aa  205  1e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000195829  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2631  Ferredoxin hydrogenase  29.63 
 
 		 490 aa  198  2.0000000000000003e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000219307  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0750  hydrogenase large subunit  36.39 
 
 		 482 aa  190  5e-47  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0180769  hitchhiker  0.000000000087178 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02090  hydrogenase large subunit domain protein  29.28 
 
 		 491 aa  189  1e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1794  hydrogenase large subunit  37.25 
 
 		 462 aa  183  5.0000000000000004e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0477  hydrogenase large subunit  35.22 
 
 		 478 aa  180  4.999999999999999e-44  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1277  Fe-hydrogenase large subunit family protein  36 
 
 		 493 aa  176  9.999999999999999e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000478337  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0725  hydrogenase-like  35.67 
 
 		 483 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000665726  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02060  putative PAS/PAC sensor protein  32.96 
 
 		 571 aa  156  8e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2138  hydrogenase, Fe-only  29.5 
 
 		 581 aa  145  2e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000865974  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0225  hydrogenase, Fe-only  30.79 
 
 		 667 aa  144  5e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1713  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  35.03 
 
 		 748 aa  142  9.999999999999999e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000552259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0655  putative PAS/PAC sensor protein  34.78 
 
 		 580 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0752  putative PAS/PAC sensor protein  35.13 
 
 		 559 aa  142  9.999999999999999e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.801139  hitchhiker  0.0000000000202467 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0839  putative PAS/PAC sensor protein  33.95 
 
 		 569 aa  141  1.9999999999999998e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00192903 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2300  putative PAS/PAC sensor protein  32.35 
 
 		 574 aa  140  6e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.252887  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4176  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  31.21 
 
 		 755 aa  139  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000648689  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3463  putative PAS/PAC sensor protein  31.55 
 
 		 576 aa  136  7.000000000000001e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.158169  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0426  putative PAS/PAC sensor protein  33.33 
 
 		 556 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0490  hydrogenase large subunit  26.78 
 
 		 653 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0092  putative PAS/PAC sensor protein  33.67 
 
 		 577 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3363  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  32.53 
 
 		 763 aa  132  9e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0055  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  30.79 
 
 		 756 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.928801 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0342  hydrogenase, Fe-only  29.02 
 
 		 582 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1889  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  32.16 
 
 		 752 aa  130  6e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2341  iron hydrogenase  29.54 
 
 		 572 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2303  hydrogenase, Fe-only  28.69 
 
 		 562 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2655  iron hydrogenase  29.81 
 
 		 572 aa  127  4.0000000000000003e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0560  hydrogenase, Fe-only  30.82 
 
 		 666 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00291892  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1585  putative PAS/PAC sensor protein  32.26 
 
 		 573 aa  127  5e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000290099  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1548  hydrogenase, Fe-only  29.77 
 
 		 615 aa  126  8.000000000000001e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3802  putative sigma54 specific transcriptional regulator  28.93 
 
 		 759 aa  126  9e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3290  hydrogenases, Fe-only  26.88 
 
 		 594 aa  125  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3885  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  29.26 
 
 		 759 aa  125  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2467  hydrogenase, Fe-only  28.96 
 
 		 574 aa  124  3e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2281  ferredoxin hydrogenase  29.28 
 
 		 439 aa  124  3e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0467  transcriptional regulator, Fis family  31.36 
 
 		 767 aa  124  3e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1490  hydrogenases, Fe-only  27.4 
 
 		 601 aa  122  9e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3003  hydrogenase, Fe-only  26.01 
 
 		 644 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1833  ferredoxin 2  27.71 
 
 		 583 aa  121  3e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00530052  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1299  hydrogenase, Fe-only  28.57 
 
 		 579 aa  121  3e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.130328  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0236  hydrogenase, Fe-only  28.44 
 
 		 586 aa  121  3e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.660897  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2232  hydrogenase, Fe-only  26.04 
 
 		 582 aa  121  3e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1367  hydrogenase large subunit  31.2 
 
 		 645 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1319  hydrogenase large subunit  31.2 
 
 		 645 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2037  hydrogenase, Fe-only  26.72 
 
 		 1150 aa  119  9e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.163812  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0335  hydrogenase large subunit-like protein  29.64 
 
 		 448 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16530  hydrogenase, Fe-only  27.33 
 
 		 569 aa  118  1.9999999999999998e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.143158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0172  hydrogenase, Fe-only  28.67 
 
 		 573 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0723  hydrogenase, Fe-only  26.58 
 
 		 578 aa  118  3e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1085  hydrogenase, Fe-only  25.42 
 
 		 577 aa  117  3e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3829  hydrogenase, Fe-only  28.71 
 
 		 625 aa  116  6.9999999999999995e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2502  iron-containing hydrogenase, Hyd gamma  27.03 
 
 		 598 aa  116  8.999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0848  hydrogenases, Fe-only  28.86 
 
 		 417 aa  116  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3805  hydrogenase, Fe-only  27.67 
 
 		 582 aa  116  1.0000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4621  hydrogenase, Fe-only  27.95 
 
 		 527 aa  116  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0430  hydrogenase, Fe-only  28.17 
 
 		 566 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.735126  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1651  hydrogenases, Fe-only  27.65 
 
 		 593 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.556328  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0318  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.09 
 
 		 550 aa  115  2.0000000000000002e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1149  hydrogenase, Fe-only  24.92 
 
 		 569 aa  115  2.0000000000000002e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000253121  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1883  ferredoxin hydrogenase  25.75 
 
 		 460 aa  114  3e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1846  putative PAS/PAC sensor protein  30.43 
 
 		 572 aa  114  3e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.997362 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1601  hydrogenase, Fe-only  26.88 
 
 		 582 aa  114  5e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1503  hydrogenase, Fe-only  32.85 
 
 		 418 aa  113  6e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.349556  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2305  ferredoxin 2  30.89 
 
 		 500 aa  113  6e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1593  Fe-hydrogenase  28.61 
 
 		 596 aa  113  8.000000000000001e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1781  hydrogenase, Fe-only  26.09 
 
 		 578 aa  112  9e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0494  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.32 
 
 		 519 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02980  NADH dehydrogenase I subunit G  25.25 
 
 		 570 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06330  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 75 kDa subunit  28.32 
 
 		 578 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00021405  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0475  ferredoxin hydrogenase  23.47 
 
 		 458 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1017  iron hydrogenase, small subunit  25.24 
 
 		 574 aa  112  2.0000000000000002e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1386  hydrogenases, Fe-only  29.49 
 
 		 421 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.999103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1783  hydrogenase, Fe-only  25.85 
 
 		 583 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01770  putative PAS/PAC sensor protein  27.4 
 
 		 584 aa  109  8.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2056  hydrogenase, Fe-only  27.71 
 
 		 644 aa  109  9.000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000410653  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0147  [Fe] hydrogenase, large subunit HymC, putative  25.81 
 
 		 573 aa  108  1e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0168  hydrogenase, Fe-only  27.19 
 
 		 513 aa  109  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.191335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3250  hydrogenases, Fe-only  26.65 
 
 		 410 aa  108  2e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.644479  hitchhiker  0.0000163586 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0844  hydrogenases, Fe-only  26.62 
 
 		 576 aa  108  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0137  hydrogenase, Fe-only  27.1 
 
 		 619 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0711  response regulator receiver protein  26.17 
 
 		 410 aa  107  5e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.312278  hitchhiker  0.0000873565 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_155  [Fe] hydrogenase, Hym C subunit  25.16 
 
 		 573 aa  106  7e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0087  hydrogenase, Fe-only  25.31 
 
 		 567 aa  106  7e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1384  hydrogenases, Fe-only  26.61 
 
 		 606 aa  106  8e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>