More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0490 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_0225  hydrogenase, Fe-only  67.93 
 
 
667 aa  939    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1367  hydrogenase large subunit  64.52 
 
 
645 aa  881    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0560  hydrogenase, Fe-only  62.01 
 
 
666 aa  855    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00291892  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1319  hydrogenase large subunit  64.52 
 
 
645 aa  880    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0490  hydrogenase large subunit  100 
 
 
653 aa  1335    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01810  NADH dehydrogenase I subunit G  49.47 
 
 
666 aa  585  1.0000000000000001e-165  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000616939  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1654  hydrogenases, Fe-only  43.59 
 
 
659 aa  489  1e-137  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.357121  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1490  hydrogenases, Fe-only  42.53 
 
 
601 aa  460  9.999999999999999e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0342  hydrogenase, Fe-only  43.19 
 
 
582 aa  454  1.0000000000000001e-126  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2138  hydrogenase, Fe-only  42.09 
 
 
581 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000865974  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2303  hydrogenase, Fe-only  46.01 
 
 
562 aa  451  1e-125  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2232  hydrogenase, Fe-only  41.87 
 
 
582 aa  451  1e-125  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1299  hydrogenase, Fe-only  40.97 
 
 
579 aa  442  1e-123  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.130328  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06330  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 75 kDa subunit  43.06 
 
 
578 aa  443  1e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00021405  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0844  hydrogenases, Fe-only  42.7 
 
 
576 aa  445  1e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0087  hydrogenase, Fe-only  43.01 
 
 
567 aa  439  9.999999999999999e-123  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1781  hydrogenase, Fe-only  45.53 
 
 
578 aa  437  1e-121  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0723  hydrogenase, Fe-only  42.39 
 
 
578 aa  434  1e-120  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0172  hydrogenase, Fe-only  43.24 
 
 
573 aa  434  1e-120  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1783  hydrogenase, Fe-only  45.85 
 
 
583 aa  434  1e-120  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2467  hydrogenase, Fe-only  41.91 
 
 
574 aa  426  1e-118  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1149  hydrogenase, Fe-only  43.41 
 
 
569 aa  424  1e-117  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000253121  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0430  hydrogenase, Fe-only  41.93 
 
 
566 aa  425  1e-117  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.735126  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0147  [Fe] hydrogenase, large subunit HymC, putative  42.91 
 
 
573 aa  416  9.999999999999999e-116  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1717  Iron hydrogenase, small subunit  42.55 
 
 
573 aa  417  9.999999999999999e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.118526  normal  0.410336 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3805  hydrogenase, Fe-only  41.35 
 
 
582 aa  418  9.999999999999999e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0224  hydrogenase, Fe-only  42.68 
 
 
573 aa  415  1e-114  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_155  [Fe] hydrogenase, Hym C subunit  42.73 
 
 
573 aa  415  1e-114  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1651  hydrogenases, Fe-only  41.61 
 
 
593 aa  411  1e-113  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.556328  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0152  hydrogenase, Fe-only  43.14 
 
 
580 aa  409  1e-113  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1337  hydrogenase, Fe-only  41.33 
 
 
590 aa  409  1e-113  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0150  hydrogenase, Fe-only  41.34 
 
 
585 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1085  hydrogenase, Fe-only  40.48 
 
 
577 aa  405  1e-111  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02980  NADH dehydrogenase I subunit G  41.23 
 
 
570 aa  405  1e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1633  NAD-reducing iron-only hydrogenase large subunit  40.24 
 
 
585 aa  397  1e-109  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000469619  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0625  hydrogenase, Fe-only  40.21 
 
 
587 aa  399  1e-109  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000144729  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3829  hydrogenase, Fe-only  38.15 
 
 
625 aa  395  1e-108  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0723  hydrogenase, Fe-only  40.75 
 
 
582 aa  392  1e-108  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3601  hydrogenase, Fe-only  39.61 
 
 
587 aa  394  1e-108  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3290  hydrogenases, Fe-only  38.42 
 
 
594 aa  394  1e-108  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1017  iron hydrogenase, small subunit  41.58 
 
 
574 aa  394  1e-108  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0747  hydrogenase, Fe-only  40.72 
 
 
582 aa  392  1e-107  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1605  NAD-reducing iron-only hydrogenase large subunit  39.55 
 
 
585 aa  386  1e-106  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1548  hydrogenase, Fe-only  39.14 
 
 
615 aa  382  1e-105  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1601  hydrogenase, Fe-only  39.21 
 
 
582 aa  382  1e-105  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0236  hydrogenase, Fe-only  38.99 
 
 
586 aa  378  1e-103  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.660897  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0533  hydrogenase, Fe-only  39.16 
 
 
582 aa  370  1e-101  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0310904  normal  0.240554 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1384  hydrogenases, Fe-only  38.01 
 
 
606 aa  367  1e-100  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16530  hydrogenase, Fe-only  37.66 
 
 
569 aa  365  2e-99  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.143158  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2159  hydrogenase, Fe-only  39.27 
 
 
582 aa  365  2e-99  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1544  hydrogenase, Fe-only  39.23 
 
 
581 aa  363  4e-99  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.557218 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1593  Fe-hydrogenase  36.69 
 
 
596 aa  352  1e-95  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2436  (Fe) hydrogenase, large subunit HymC, putative  38.19 
 
 
563 aa  347  3e-94  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000128912  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2341  iron hydrogenase  38.09 
 
 
572 aa  345  1e-93  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0137  hydrogenase, Fe-only  35.98 
 
 
619 aa  343  5.999999999999999e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2655  iron hydrogenase  37.57 
 
 
572 aa  341  2e-92  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2502  iron-containing hydrogenase, Hyd gamma  35.33 
 
 
598 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3003  hydrogenase, Fe-only  37.32 
 
 
644 aa  317  3e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2037  hydrogenase, Fe-only  36.95 
 
 
1150 aa  313  4.999999999999999e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.163812  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0463  hydrogenases, Fe-only  40.22 
 
 
520 aa  311  2.9999999999999997e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4621  hydrogenase, Fe-only  38.65 
 
 
527 aa  296  7e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0168  hydrogenase, Fe-only  38.55 
 
 
513 aa  293  9e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.191335  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0290  hydrogenase, Fe-only  36.54 
 
 
549 aa  286  9e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.199872  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0475  ferredoxin hydrogenase  37.47 
 
 
458 aa  280  7e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0157  hydrogenase, Fe-only  38.38 
 
 
523 aa  269  1e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.434937  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0938  periplasmic [Fe] hydrogenase 1  38 
 
 
696 aa  244  3.9999999999999997e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0625857  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1883  ferredoxin hydrogenase  36.14 
 
 
460 aa  241  2.9999999999999997e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1076  [Fe] hydrogenase  37 
 
 
696 aa  239  1e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.723256  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1925  ferredoxin hydrogenase  36.43 
 
 
387 aa  228  3e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2056  hydrogenase, Fe-only  36.73 
 
 
644 aa  224  4e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000410653  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2281  ferredoxin hydrogenase  34.74 
 
 
439 aa  223  8e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0711  response regulator receiver protein  35.41 
 
 
410 aa  220  5e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.312278  hitchhiker  0.0000873565 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3250  hydrogenases, Fe-only  35.41 
 
 
410 aa  219  1e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.644479  hitchhiker  0.0000163586 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0848  hydrogenases, Fe-only  33.92 
 
 
417 aa  216  9.999999999999999e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3920  periplasmic Fe hydrogenase, large subunit  35.16 
 
 
410 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1503  hydrogenase, Fe-only  37.11 
 
 
418 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.349556  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1386  hydrogenases, Fe-only  34.44 
 
 
421 aa  195  2e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.999103  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0081  ferredoxin hydrogenase  35.62 
 
 
421 aa  190  9e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0156  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.39 
 
 
898 aa  184  4.0000000000000006e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3503  formate dehydrogenase, alpha subunit  47.34 
 
 
900 aa  178  2e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3504  ferredoxin  42.51 
 
 
312 aa  179  2e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2705  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  44.61 
 
 
355 aa  177  5e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.223751 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1888  ferredoxin  44.61 
 
 
307 aa  176  9e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1856  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  43.54 
 
 
351 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3509  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.58 
 
 
905 aa  174  5e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.434543  normal  0.526227 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3507  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.75 
 
 
893 aa  173  1e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0386  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.85 
 
 
917 aa  173  1e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.118073  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0100  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.62 
 
 
893 aa  172  2e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000102152  hitchhiker  0.000000000000206048 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1831  NADH dehydrogenase I chain G  42.99 
 
 
363 aa  171  3e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1398  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.95 
 
 
893 aa  169  1e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0704  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.49 
 
 
900 aa  164  4.0000000000000004e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0030  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  40.27 
 
 
359 aa  163  9e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00062453  normal  0.73393 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0785  NADH dehydrogenase I chain G  38.91 
 
 
353 aa  161  5e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1029  NADH dehydrogenase I chain G  41.18 
 
 
358 aa  160  9e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0110  molybdopterin oxidoreductase  40.29 
 
 
998 aa  159  1e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0334  NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit G, iron-sulphur binding protein  38.39 
 
 
826 aa  159  2e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0835  anaerobic dehydrogenase  38.46 
 
 
305 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0724  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.51 
 
 
948 aa  157  7e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.696908  normal  0.792249 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0623  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.51 
 
 
948 aa  155  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.816724  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0805  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.05 
 
 
948 aa  155  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.624345  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>