239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0996 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0996  hydrogenase large subunit domain protein  100 
 
 		 454 aa  941    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000195829  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1794  hydrogenase large subunit  46.24 
 
 		 462 aa  392  1e-108  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0413  hydrogenase large subunit  44.69 
 
 		 485 aa  384  1e-105  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0146308  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02090  hydrogenase large subunit domain protein  35.19 
 
 		 491 aa  320  3.9999999999999996e-86  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0884  hydrogenase large subunit domain protein  36.8 
 
 		 507 aa  317  4e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.139599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2579  [Fe] hydrogenase  40.5 
 
 		 490 aa  316  6e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2900  [Fe] hydrogenase  40.14 
 
 		 490 aa  313  4.999999999999999e-84  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1371  hydrogenase large subunit domain protein  36.84 
 
 		 508 aa  308  1.0000000000000001e-82  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000870686  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0750  hydrogenase large subunit  39.02 
 
 		 482 aa  305  1.0000000000000001e-81  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0180769  hitchhiker  0.000000000087178 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0836  hydrogenase large subunit domain protein  37.33 
 
 		 482 aa  305  1.0000000000000001e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000619385  hitchhiker  0.000460922 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3465  hydrogenase large subunit domain protein  38.18 
 
 		 488 aa  303  5.000000000000001e-81  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1277  Fe-hydrogenase large subunit family protein  36.63 
 
 		 493 aa  295  1e-78  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000478337  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0725  hydrogenase-like  38.46 
 
 		 483 aa  295  2e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000665726  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2631  Ferredoxin hydrogenase  37.66 
 
 		 490 aa  293  4e-78  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000219307  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0090  ferredoxin hydrogenase  38.48 
 
 		 484 aa  289  8e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0411  Ferredoxin hydrogenase  35.71 
 
 		 531 aa  285  1.0000000000000001e-75  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0687694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0477  hydrogenase large subunit  38.14 
 
 		 478 aa  275  9e-73  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02870  Ferredoxin hydrogenase  38.67 
 
 		 456 aa  205  1e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.417058  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1708  hydrogenase large subunit domain protein  37.54 
 
 		 435 aa  193  4e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1440  hydrogenase large subunit  37.41 
 
 		 429 aa  177  5e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0813  hydrogenase large subunit domain protein  35.11 
 
 		 424 aa  164  3e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.128167  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2303  hydrogenase, Fe-only  29.5 
 
 		 562 aa  141  1.9999999999999998e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0426  putative PAS/PAC sensor protein  30.95 
 
 		 556 aa  134  3.9999999999999996e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0752  putative PAS/PAC sensor protein  32.29 
 
 		 559 aa  133  6e-30  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.801139  hitchhiker  0.0000000000202467 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0270  [Fe] hydrogenase  31.48 
 
 		 449 aa  132  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0430  hydrogenase, Fe-only  28.8 
 
 		 566 aa  131  3e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.735126  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3463  putative PAS/PAC sensor protein  31.77 
 
 		 576 aa  130  6e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.158169  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1833  ferredoxin 2  31.09 
 
 		 583 aa  130  7.000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00530052  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0261  hydrogenase subunit (ferredoxin)  31.62 
 
 		 449 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.578609  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0655  putative PAS/PAC sensor protein  31.69 
 
 		 580 aa  127  3e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2281  ferredoxin hydrogenase  30.03 
 
 		 439 aa  127  3e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1846  putative PAS/PAC sensor protein  30.51 
 
 		 572 aa  126  9e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.997362 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0178  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.15 
 
 		 443 aa  125  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02060  putative PAS/PAC sensor protein  33.56 
 
 		 571 aa  125  2e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0092  putative PAS/PAC sensor protein  33.79 
 
 		 577 aa  124  4e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2341  iron hydrogenase  30.19 
 
 		 572 aa  124  5e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2300  putative PAS/PAC sensor protein  28.77 
 
 		 574 aa  124  5e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.252887  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1490  hydrogenases, Fe-only  28.84 
 
 		 601 aa  122  9e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1889  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  32.81 
 
 		 752 aa  122  9.999999999999999e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2655  iron hydrogenase  30.4 
 
 		 572 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1654  hydrogenases, Fe-only  31.76 
 
 		 659 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.357121  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0556  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.51 
 
 		 542 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0723  hydrogenase, Fe-only  36.14 
 
 		 578 aa  120  6e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1593  Fe-hydrogenase  31.7 
 
 		 596 aa  119  9.999999999999999e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3290  hydrogenases, Fe-only  30.65 
 
 		 594 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01810  NADH dehydrogenase I subunit G  29.07 
 
 		 666 aa  117  3.9999999999999997e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000616939  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1367  hydrogenase large subunit  28.49 
 
 		 645 aa  117  5e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2145  Fe-S cluster domain-containing protein  31.78 
 
 		 435 aa  117  6e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0087  hydrogenase, Fe-only  27.96 
 
 		 567 aa  116  6.9999999999999995e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0342  hydrogenase, Fe-only  29.94 
 
 		 582 aa  116  6.9999999999999995e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1319  hydrogenase large subunit  28.49 
 
 		 645 aa  116  7.999999999999999e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3805  hydrogenase, Fe-only  29.27 
 
 		 582 aa  116  8.999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02950  putative PAS/PAC sensor protein  31.17 
 
 		 877 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0137  hydrogenase, Fe-only  27.08 
 
 		 619 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0467  transcriptional regulator, Fis family  29.79 
 
 		 767 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02980  NADH dehydrogenase I subunit G  31.36 
 
 		 570 aa  114  4.0000000000000004e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2159  hydrogenase, Fe-only  32.56 
 
 		 582 aa  114  4.0000000000000004e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2138  hydrogenase, Fe-only  28.53 
 
 		 581 aa  113  6e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000865974  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1601  hydrogenase, Fe-only  30.62 
 
 		 582 aa  113  7.000000000000001e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0839  putative PAS/PAC sensor protein  30.7 
 
 		 569 aa  113  8.000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00192903 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1713  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  33.67 
 
 		 748 aa  112  9e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000552259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06330  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 75 kDa subunit  31.06 
 
 		 578 aa  113  9e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00021405  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2037  hydrogenase, Fe-only  28.27 
 
 		 1150 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.163812  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0318  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.82 
 
 		 550 aa  112  1.0000000000000001e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1384  hydrogenases, Fe-only  28.11 
 
 		 606 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2502  iron-containing hydrogenase, Hyd gamma  30.41 
 
 		 598 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0225  hydrogenase, Fe-only  26.63 
 
 		 667 aa  111  2.0000000000000002e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2232  hydrogenase, Fe-only  29 
 
 		 582 aa  108  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1149  hydrogenase, Fe-only  30.31 
 
 		 569 aa  108  1e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000253121  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0335  hydrogenase large subunit-like protein  30 
 
 		 448 aa  109  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01770  putative PAS/PAC sensor protein  28.94 
 
 		 584 aa  108  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1544  hydrogenase, Fe-only  32.13 
 
 		 581 aa  108  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.557218 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1548  hydrogenase, Fe-only  34.01 
 
 		 615 aa  108  2e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0848  hydrogenases, Fe-only  29.06 
 
 		 417 aa  108  3e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3363  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  35 
 
 		 763 aa  107  4e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1925  ferredoxin hydrogenase  30.58 
 
 		 387 aa  107  5e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0560  hydrogenase, Fe-only  28.3 
 
 		 666 aa  107  5e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00291892  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1292  Fe-S cluster domain protein  30.38 
 
 		 443 aa  107  5e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0490  hydrogenase large subunit  26.06 
 
 		 653 aa  107  5e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3003  hydrogenase, Fe-only  26.18 
 
 		 644 aa  107  6e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0224  hydrogenase, Fe-only  28.12 
 
 		 573 aa  107  6e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0172  hydrogenase, Fe-only  31.4 
 
 		 573 aa  106  7e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1651  hydrogenases, Fe-only  30.69 
 
 		 593 aa  106  8e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.556328  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_155  [Fe] hydrogenase, Hym C subunit  30 
 
 		 573 aa  106  8e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0147  [Fe] hydrogenase, large subunit HymC, putative  30 
 
 		 573 aa  105  1e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0152  hydrogenase, Fe-only  30.41 
 
 		 580 aa  105  1e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0723  hydrogenase, Fe-only  32.45 
 
 		 582 aa  106  1e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1299  hydrogenase, Fe-only  29.94 
 
 		 579 aa  105  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.130328  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4621  hydrogenase, Fe-only  28.53 
 
 		 527 aa  105  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1017  iron hydrogenase, small subunit  30.62 
 
 		 574 aa  105  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0236  hydrogenase, Fe-only  30.41 
 
 		 586 aa  105  2e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.660897  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0747  hydrogenase, Fe-only  32.12 
 
 		 582 aa  105  2e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1585  putative PAS/PAC sensor protein  27.38 
 
 		 573 aa  105  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000290099  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2467  hydrogenase, Fe-only  27.72 
 
 		 574 aa  104  3e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1085  hydrogenase, Fe-only  33.73 
 
 		 577 aa  104  4e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0081  ferredoxin hydrogenase  32.34 
 
 		 421 aa  103  7e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3829  hydrogenase, Fe-only  29.04 
 
 		 625 aa  103  8e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1781  hydrogenase, Fe-only  32.66 
 
 		 578 aa  103  9e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16530  hydrogenase, Fe-only  29.24 
 
 		 569 aa  102  2e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.143158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1717  Iron hydrogenase, small subunit  30 
 
 		 573 aa  101  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.118526  normal  0.410336 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>