218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0556 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011661  Dtur_0556  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  100 
 
 		 542 aa  1092    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0494  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  50.46 
 
 		 519 aa  517  1.0000000000000001e-145  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0318  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  46.88 
 
 		 550 aa  516  1.0000000000000001e-145  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1315  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  48.07 
 
 		 521 aa  492  9.999999999999999e-139  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000641444  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1371  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  47.89 
 
 		 521 aa  492  9.999999999999999e-139  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.370984  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0655  putative PAS/PAC sensor protein  37.41 
 
 		 580 aa  343  5e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02060  putative PAS/PAC sensor protein  34.13 
 
 		 571 aa  331  2e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2300  putative PAS/PAC sensor protein  35.69 
 
 		 574 aa  317  5e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.252887  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0426  putative PAS/PAC sensor protein  36.81 
 
 		 556 aa  293  8e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0092  putative PAS/PAC sensor protein  34.38 
 
 		 577 aa  289  7e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01770  putative PAS/PAC sensor protein  33.16 
 
 		 584 aa  284  3.0000000000000004e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0752  putative PAS/PAC sensor protein  32.47 
 
 		 559 aa  275  2.0000000000000002e-72  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.801139  hitchhiker  0.0000000000202467 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1585  putative PAS/PAC sensor protein  31.75 
 
 		 573 aa  273  4.0000000000000004e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000290099  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3463  putative PAS/PAC sensor protein  32.06 
 
 		 576 aa  268  1e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.158169  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1889  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  35.43 
 
 		 752 aa  252  1e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0839  putative PAS/PAC sensor protein  31.41 
 
 		 569 aa  241  2.9999999999999997e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00192903 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1713  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  34.75 
 
 		 748 aa  238  2e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000552259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1846  putative PAS/PAC sensor protein  29.77 
 
 		 572 aa  236  5.0000000000000005e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.997362 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1833  ferredoxin 2  28.85 
 
 		 583 aa  232  2e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00530052  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0467  transcriptional regulator, Fis family  30.25 
 
 		 767 aa  215  1.9999999999999998e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02950  putative PAS/PAC sensor protein  31.38 
 
 		 877 aa  204  4e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3802  putative sigma54 specific transcriptional regulator  27.29 
 
 		 759 aa  197  5.000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3885  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  27.75 
 
 		 759 aa  196  8.000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4176  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  28.54 
 
 		 755 aa  196  1e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000648689  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0055  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  27.92 
 
 		 756 aa  194  4e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.928801 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3363  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  29.86 
 
 		 763 aa  189  1e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2305  ferredoxin 2  28.41 
 
 		 500 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2312  Fe binding transcriptional regulator FhlA  28.81 
 
 		 747 aa  173  6.999999999999999e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1292  Fe-S cluster domain protein  29.71 
 
 		 443 aa  153  7e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0178  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  27.06 
 
 		 443 aa  151  3e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0335  hydrogenase large subunit-like protein  27.93 
 
 		 448 aa  140  7.999999999999999e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2145  Fe-S cluster domain-containing protein  28.01 
 
 		 435 aa  136  9.999999999999999e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0725  hydrogenase-like  27.15 
 
 		 483 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000665726  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0093  Fe-S cluster domain protein  25.47 
 
 		 460 aa  130  9.000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000835421 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3798  Fe-S cluster domain-containing protein  28.03 
 
 		 427 aa  126  1e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.818918  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2579  [Fe] hydrogenase  30.77 
 
 		 490 aa  124  6e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2900  [Fe] hydrogenase  31.23 
 
 		 490 aa  122  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0996  hydrogenase large subunit domain protein  30.51 
 
 		 454 aa  121  3e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000195829  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1040  Signal transduction histidine kinase regulating C4-dicarboxylate transport system-like protein  27.59 
 
 		 696 aa  121  3.9999999999999996e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0884  hydrogenase large subunit domain protein  30.23 
 
 		 507 aa  120  9e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.139599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0912  Fe-S cluster domain protein  26.56 
 
 		 443 aa  117  6.9999999999999995e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0477  hydrogenase large subunit  27.52 
 
 		 478 aa  116  1.0000000000000001e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1277  Fe-hydrogenase large subunit family protein  27.78 
 
 		 493 aa  110  5e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000478337  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1794  hydrogenase large subunit  28.47 
 
 		 462 aa  110  6e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02090  hydrogenase large subunit domain protein  26.74 
 
 		 491 aa  110  8.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1371  hydrogenase large subunit domain protein  28.1 
 
 		 508 aa  108  2e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000870686  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0413  hydrogenase large subunit  28.01 
 
 		 485 aa  108  3e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0146308  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0090  ferredoxin hydrogenase  26.9 
 
 		 484 aa  107  5e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0836  hydrogenase large subunit domain protein  29.25 
 
 		 482 aa  105  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000619385  hitchhiker  0.000460922 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02870  Ferredoxin hydrogenase  28.21 
 
 		 456 aa  103  7e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.417058  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2631  Ferredoxin hydrogenase  25.62 
 
 		 490 aa  101  4e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000219307  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0813  hydrogenase large subunit domain protein  28 
 
 		 424 aa  100  5e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.128167  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1440  hydrogenase large subunit  29.88 
 
 		 429 aa  100  5e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0750  hydrogenase large subunit  30.07 
 
 		 482 aa  100  8e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0180769  hitchhiker  0.000000000087178 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0692  Fe-S cluster domain protein  23.89 
 
 		 434 aa  99.4  1e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1708  hydrogenase large subunit domain protein  26.94 
 
 		 435 aa  99  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2303  hydrogenase, Fe-only  27.84 
 
 		 562 aa  96.7  9e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3465  hydrogenase large subunit domain protein  28.22 
 
 		 488 aa  95.1  3e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1319  hydrogenase large subunit  25.61 
 
 		 645 aa  91.3  4e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1367  hydrogenase large subunit  25.61 
 
 		 645 aa  91.3  4e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0137  hydrogenase, Fe-only  29.79 
 
 		 619 aa  90.5  6e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0411  Ferredoxin hydrogenase  26.07 
 
 		 531 aa  90.1  8e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0687694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0225  hydrogenase, Fe-only  26.63 
 
 		 667 aa  89.4  1e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0490  hydrogenase large subunit  24.35 
 
 		 653 aa  89  2e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0261  hydrogenase subunit (ferredoxin)  26.3 
 
 		 449 aa  88.6  3e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.578609  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0430  hydrogenase, Fe-only  25.37 
 
 		 566 aa  87.8  4e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.735126  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01810  NADH dehydrogenase I subunit G  27.66 
 
 		 666 aa  87  8e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000616939  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0560  hydrogenase, Fe-only  26.35 
 
 		 666 aa  86.3  0.000000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00291892  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0270  [Fe] hydrogenase  25.95 
 
 		 449 aa  85.9  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1384  hydrogenases, Fe-only  24.78 
 
 		 606 aa  84  0.000000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1883  ferredoxin hydrogenase  23.28 
 
 		 460 aa  83.2  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0087  hydrogenase, Fe-only  26.92 
 
 		 567 aa  83.2  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1654  hydrogenases, Fe-only  26.62 
 
 		 659 aa  81.3  0.00000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.357121  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3003  hydrogenase, Fe-only  24.69 
 
 		 644 aa  80.5  0.00000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3290  hydrogenases, Fe-only  22.44 
 
 		 594 aa  80.5  0.00000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2056  hydrogenase, Fe-only  26.09 
 
 		 644 aa  80.1  0.00000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000410653  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2502  iron-containing hydrogenase, Hyd gamma  26.69 
 
 		 598 aa  79.3  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1593  Fe-hydrogenase  25 
 
 		 596 aa  76.6  0.000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0533  hydrogenase, Fe-only  23.69 
 
 		 582 aa  75.9  0.000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0310904  normal  0.240554 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2341  iron hydrogenase  22.81 
 
 		 572 aa  75.5  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2037  hydrogenase, Fe-only  23.79 
 
 		 1150 aa  75.9  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.163812  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1085  hydrogenase, Fe-only  26.72 
 
 		 577 aa  73.9  0.000000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2655  iron hydrogenase  22.16 
 
 		 572 aa  73.6  0.000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1651  hydrogenases, Fe-only  26.32 
 
 		 593 aa  73.6  0.000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.556328  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1503  hydrogenase, Fe-only  25.94 
 
 		 418 aa  73.6  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.349556  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1299  hydrogenase, Fe-only  25 
 
 		 579 aa  72.8  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.130328  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2138  hydrogenase, Fe-only  25.27 
 
 		 581 aa  71.6  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000865974  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2467  hydrogenase, Fe-only  25.21 
 
 		 574 aa  69.3  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0172  hydrogenase, Fe-only  27 
 
 		 573 aa  68.9  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0844  hydrogenases, Fe-only  24.91 
 
 		 576 aa  69.3  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0152  hydrogenase, Fe-only  25.62 
 
 		 580 aa  68.9  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1548  hydrogenase, Fe-only  22.02 
 
 		 615 aa  68.2  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0475  ferredoxin hydrogenase  21.54 
 
 		 458 aa  67  0.0000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0625  hydrogenase, Fe-only  22.32 
 
 		 587 aa  67  0.0000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000144729  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1601  hydrogenase, Fe-only  25.44 
 
 		 582 aa  67  0.0000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02980  NADH dehydrogenase I subunit G  24.48 
 
 		 570 aa  66.2  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0938  periplasmic [Fe] hydrogenase 1  26.45 
 
 		 696 aa  66.2  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0625857  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0342  hydrogenase, Fe-only  25.53 
 
 		 582 aa  66.6  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2159  hydrogenase, Fe-only  26.78 
 
 		 582 aa  65.5  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1717  Iron hydrogenase, small subunit  25.63 
 
 		 573 aa  65.5  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.118526  normal  0.410336 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>