260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0494 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0494  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  100 
 
 		 519 aa  1043    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0318  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  51.48 
 
 		 550 aa  536  1e-151  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0556  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  50.46 
 
 		 542 aa  519  1e-146  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1315  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  49.05 
 
 		 521 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000641444  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1371  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  49.43 
 
 		 521 aa  465  9.999999999999999e-131  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.370984  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2300  putative PAS/PAC sensor protein  37.32 
 
 		 574 aa  321  3e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.252887  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0655  putative PAS/PAC sensor protein  37.39 
 
 		 580 aa  318  2e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02060  putative PAS/PAC sensor protein  33.51 
 
 		 571 aa  315  1.9999999999999998e-84  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3463  putative PAS/PAC sensor protein  35.29 
 
 		 576 aa  289  7e-77  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.158169  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0092  putative PAS/PAC sensor protein  35.06 
 
 		 577 aa  287  4e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1585  putative PAS/PAC sensor protein  35.04 
 
 		 573 aa  281  3e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000290099  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0426  putative PAS/PAC sensor protein  33.92 
 
 		 556 aa  279  8e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0752  putative PAS/PAC sensor protein  34.41 
 
 		 559 aa  274  3e-72  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.801139  hitchhiker  0.0000000000202467 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01770  putative PAS/PAC sensor protein  31.84 
 
 		 584 aa  264  3e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1833  ferredoxin 2  30.32 
 
 		 583 aa  247  4e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00530052  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0839  putative PAS/PAC sensor protein  32.8 
 
 		 569 aa  243  6e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00192903 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1846  putative PAS/PAC sensor protein  29.46 
 
 		 572 aa  232  2e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.997362 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1713  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  34.81 
 
 		 748 aa  226  8e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000552259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1889  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  33.81 
 
 		 752 aa  208  2e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2305  ferredoxin 2  31.09 
 
 		 500 aa  195  2e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4176  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  32.23 
 
 		 755 aa  192  2e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000648689  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02950  putative PAS/PAC sensor protein  32.63 
 
 		 877 aa  190  5e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3885  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  30.05 
 
 		 759 aa  189  1e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3363  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  30.29 
 
 		 763 aa  188  2e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3802  putative sigma54 specific transcriptional regulator  29.22 
 
 		 759 aa  188  2e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0467  transcriptional regulator, Fis family  31.18 
 
 		 767 aa  189  2e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0055  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  30.22 
 
 		 756 aa  187  3e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.928801 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2312  Fe binding transcriptional regulator FhlA  30.58 
 
 		 747 aa  182  2e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2145  Fe-S cluster domain-containing protein  27.93 
 
 		 435 aa  131  3e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1292  Fe-S cluster domain protein  27.49 
 
 		 443 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3798  Fe-S cluster domain-containing protein  29.47 
 
 		 427 aa  128  3e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.818918  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0178  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  25.46 
 
 		 443 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0093  Fe-S cluster domain protein  25.67 
 
 		 460 aa  121  3e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000835421 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0335  hydrogenase large subunit-like protein  27.76 
 
 		 448 aa  120  4.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2579  [Fe] hydrogenase  33.22 
 
 		 490 aa  117  5e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02870  Ferredoxin hydrogenase  32.32 
 
 		 456 aa  116  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.417058  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2900  [Fe] hydrogenase  33.22 
 
 		 490 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0912  Fe-S cluster domain protein  27.36 
 
 		 443 aa  113  8.000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1794  hydrogenase large subunit  31.49 
 
 		 462 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0836  hydrogenase large subunit domain protein  32.09 
 
 		 482 aa  103  6e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000619385  hitchhiker  0.000460922 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0725  hydrogenase-like  29.11 
 
 		 483 aa  103  7e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000665726  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02090  hydrogenase large subunit domain protein  29.21 
 
 		 491 aa  103  7e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3465  hydrogenase large subunit domain protein  31.86 
 
 		 488 aa  103  8e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1040  Signal transduction histidine kinase regulating C4-dicarboxylate transport system-like protein  29.1 
 
 		 696 aa  102  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0090  ferredoxin hydrogenase  30.14 
 
 		 484 aa  102  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0413  hydrogenase large subunit  30.32 
 
 		 485 aa  100  4e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0146308  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0477  hydrogenase large subunit  27.05 
 
 		 478 aa  99.8  1e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1277  Fe-hydrogenase large subunit family protein  30.03 
 
 		 493 aa  97.8  4e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000478337  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0884  hydrogenase large subunit domain protein  30.64 
 
 		 507 aa  97.4  6e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.139599  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2631  Ferredoxin hydrogenase  28.93 
 
 		 490 aa  96.7  1e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000219307  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0996  hydrogenase large subunit domain protein  31.16 
 
 		 454 aa  95.1  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000195829  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0692  Fe-S cluster domain protein  22.43 
 
 		 434 aa  92  3e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1371  hydrogenase large subunit domain protein  30.41 
 
 		 508 aa  88.6  3e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000870686  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0750  hydrogenase large subunit  30.48 
 
 		 482 aa  88.2  3e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0180769  hitchhiker  0.000000000087178 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1367  hydrogenase large subunit  27.86 
 
 		 645 aa  88.6  3e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1319  hydrogenase large subunit  27.86 
 
 		 645 aa  87  7e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1440  hydrogenase large subunit  32.39 
 
 		 429 aa  87  8e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0813  hydrogenase large subunit domain protein  29.96 
 
 		 424 aa  85.9  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.128167  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0490  hydrogenase large subunit  25.77 
 
 		 653 aa  84.7  0.000000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0225  hydrogenase, Fe-only  23.38 
 
 		 667 aa  83.6  0.000000000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0411  Ferredoxin hydrogenase  25.98 
 
 		 531 aa  82.4  0.00000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0687694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1708  hydrogenase large subunit domain protein  26.94 
 
 		 435 aa  80.5  0.00000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2303  hydrogenase, Fe-only  24.4 
 
 		 562 aa  75.5  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0560  hydrogenase, Fe-only  28.67 
 
 		 666 aa  73.9  0.000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00291892  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0270  [Fe] hydrogenase  28.1 
 
 		 449 aa  73.2  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0261  hydrogenase subunit (ferredoxin)  28.1 
 
 		 449 aa  72  0.00000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.578609  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0342  hydrogenase, Fe-only  23.8 
 
 		 582 aa  71.2  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3003  hydrogenase, Fe-only  24.15 
 
 		 644 aa  71.2  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2138  hydrogenase, Fe-only  25.7 
 
 		 581 aa  70.9  0.00000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000865974  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0087  hydrogenase, Fe-only  23.66 
 
 		 567 aa  70.1  0.00000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2056  hydrogenase, Fe-only  28.14 
 
 		 644 aa  69.7  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000410653  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0430  hydrogenase, Fe-only  23.69 
 
 		 566 aa  68.9  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.735126  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01810  NADH dehydrogenase I subunit G  25.35 
 
 		 666 aa  67.8  0.0000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000616939  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1085  hydrogenase, Fe-only  25.4 
 
 		 577 aa  67  0.0000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1299  hydrogenase, Fe-only  23.42 
 
 		 579 aa  66.6  0.0000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.130328  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2341  iron hydrogenase  23.04 
 
 		 572 aa  66.2  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2232  hydrogenase, Fe-only  23.43 
 
 		 582 aa  66.2  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2655  iron hydrogenase  22.76 
 
 		 572 aa  65.1  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2037  hydrogenase, Fe-only  22.28 
 
 		 1150 aa  64.7  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.163812  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1593  Fe-hydrogenase  24.57 
 
 		 596 aa  63.2  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1781  hydrogenase, Fe-only  24.31 
 
 		 578 aa  61.2  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0137  hydrogenase, Fe-only  21.87 
 
 		 619 aa  60.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3290  hydrogenases, Fe-only  23.97 
 
 		 594 aa  59.7  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1883  ferredoxin hydrogenase  22.89 
 
 		 460 aa  58.5  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1601  hydrogenase, Fe-only  24.05 
 
 		 582 aa  58.9  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1386  hydrogenases, Fe-only  27.14 
 
 		 421 aa  59.3  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.999103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4048  putative PAS/PAC sensor protein  48.15 
 
 		 168 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.606719  normal  0.0467055 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3805  hydrogenase, Fe-only  24.3 
 
 		 582 aa  58.5  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2467  hydrogenase, Fe-only  22.85 
 
 		 574 aa  58.5  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1783  hydrogenase, Fe-only  24.65 
 
 		 583 aa  58.2  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02980  NADH dehydrogenase I subunit G  23.79 
 
 		 570 aa  58.2  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0152  hydrogenase, Fe-only  22.32 
 
 		 580 aa  56.2  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06330  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 75 kDa subunit  23.61 
 
 		 578 aa  56.2  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00021405  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1651  hydrogenases, Fe-only  22.89 
 
 		 593 aa  56.6  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.556328  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2159  hydrogenase, Fe-only  24.21 
 
 		 582 aa  55.5  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4621  hydrogenase, Fe-only  21.53 
 
 		 527 aa  55.8  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0150  hydrogenase, Fe-only  27.2 
 
 		 585 aa  55.8  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0236  hydrogenase, Fe-only  24.21 
 
 		 586 aa  56.2  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.660897  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1337  hydrogenase, Fe-only  24.05 
 
 		 590 aa  55.1  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1605  NAD-reducing iron-only hydrogenase large subunit  23.89 
 
 		 585 aa  54.7  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>