24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_4048 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_4048  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 		 168 aa  340  5.999999999999999e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.606719  normal  0.0467055 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0517  PAS domain-containing protein  44.03 
 
 		 166 aa  147  5e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00238145  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02060  putative PAS/PAC sensor protein  34.46 
 
 		 571 aa  105  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0655  putative PAS/PAC sensor protein  34.36 
 
 		 580 aa  103  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01770  putative PAS/PAC sensor protein  38.51 
 
 		 584 aa  100  9e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1585  putative PAS/PAC sensor protein  34.21 
 
 		 573 aa  89.7  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000290099  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0752  putative PAS/PAC sensor protein  34.03 
 
 		 559 aa  85.1  4e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.801139  hitchhiker  0.0000000000202467 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0426  putative PAS/PAC sensor protein  35.14 
 
 		 556 aa  82.4  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0092  putative PAS/PAC sensor protein  32.7 
 
 		 577 aa  82  0.000000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0839  putative PAS/PAC sensor protein  30.13 
 
 		 569 aa  80.9  0.000000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00192903 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3463  putative PAS/PAC sensor protein  31.29 
 
 		 576 aa  77.4  0.00000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.158169  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1371  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  44.16 
 
 		 521 aa  66.6  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.370984  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1315  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  44.16 
 
 		 521 aa  66.2  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000641444  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2300  putative PAS/PAC sensor protein  24.85 
 
 		 574 aa  62.4  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.252887  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0318  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.67 
 
 		 550 aa  61.2  0.000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0556  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.53 
 
 		 542 aa  59.3  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0494  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  48.15 
 
 		 519 aa  58.2  0.00000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1846  putative PAS/PAC sensor protein  27.33 
 
 		 572 aa  51.6  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.997362 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3912  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.81 
 
 		 912 aa  47  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.237166  normal  0.236216 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0420  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  30.43 
 
 		 790 aa  43.9  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.252746  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4431  signal transduction histidine kinase  23.85 
 
 		 767 aa  43.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.222195  normal  0.392293 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1833  ferredoxin 2  26.28 
 
 		 583 aa  42.7  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00530052  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1136  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  26.5 
 
 		 799 aa  41.6  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.415908  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1946  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.73 
 
 		 734 aa  40.8  0.008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0751397  normal  0.355386 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>