More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0560 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_0560  hydrogenase, Fe-only  100 
 
 
666 aa  1357    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00291892  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1319  hydrogenase large subunit  63.59 
 
 
645 aa  861    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1367  hydrogenase large subunit  63.59 
 
 
645 aa  863    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0225  hydrogenase, Fe-only  61.76 
 
 
667 aa  853    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0490  hydrogenase large subunit  62.01 
 
 
653 aa  871    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01810  NADH dehydrogenase I subunit G  48.16 
 
 
666 aa  588  1e-167  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000616939  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1490  hydrogenases, Fe-only  43.48 
 
 
601 aa  491  1e-137  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2303  hydrogenase, Fe-only  45.1 
 
 
562 aa  479  1e-134  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1654  hydrogenases, Fe-only  42.17 
 
 
659 aa  481  1e-134  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.357121  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2138  hydrogenase, Fe-only  43.75 
 
 
581 aa  475  1e-132  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000865974  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2232  hydrogenase, Fe-only  41.28 
 
 
582 aa  457  1e-127  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0342  hydrogenase, Fe-only  42.53 
 
 
582 aa  454  1.0000000000000001e-126  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06330  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 75 kDa subunit  42.76 
 
 
578 aa  450  1e-125  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00021405  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1299  hydrogenase, Fe-only  41.49 
 
 
579 aa  451  1e-125  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.130328  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0087  hydrogenase, Fe-only  41.42 
 
 
567 aa  448  1.0000000000000001e-124  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1783  hydrogenase, Fe-only  43.33 
 
 
583 aa  441  9.999999999999999e-123  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0430  hydrogenase, Fe-only  43.94 
 
 
566 aa  439  9.999999999999999e-123  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.735126  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1781  hydrogenase, Fe-only  42.39 
 
 
578 aa  437  1e-121  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0844  hydrogenases, Fe-only  39.47 
 
 
576 aa  432  1e-120  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1149  hydrogenase, Fe-only  42.86 
 
 
569 aa  426  1e-118  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000253121  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2467  hydrogenase, Fe-only  40.07 
 
 
574 aa  423  1e-117  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1337  hydrogenase, Fe-only  40.51 
 
 
590 aa  422  1e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0172  hydrogenase, Fe-only  40.62 
 
 
573 aa  421  1e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1651  hydrogenases, Fe-only  40.66 
 
 
593 aa  421  1e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.556328  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02980  NADH dehydrogenase I subunit G  42.25 
 
 
570 aa  421  1e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1717  Iron hydrogenase, small subunit  41.38 
 
 
573 aa  413  1e-114  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.118526  normal  0.410336 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3805  hydrogenase, Fe-only  39.04 
 
 
582 aa  404  1e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0152  hydrogenase, Fe-only  40.17 
 
 
580 aa  405  1e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0147  [Fe] hydrogenase, large subunit HymC, putative  38.45 
 
 
573 aa  400  9.999999999999999e-111  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0224  hydrogenase, Fe-only  38.87 
 
 
573 aa  402  9.999999999999999e-111  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1085  hydrogenase, Fe-only  39.45 
 
 
577 aa  398  1e-109  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3601  hydrogenase, Fe-only  39.61 
 
 
587 aa  397  1e-109  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0625  hydrogenase, Fe-only  39.72 
 
 
587 aa  397  1e-109  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000144729  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0723  hydrogenase, Fe-only  38.11 
 
 
578 aa  396  1e-109  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_155  [Fe] hydrogenase, Hym C subunit  38.1 
 
 
573 aa  397  1e-109  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1601  hydrogenase, Fe-only  38 
 
 
582 aa  394  1e-108  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0150  hydrogenase, Fe-only  39.72 
 
 
585 aa  393  1e-108  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1017  iron hydrogenase, small subunit  38.46 
 
 
574 aa  393  1e-108  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3829  hydrogenase, Fe-only  38.24 
 
 
625 aa  390  1e-107  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1384  hydrogenases, Fe-only  38.08 
 
 
606 aa  388  1e-106  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0723  hydrogenase, Fe-only  39.42 
 
 
582 aa  387  1e-106  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1605  NAD-reducing iron-only hydrogenase large subunit  37.89 
 
 
585 aa  386  1e-106  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1548  hydrogenase, Fe-only  37.59 
 
 
615 aa  385  1e-106  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0747  hydrogenase, Fe-only  39.55 
 
 
582 aa  387  1e-106  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0236  hydrogenase, Fe-only  38.93 
 
 
586 aa  385  1e-105  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.660897  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3290  hydrogenases, Fe-only  38.05 
 
 
594 aa  380  1e-104  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1633  NAD-reducing iron-only hydrogenase large subunit  37.27 
 
 
585 aa  376  1e-103  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000469619  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0533  hydrogenase, Fe-only  36.3 
 
 
582 aa  360  6e-98  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0310904  normal  0.240554 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2159  hydrogenase, Fe-only  38.37 
 
 
582 aa  356  5.999999999999999e-97  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1544  hydrogenase, Fe-only  36.79 
 
 
581 aa  355  1e-96  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.557218 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1593  Fe-hydrogenase  34.74 
 
 
596 aa  353  5.9999999999999994e-96  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2436  (Fe) hydrogenase, large subunit HymC, putative  37.61 
 
 
563 aa  350  7e-95  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000128912  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0137  hydrogenase, Fe-only  35.51 
 
 
619 aa  345  2e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2502  iron-containing hydrogenase, Hyd gamma  35.48 
 
 
598 aa  343  5e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16530  hydrogenase, Fe-only  34.15 
 
 
569 aa  340  5e-92  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.143158  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2341  iron hydrogenase  35.6 
 
 
572 aa  333  5e-90  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2655  iron hydrogenase  34.9 
 
 
572 aa  328  2.0000000000000001e-88  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3003  hydrogenase, Fe-only  35.51 
 
 
644 aa  327  5e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0463  hydrogenases, Fe-only  37.64 
 
 
520 aa  305  2.0000000000000002e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2037  hydrogenase, Fe-only  33.27 
 
 
1150 aa  296  9e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.163812  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0168  hydrogenase, Fe-only  36.85 
 
 
513 aa  295  3e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.191335  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4621  hydrogenase, Fe-only  35.59 
 
 
527 aa  284  5.000000000000001e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0290  hydrogenase, Fe-only  33.98 
 
 
549 aa  279  1e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.199872  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0475  ferredoxin hydrogenase  35.29 
 
 
458 aa  268  2.9999999999999995e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0157  hydrogenase, Fe-only  35.48 
 
 
523 aa  264  4.999999999999999e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.434937  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2056  hydrogenase, Fe-only  34.84 
 
 
644 aa  237  5.0000000000000005e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000410653  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3250  hydrogenases, Fe-only  38.31 
 
 
410 aa  236  8e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.644479  hitchhiker  0.0000163586 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3920  periplasmic Fe hydrogenase, large subunit  38.31 
 
 
410 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0711  response regulator receiver protein  38.03 
 
 
410 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.312278  hitchhiker  0.0000873565 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0938  periplasmic [Fe] hydrogenase 1  35.78 
 
 
696 aa  234  5e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0625857  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1883  ferredoxin hydrogenase  33.56 
 
 
460 aa  233  7.000000000000001e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1076  [Fe] hydrogenase  35.32 
 
 
696 aa  233  9e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.723256  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2281  ferredoxin hydrogenase  36.39 
 
 
439 aa  230  8e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0848  hydrogenases, Fe-only  34.29 
 
 
417 aa  222  1.9999999999999999e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1925  ferredoxin hydrogenase  36.96 
 
 
387 aa  216  9.999999999999999e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0156  formate dehydrogenase, alpha subunit  47.06 
 
 
898 aa  192  1e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1386  hydrogenases, Fe-only  35.18 
 
 
421 aa  192  2e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.999103  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1503  hydrogenase, Fe-only  33.59 
 
 
418 aa  187  6e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.349556  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0081  ferredoxin hydrogenase  34.35 
 
 
421 aa  185  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3507  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.39 
 
 
893 aa  184  4.0000000000000006e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1856  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  45.1 
 
 
351 aa  182  1e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1398  formate dehydrogenase, alpha subunit  45.1 
 
 
893 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0100  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.12 
 
 
893 aa  180  8e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000102152  hitchhiker  0.000000000000206048 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3503  formate dehydrogenase, alpha subunit  47.87 
 
 
900 aa  180  9e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1888  ferredoxin  46.52 
 
 
307 aa  178  2e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3504  ferredoxin  43.48 
 
 
312 aa  178  3e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1029  NADH dehydrogenase I chain G  44.8 
 
 
358 aa  178  3e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0623  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.59 
 
 
948 aa  177  5e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.816724  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1831  NADH dehydrogenase I chain G  46.83 
 
 
363 aa  176  9.999999999999999e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0724  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.12 
 
 
948 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.696908  normal  0.792249 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0805  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.12 
 
 
948 aa  174  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.624345  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3019  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.87 
 
 
957 aa  173  7.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0785  NADH dehydrogenase I chain G  40.98 
 
 
353 aa  172  1e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0839  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.31 
 
 
946 aa  171  4e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.331727  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0835  anaerobic dehydrogenase  41.83 
 
 
305 aa  171  6e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0334  NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit G, iron-sulphur binding protein  43.19 
 
 
826 aa  169  1e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4645  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.72 
 
 
948 aa  167  4e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1861  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.06 
 
 
978 aa  167  4e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3509  formate dehydrogenase, alpha subunit  45.5 
 
 
905 aa  167  4e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.434543  normal  0.526227 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4097  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.18 
 
 
959 aa  166  1.0000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>