More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1651 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_0342  hydrogenase, Fe-only  59.79 
 
 
582 aa  721    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3805  hydrogenase, Fe-only  54.97 
 
 
582 aa  645    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06330  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 75 kDa subunit  59.06 
 
 
578 aa  688    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00021405  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2467  hydrogenase, Fe-only  55.88 
 
 
574 aa  650    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1783  hydrogenase, Fe-only  62.43 
 
 
583 aa  720    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1717  Iron hydrogenase, small subunit  63.95 
 
 
573 aa  764    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.118526  normal  0.410336 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1651  hydrogenases, Fe-only  100 
 
 
593 aa  1226    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.556328  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1337  hydrogenase, Fe-only  63.02 
 
 
590 aa  715    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1299  hydrogenase, Fe-only  58.93 
 
 
579 aa  714    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.130328  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2138  hydrogenase, Fe-only  59.66 
 
 
581 aa  728    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000865974  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0172  hydrogenase, Fe-only  64.12 
 
 
573 aa  758    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0152  hydrogenase, Fe-only  60.83 
 
 
580 aa  701    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2232  hydrogenase, Fe-only  59.28 
 
 
582 aa  718    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1781  hydrogenase, Fe-only  61.22 
 
 
578 aa  702    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0844  hydrogenases, Fe-only  62.63 
 
 
576 aa  754    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0224  hydrogenase, Fe-only  54.36 
 
 
573 aa  630  1e-179  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1017  iron hydrogenase, small subunit  56.87 
 
 
574 aa  629  1e-179  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0147  [Fe] hydrogenase, large subunit HymC, putative  53.48 
 
 
573 aa  628  1e-178  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_155  [Fe] hydrogenase, Hym C subunit  53.14 
 
 
573 aa  626  1e-178  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1149  hydrogenase, Fe-only  54.01 
 
 
569 aa  610  1e-173  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000253121  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1605  NAD-reducing iron-only hydrogenase large subunit  53.48 
 
 
585 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3829  hydrogenase, Fe-only  51.03 
 
 
625 aa  598  1e-170  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0150  hydrogenase, Fe-only  52.14 
 
 
585 aa  597  1e-169  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3290  hydrogenases, Fe-only  49.23 
 
 
594 aa  591  1e-167  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02980  NADH dehydrogenase I subunit G  53.55 
 
 
570 aa  589  1e-167  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1633  NAD-reducing iron-only hydrogenase large subunit  52.9 
 
 
585 aa  587  1e-166  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000469619  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1085  hydrogenase, Fe-only  50.52 
 
 
577 aa  582  1.0000000000000001e-165  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3601  hydrogenase, Fe-only  51.46 
 
 
587 aa  585  1.0000000000000001e-165  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2436  (Fe) hydrogenase, large subunit HymC, putative  52.8 
 
 
563 aa  583  1.0000000000000001e-165  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000128912  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1548  hydrogenase, Fe-only  50.26 
 
 
615 aa  580  1e-164  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0625  hydrogenase, Fe-only  50.26 
 
 
587 aa  577  1.0000000000000001e-163  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000144729  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01810  NADH dehydrogenase I subunit G  50.62 
 
 
666 aa  570  1e-161  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000616939  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0723  hydrogenase, Fe-only  50.35 
 
 
578 aa  568  1e-161  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1601  hydrogenase, Fe-only  50.09 
 
 
582 aa  570  1e-161  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0747  hydrogenase, Fe-only  50.34 
 
 
582 aa  565  1e-160  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0723  hydrogenase, Fe-only  50.43 
 
 
582 aa  561  1e-158  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0236  hydrogenase, Fe-only  49.06 
 
 
586 aa  554  1e-156  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.660897  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1544  hydrogenase, Fe-only  48.45 
 
 
581 aa  536  1e-151  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.557218 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2303  hydrogenase, Fe-only  45.19 
 
 
562 aa  526  1e-148  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1490  hydrogenases, Fe-only  43.9 
 
 
601 aa  525  1e-148  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0533  hydrogenase, Fe-only  47.21 
 
 
582 aa  524  1e-147  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0310904  normal  0.240554 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2502  iron-containing hydrogenase, Hyd gamma  47.4 
 
 
598 aa  519  1e-146  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2159  hydrogenase, Fe-only  46.15 
 
 
582 aa  508  1e-143  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0430  hydrogenase, Fe-only  45.44 
 
 
566 aa  503  1e-141  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.735126  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0168  hydrogenase, Fe-only  54.92 
 
 
513 aa  501  1e-140  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.191335  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1384  hydrogenases, Fe-only  46.37 
 
 
606 aa  498  1e-139  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0137  hydrogenase, Fe-only  43.74 
 
 
619 aa  496  1e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0087  hydrogenase, Fe-only  44.01 
 
 
567 aa  494  9.999999999999999e-139  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0463  hydrogenases, Fe-only  54.53 
 
 
520 aa  491  1e-137  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0290  hydrogenase, Fe-only  52.02 
 
 
549 aa  484  1e-135  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.199872  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0157  hydrogenase, Fe-only  55.91 
 
 
523 aa  479  1e-134  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.434937  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1593  Fe-hydrogenase  44.16 
 
 
596 aa  476  1e-133  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1654  hydrogenases, Fe-only  46.21 
 
 
659 aa  471  1.0000000000000001e-131  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.357121  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2341  iron hydrogenase  40.84 
 
 
572 aa  459  9.999999999999999e-129  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2655  iron hydrogenase  40.84 
 
 
572 aa  456  1e-127  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4621  hydrogenase, Fe-only  50.22 
 
 
527 aa  449  1e-125  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16530  hydrogenase, Fe-only  43.61 
 
 
569 aa  444  1e-123  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.143158  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0225  hydrogenase, Fe-only  39.79 
 
 
667 aa  441  9.999999999999999e-123  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0490  hydrogenase large subunit  41.61 
 
 
653 aa  435  1e-120  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0560  hydrogenase, Fe-only  40.66 
 
 
666 aa  431  1e-119  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00291892  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1367  hydrogenase large subunit  40.94 
 
 
645 aa  411  1e-113  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1319  hydrogenase large subunit  40.94 
 
 
645 aa  410  1e-113  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0475  ferredoxin hydrogenase  48.42 
 
 
458 aa  396  1e-109  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1076  [Fe] hydrogenase  46.34 
 
 
696 aa  399  1e-109  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.723256  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0938  periplasmic [Fe] hydrogenase 1  46.24 
 
 
696 aa  398  1e-109  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0625857  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1883  ferredoxin hydrogenase  41.77 
 
 
460 aa  362  1e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3003  hydrogenase, Fe-only  42.47 
 
 
644 aa  359  9e-98  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1925  ferredoxin hydrogenase  53.25 
 
 
387 aa  357  3.9999999999999996e-97  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2037  hydrogenase, Fe-only  39.29 
 
 
1150 aa  347  4e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.163812  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2056  hydrogenase, Fe-only  46.39 
 
 
644 aa  342  1e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000410653  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2281  ferredoxin hydrogenase  44.18 
 
 
439 aa  332  1e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0848  hydrogenases, Fe-only  46.67 
 
 
417 aa  322  1.9999999999999998e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1386  hydrogenases, Fe-only  51.13 
 
 
421 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.999103  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1503  hydrogenase, Fe-only  44.83 
 
 
418 aa  309  6.999999999999999e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.349556  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3920  periplasmic Fe hydrogenase, large subunit  46.42 
 
 
410 aa  302  1e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0081  ferredoxin hydrogenase  45.29 
 
 
421 aa  302  1e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3250  hydrogenases, Fe-only  46.42 
 
 
410 aa  302  1e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.644479  hitchhiker  0.0000163586 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0711  response regulator receiver protein  46.42 
 
 
410 aa  302  1e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.312278  hitchhiker  0.0000873565 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0310  ferredoxin hydrogenase  31.7 
 
 
462 aa  204  3e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0100  formate dehydrogenase, alpha subunit  45.93 
 
 
893 aa  201  3e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000102152  hitchhiker  0.000000000000206048 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3503  formate dehydrogenase, alpha subunit  45.25 
 
 
900 aa  196  1e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3507  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.8 
 
 
893 aa  194  4e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3504  ferredoxin  41.04 
 
 
312 aa  194  4e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0839  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.38 
 
 
946 aa  192  2e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.331727  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0156  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.77 
 
 
898 aa  192  2e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0724  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.35 
 
 
948 aa  191  4e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.696908  normal  0.792249 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1029  NADH dehydrogenase I chain G  39.85 
 
 
358 aa  189  1e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1888  ferredoxin  42.53 
 
 
307 aa  187  4e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0967  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.35 
 
 
984 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2595  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.35 
 
 
984 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.619743  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0450  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.35 
 
 
984 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.858013  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2902  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.35 
 
 
984 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.679741  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3012  NAD-dependent formate dehydrogenase alpha subunit  41.35 
 
 
984 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.467116  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0180  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.35 
 
 
984 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0386  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.06 
 
 
917 aa  185  2.0000000000000003e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.118073  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2964  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.35 
 
 
984 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0805  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.9 
 
 
948 aa  184  6e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.624345  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0727  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.38 
 
 
979 aa  183  8.000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0216931  normal  0.398444 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0623  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.38 
 
 
948 aa  183  8.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.816724  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0334  NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit G, iron-sulphur binding protein  44.65 
 
 
826 aa  183  8.000000000000001e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>