More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1337 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0147  [Fe] hydrogenase, large subunit HymC, putative  55.17 
 
 		 573 aa  644    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0172  hydrogenase, Fe-only  67.48 
 
 		 573 aa  783    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_155  [Fe] hydrogenase, Hym C subunit  54.82 
 
 		 573 aa  637    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1651  hydrogenases, Fe-only  63.02 
 
 		 593 aa  726    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.556328  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0152  hydrogenase, Fe-only  64.17 
 
 		 580 aa  754    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06330  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 75 kDa subunit  58.78 
 
 		 578 aa  706    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00021405  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2138  hydrogenase, Fe-only  59.07 
 
 		 581 aa  706    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000865974  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2232  hydrogenase, Fe-only  56.03 
 
 		 582 aa  680    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0224  hydrogenase, Fe-only  56.04 
 
 		 573 aa  643    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1781  hydrogenase, Fe-only  66.09 
 
 		 578 aa  764    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1717  Iron hydrogenase, small subunit  65.16 
 
 		 573 aa  751    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.118526  normal  0.410336 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0342  hydrogenase, Fe-only  58.62 
 
 		 582 aa  703    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1299  hydrogenase, Fe-only  58.13 
 
 		 579 aa  687    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.130328  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1783  hydrogenase, Fe-only  66.27 
 
 		 583 aa  757    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0844  hydrogenases, Fe-only  63.4 
 
 		 576 aa  730    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1337  hydrogenase, Fe-only  100 
 
 		 590 aa  1208    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2467  hydrogenase, Fe-only  53.12 
 
 		 574 aa  630  1e-179  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3805  hydrogenase, Fe-only  52.76 
 
 		 582 aa  625  1e-178  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0150  hydrogenase, Fe-only  54.62 
 
 		 585 aa  617  1e-175  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3829  hydrogenase, Fe-only  53.04 
 
 		 625 aa  612  9.999999999999999e-175  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1605  NAD-reducing iron-only hydrogenase large subunit  54.37 
 
 		 585 aa  609  1e-173  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1633  NAD-reducing iron-only hydrogenase large subunit  54.37 
 
 		 585 aa  607  9.999999999999999e-173  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000469619  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3290  hydrogenases, Fe-only  50.77 
 
 		 594 aa  604  1.0000000000000001e-171  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02980  NADH dehydrogenase I subunit G  54.96 
 
 		 570 aa  596  1e-169  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1017  iron hydrogenase, small subunit  54.37 
 
 		 574 aa  595  1e-169  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0625  hydrogenase, Fe-only  52.06 
 
 		 587 aa  593  1e-168  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000144729  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1149  hydrogenase, Fe-only  53.14 
 
 		 569 aa  589  1e-167  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000253121  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1548  hydrogenase, Fe-only  52.23 
 
 		 615 aa  587  1e-166  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0723  hydrogenase, Fe-only  52.76 
 
 		 578 aa  578  1e-164  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0747  hydrogenase, Fe-only  51.72 
 
 		 582 aa  569  1e-161  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0236  hydrogenase, Fe-only  51.05 
 
 		 586 aa  569  1e-161  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.660897  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1085  hydrogenase, Fe-only  50.17 
 
 		 577 aa  571  1e-161  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0723  hydrogenase, Fe-only  51.38 
 
 		 582 aa  567  1e-160  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3601  hydrogenase, Fe-only  50.34 
 
 		 587 aa  566  1e-160  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1601  hydrogenase, Fe-only  49.22 
 
 		 582 aa  566  1e-160  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1544  hydrogenase, Fe-only  51.13 
 
 		 581 aa  550  1e-155  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.557218 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0533  hydrogenase, Fe-only  48.95 
 
 		 582 aa  549  1e-155  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0310904  normal  0.240554 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01810  NADH dehydrogenase I subunit G  48.34 
 
 		 666 aa  548  1e-154  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000616939  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2502  iron-containing hydrogenase, Hyd gamma  49.39 
 
 		 598 aa  542  1e-153  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1384  hydrogenases, Fe-only  50.6 
 
 		 606 aa  531  1e-149  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2436  (Fe) hydrogenase, large subunit HymC, putative  50.88 
 
 		 563 aa  530  1e-149  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000128912  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2159  hydrogenase, Fe-only  48.44 
 
 		 582 aa  525  1e-148  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2341  iron hydrogenase  44.06 
 
 		 572 aa  504  1e-141  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1490  hydrogenases, Fe-only  44.19 
 
 		 601 aa  504  1e-141  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2303  hydrogenase, Fe-only  44.75 
 
 		 562 aa  502  1e-141  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2655  iron hydrogenase  44.06 
 
 		 572 aa  500  1e-140  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0137  hydrogenase, Fe-only  44.75 
 
 		 619 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1654  hydrogenases, Fe-only  44.87 
 
 		 659 aa  490  1e-137  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.357121  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0087  hydrogenase, Fe-only  43.71 
 
 		 567 aa  477  1e-133  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0290  hydrogenase, Fe-only  52.7 
 
 		 549 aa  474  1e-132  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.199872  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0168  hydrogenase, Fe-only  55.16 
 
 		 513 aa  474  1e-132  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.191335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0463  hydrogenases, Fe-only  52.58 
 
 		 520 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4621  hydrogenase, Fe-only  53.22 
 
 		 527 aa  471  1.0000000000000001e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0157  hydrogenase, Fe-only  56.04 
 
 		 523 aa  472  1.0000000000000001e-131  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.434937  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1593  Fe-hydrogenase  44.52 
 
 		 596 aa  468  9.999999999999999e-131  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0430  hydrogenase, Fe-only  43.86 
 
 		 566 aa  467  9.999999999999999e-131  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.735126  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0225  hydrogenase, Fe-only  41.74 
 
 		 667 aa  459  9.999999999999999e-129  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16530  hydrogenase, Fe-only  44.1 
 
 		 569 aa  451  1e-125  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.143158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0560  hydrogenase, Fe-only  40.37 
 
 		 666 aa  443  1e-123  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00291892  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0490  hydrogenase large subunit  41.33 
 
 		 653 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1319  hydrogenase large subunit  41.5 
 
 		 645 aa  431  1e-119  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1367  hydrogenase large subunit  41.5 
 
 		 645 aa  431  1e-119  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3003  hydrogenase, Fe-only  44.49 
 
 		 644 aa  393  1e-108  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0475  ferredoxin hydrogenase  46.83 
 
 		 458 aa  391  1e-107  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1076  [Fe] hydrogenase  46.04 
 
 		 696 aa  384  1e-105  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.723256  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0938  periplasmic [Fe] hydrogenase 1  45.99 
 
 		 696 aa  385  1e-105  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0625857  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1925  ferredoxin hydrogenase  51.64 
 
 		 387 aa  383  1e-105  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1883  ferredoxin hydrogenase  43.56 
 
 		 460 aa  367  1e-100  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2037  hydrogenase, Fe-only  40.88 
 
 		 1150 aa  366  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.163812  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2281  ferredoxin hydrogenase  49.03 
 
 		 439 aa  355  1e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0848  hydrogenases, Fe-only  48.12 
 
 		 417 aa  338  9.999999999999999e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2056  hydrogenase, Fe-only  42.6 
 
 		 644 aa  331  2e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000410653  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1386  hydrogenases, Fe-only  48.22 
 
 		 421 aa  324  3e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.999103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0081  ferredoxin hydrogenase  43.43 
 
 		 421 aa  308  2.0000000000000002e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1503  hydrogenase, Fe-only  46.55 
 
 		 418 aa  307  3e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.349556  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3250  hydrogenases, Fe-only  43.48 
 
 		 410 aa  303  5.000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.644479  hitchhiker  0.0000163586 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0711  response regulator receiver protein  43.48 
 
 		 410 aa  303  5.000000000000001e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.312278  hitchhiker  0.0000873565 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3920  periplasmic Fe hydrogenase, large subunit  43.48 
 
 		 410 aa  303  7.000000000000001e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0310  ferredoxin hydrogenase  33.05 
 
 		 462 aa  216  8e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3504  ferredoxin  41.42 
 
 		 312 aa  199  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0156  formate dehydrogenase, alpha subunit  48.58 
 
 		 898 aa  197  4.0000000000000005e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3507  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.37 
 
 		 893 aa  197  4.0000000000000005e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3503  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.37 
 
 		 900 aa  196  8.000000000000001e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0100  formate dehydrogenase, alpha subunit  47.32 
 
 		 893 aa  194  4e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000102152  hitchhiker  0.000000000000206048 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1398  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.27 
 
 		 893 aa  187  3e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1888  ferredoxin  46.63 
 
 		 307 aa  187  4e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2366  formate dehydrogenase, alpha subunit  45.24 
 
 		 983 aa  184  3e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.739285 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3019  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.89 
 
 		 957 aa  184  4.0000000000000006e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0389  formate dehydrogenase, alpha subunit  45.45 
 
 		 944 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1809  formate dehydrogenase, alpha subunit  45.28 
 
 		 960 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.550904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0895  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.76 
 
 		 983 aa  184  6e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.99873  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2185  formate dehydrogenase, alpha subunit  45.28 
 
 		 960 aa  183  7e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.602321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3552  formate dehydrogenase, alpha subunit  45.28 
 
 		 960 aa  183  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3023  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.42 
 
 		 982 aa  183  9.000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0162015  normal  0.0152175 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0964  NAD-dependent formate dehydrogenase, alpha subunit  42.86 
 
 		 982 aa  183  9.000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.133867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4144  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.76 
 
 		 983 aa  181  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3710  NAD-dependent formate dehydrogenase alpha subunit  41.77 
 
 		 977 aa  181  2e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.749683  normal  0.699855 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1708  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.34 
 
 		 959 aa  182  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0727  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.29 
 
 		 979 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0216931  normal  0.398444 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2383  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.29 
 
 		 959 aa  181  4e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>