More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_0150 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013522  Taci_0150  hydrogenase, Fe-only  100 
 
 
585 aa  1210    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1085  hydrogenase, Fe-only  57.93 
 
 
577 aa  650    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0625  hydrogenase, Fe-only  70.43 
 
 
587 aa  844    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000144729  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3290  hydrogenases, Fe-only  60.78 
 
 
594 aa  736    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1605  NAD-reducing iron-only hydrogenase large subunit  73.58 
 
 
585 aa  889    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1633  NAD-reducing iron-only hydrogenase large subunit  70.94 
 
 
585 aa  860    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000469619  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0723  hydrogenase, Fe-only  58.55 
 
 
578 aa  672    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0342  hydrogenase, Fe-only  53.99 
 
 
582 aa  642    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1299  hydrogenase, Fe-only  55.54 
 
 
579 aa  664    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.130328  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3601  hydrogenase, Fe-only  67.69 
 
 
587 aa  826    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2138  hydrogenase, Fe-only  53.6 
 
 
581 aa  640    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000865974  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2232  hydrogenase, Fe-only  52.21 
 
 
582 aa  629  1e-179  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0172  hydrogenase, Fe-only  55.23 
 
 
573 aa  631  1e-179  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1717  Iron hydrogenase, small subunit  55.5 
 
 
573 aa  623  1e-177  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.118526  normal  0.410336 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06330  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 75 kDa subunit  53 
 
 
578 aa  616  1e-175  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00021405  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3805  hydrogenase, Fe-only  52.29 
 
 
582 aa  604  1.0000000000000001e-171  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0844  hydrogenases, Fe-only  53.86 
 
 
576 aa  604  1.0000000000000001e-171  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1337  hydrogenase, Fe-only  53.6 
 
 
590 aa  603  1.0000000000000001e-171  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1651  hydrogenases, Fe-only  52.14 
 
 
593 aa  591  1e-167  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.556328  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1783  hydrogenase, Fe-only  53.7 
 
 
583 aa  591  1e-167  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1781  hydrogenase, Fe-only  52.74 
 
 
578 aa  582  1.0000000000000001e-165  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1017  iron hydrogenase, small subunit  52.23 
 
 
574 aa  577  1.0000000000000001e-163  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0152  hydrogenase, Fe-only  51.55 
 
 
580 aa  573  1.0000000000000001e-162  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3829  hydrogenase, Fe-only  51.1 
 
 
625 aa  574  1.0000000000000001e-162  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2467  hydrogenase, Fe-only  48.38 
 
 
574 aa  559  1e-158  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0723  hydrogenase, Fe-only  50.43 
 
 
582 aa  558  1e-158  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0747  hydrogenase, Fe-only  50.09 
 
 
582 aa  557  1e-157  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1601  hydrogenase, Fe-only  48.13 
 
 
582 aa  550  1e-155  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0236  hydrogenase, Fe-only  49.83 
 
 
586 aa  551  1e-155  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.660897  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0224  hydrogenase, Fe-only  49.14 
 
 
573 aa  544  1e-153  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0147  [Fe] hydrogenase, large subunit HymC, putative  48.63 
 
 
573 aa  539  9.999999999999999e-153  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_155  [Fe] hydrogenase, Hym C subunit  48.63 
 
 
573 aa  540  9.999999999999999e-153  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1149  hydrogenase, Fe-only  48.38 
 
 
569 aa  539  9.999999999999999e-153  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000253121  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02980  NADH dehydrogenase I subunit G  49.57 
 
 
570 aa  534  1e-150  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1544  hydrogenase, Fe-only  47.79 
 
 
581 aa  527  1e-148  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.557218 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1548  hydrogenase, Fe-only  48.22 
 
 
615 aa  518  1.0000000000000001e-145  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01810  NADH dehydrogenase I subunit G  47 
 
 
666 aa  517  1.0000000000000001e-145  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000616939  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0533  hydrogenase, Fe-only  45.47 
 
 
582 aa  498  1e-139  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0310904  normal  0.240554 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0137  hydrogenase, Fe-only  44.26 
 
 
619 aa  498  1e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2436  (Fe) hydrogenase, large subunit HymC, putative  45.98 
 
 
563 aa  493  9.999999999999999e-139  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000128912  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2502  iron-containing hydrogenase, Hyd gamma  44.76 
 
 
598 aa  476  1e-133  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1490  hydrogenases, Fe-only  43.94 
 
 
601 aa  478  1e-133  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1384  hydrogenases, Fe-only  44.71 
 
 
606 aa  471  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2303  hydrogenase, Fe-only  42.49 
 
 
562 aa  471  1.0000000000000001e-131  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2159  hydrogenase, Fe-only  44.63 
 
 
582 aa  462  1e-129  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0430  hydrogenase, Fe-only  42.24 
 
 
566 aa  452  1.0000000000000001e-126  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.735126  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0087  hydrogenase, Fe-only  43.81 
 
 
567 aa  453  1.0000000000000001e-126  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1654  hydrogenases, Fe-only  45.6 
 
 
659 aa  449  1e-125  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.357121  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2341  iron hydrogenase  41.74 
 
 
572 aa  446  1.0000000000000001e-124  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2655  iron hydrogenase  41.91 
 
 
572 aa  444  1e-123  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1593  Fe-hydrogenase  42.05 
 
 
596 aa  431  1e-119  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16530  hydrogenase, Fe-only  44.62 
 
 
569 aa  431  1e-119  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.143158  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2056  hydrogenase, Fe-only  50 
 
 
644 aa  431  1e-119  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000410653  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0490  hydrogenase large subunit  41.34 
 
 
653 aa  427  1e-118  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1367  hydrogenase large subunit  42.47 
 
 
645 aa  427  1e-118  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1319  hydrogenase large subunit  42.12 
 
 
645 aa  428  1e-118  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0225  hydrogenase, Fe-only  39.38 
 
 
667 aa  418  9.999999999999999e-116  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0290  hydrogenase, Fe-only  47.64 
 
 
549 aa  414  1e-114  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.199872  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0168  hydrogenase, Fe-only  48.88 
 
 
513 aa  409  1e-113  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.191335  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4621  hydrogenase, Fe-only  47.06 
 
 
527 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0560  hydrogenase, Fe-only  39.72 
 
 
666 aa  400  9.999999999999999e-111  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00291892  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0463  hydrogenases, Fe-only  47.6 
 
 
520 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0157  hydrogenase, Fe-only  50.33 
 
 
523 aa  398  1e-109  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.434937  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1883  ferredoxin hydrogenase  44.7 
 
 
460 aa  378  1e-103  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3003  hydrogenase, Fe-only  41.49 
 
 
644 aa  366  1e-100  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1076  [Fe] hydrogenase  44.52 
 
 
696 aa  364  2e-99  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.723256  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0938  periplasmic [Fe] hydrogenase 1  43.2 
 
 
696 aa  353  5e-96  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0625857  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0475  ferredoxin hydrogenase  43.32 
 
 
458 aa  350  4e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2037  hydrogenase, Fe-only  41.03 
 
 
1150 aa  335  1e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.163812  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1925  ferredoxin hydrogenase  47.16 
 
 
387 aa  331  2e-89  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2281  ferredoxin hydrogenase  45.89 
 
 
439 aa  322  9.000000000000001e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0848  hydrogenases, Fe-only  45.45 
 
 
417 aa  306  5.0000000000000004e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0711  response regulator receiver protein  42.2 
 
 
410 aa  290  7e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.312278  hitchhiker  0.0000873565 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3250  hydrogenases, Fe-only  42.2 
 
 
410 aa  288  2e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.644479  hitchhiker  0.0000163586 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3920  periplasmic Fe hydrogenase, large subunit  42.68 
 
 
410 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0081  ferredoxin hydrogenase  41.56 
 
 
421 aa  282  2e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1503  hydrogenase, Fe-only  42.82 
 
 
418 aa  280  6e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.349556  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1386  hydrogenases, Fe-only  42.32 
 
 
421 aa  278  2e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.999103  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3520  formate dehydrogenase, alpha subunit  45.29 
 
 
904 aa  208  2e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3503  formate dehydrogenase, alpha subunit  47 
 
 
900 aa  207  3e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0156  formate dehydrogenase, alpha subunit  47.89 
 
 
898 aa  205  2e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3507  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.4 
 
 
893 aa  196  7e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3504  ferredoxin  44.81 
 
 
312 aa  194  3e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1856  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  45.29 
 
 
351 aa  194  5e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1888  ferredoxin  46.7 
 
 
307 aa  192  1e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1398  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.81 
 
 
893 aa  190  7e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0100  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.48 
 
 
893 aa  189  1e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000102152  hitchhiker  0.000000000000206048 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4645  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.6 
 
 
948 aa  188  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1831  NADH dehydrogenase I chain G  46.48 
 
 
363 aa  187  4e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0724  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.34 
 
 
948 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.696908  normal  0.792249 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0623  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.34 
 
 
948 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.816724  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0344  NADH dehydrogenase I, G subunit, putative  43.44 
 
 
826 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0310  ferredoxin hydrogenase  31.51 
 
 
462 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0805  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.34 
 
 
948 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.624345  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0704  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.47 
 
 
900 aa  184  3e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0839  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.34 
 
 
946 aa  183  6e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.331727  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0835  anaerobic dehydrogenase  43.72 
 
 
305 aa  182  1e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0785  NADH dehydrogenase I chain G  43.66 
 
 
353 aa  182  1e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0450  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.24 
 
 
984 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.858013  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3012  NAD-dependent formate dehydrogenase alpha subunit  39.24 
 
 
984 aa  182  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.467116  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>