97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_33268 on replicon NC_009047
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009047  PICST_33268  nuclear architecture related protein  100 
 
 
545 aa  1132    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03632  iron-sulfur cluster assembly associated protein Nar1, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G11960)  36.15 
 
 
590 aa  300  3e-80  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.436133 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33837  predicted protein  33.8 
 
 
473 aa  236  1.0000000000000001e-60  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.40604 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03410  iron hydrogenase, putative  32.06 
 
 
650 aa  201  3e-50  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.255006  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0430  hydrogenase, Fe-only  28.21 
 
 
566 aa  133  1.0000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.735126  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3003  hydrogenase, Fe-only  24.75 
 
 
644 aa  130  6e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0225  hydrogenase, Fe-only  25.71 
 
 
667 aa  124  6e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2303  hydrogenase, Fe-only  25.19 
 
 
562 aa  123  9e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0490  hydrogenase large subunit  25.6 
 
 
653 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2138  hydrogenase, Fe-only  26.09 
 
 
581 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000865974  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0475  ferredoxin hydrogenase  25.8 
 
 
458 aa  121  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1883  ferredoxin hydrogenase  26.67 
 
 
460 aa  115  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2037  hydrogenase, Fe-only  23.87 
 
 
1150 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.163812  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1490  hydrogenases, Fe-only  24.75 
 
 
601 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3920  periplasmic Fe hydrogenase, large subunit  30.94 
 
 
410 aa  114  5e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0711  response regulator receiver protein  30.94 
 
 
410 aa  114  6e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.312278  hitchhiker  0.0000873565 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3250  hydrogenases, Fe-only  30.94 
 
 
410 aa  113  7.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.644479  hitchhiker  0.0000163586 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0342  hydrogenase, Fe-only  24.14 
 
 
582 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1017  iron hydrogenase, small subunit  29.95 
 
 
574 aa  110  5e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1925  ferredoxin hydrogenase  23.74 
 
 
387 aa  110  5e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1654  hydrogenases, Fe-only  25.79 
 
 
659 aa  110  9.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.357121  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1781  hydrogenase, Fe-only  29.6 
 
 
578 aa  109  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0723  hydrogenase, Fe-only  30.49 
 
 
582 aa  109  1e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0087  hydrogenase, Fe-only  24.55 
 
 
567 aa  109  1e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0747  hydrogenase, Fe-only  30.49 
 
 
582 aa  109  1e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0463  hydrogenases, Fe-only  31.31 
 
 
520 aa  108  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1593  Fe-hydrogenase  29.8 
 
 
596 aa  108  3e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3829  hydrogenase, Fe-only  30.8 
 
 
625 aa  107  4e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0290  hydrogenase, Fe-only  29.31 
 
 
549 aa  107  4e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.199872  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2436  (Fe) hydrogenase, large subunit HymC, putative  31.25 
 
 
563 aa  107  6e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000128912  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0844  hydrogenases, Fe-only  34.23 
 
 
576 aa  107  7e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1503  hydrogenase, Fe-only  29.17 
 
 
418 aa  107  8e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.349556  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0172  hydrogenase, Fe-only  30.8 
 
 
573 aa  106  9e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1386  hydrogenases, Fe-only  27.52 
 
 
421 aa  105  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.999103  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0152  hydrogenase, Fe-only  29.34 
 
 
580 aa  105  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1319  hydrogenase large subunit  31.53 
 
 
645 aa  105  2e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1367  hydrogenase large subunit  31.53 
 
 
645 aa  105  2e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1548  hydrogenase, Fe-only  28.71 
 
 
615 aa  105  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0157  hydrogenase, Fe-only  30.22 
 
 
523 aa  104  5e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.434937  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1149  hydrogenase, Fe-only  27.8 
 
 
569 aa  103  7e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000253121  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4621  hydrogenase, Fe-only  28.89 
 
 
527 aa  103  8e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1717  Iron hydrogenase, small subunit  28.87 
 
 
573 aa  103  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.118526  normal  0.410336 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0168  hydrogenase, Fe-only  31.89 
 
 
513 aa  102  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.191335  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1337  hydrogenase, Fe-only  33.71 
 
 
590 aa  102  2e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0150  hydrogenase, Fe-only  30.94 
 
 
585 aa  102  2e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2341  iron hydrogenase  26.92 
 
 
572 aa  102  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1783  hydrogenase, Fe-only  31.19 
 
 
583 aa  101  3e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2281  ferredoxin hydrogenase  28.57 
 
 
439 aa  101  4e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0533  hydrogenase, Fe-only  27.02 
 
 
582 aa  101  4e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0310904  normal  0.240554 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0560  hydrogenase, Fe-only  32.53 
 
 
666 aa  101  4e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00291892  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3290  hydrogenases, Fe-only  22.34 
 
 
594 aa  100  5e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0848  hydrogenases, Fe-only  27.31 
 
 
417 aa  100  5e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1544  hydrogenase, Fe-only  30.38 
 
 
581 aa  100  5e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.557218 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2655  iron hydrogenase  25.75 
 
 
572 aa  100  5e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01810  NADH dehydrogenase I subunit G  28.44 
 
 
666 aa  100  7e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000616939  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1633  NAD-reducing iron-only hydrogenase large subunit  28.22 
 
 
585 aa  100  9e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000469619  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0137  hydrogenase, Fe-only  24.94 
 
 
619 aa  100  9e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1601  hydrogenase, Fe-only  28.65 
 
 
582 aa  99.8  1e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02980  NADH dehydrogenase I subunit G  29.33 
 
 
570 aa  99.4  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1384  hydrogenases, Fe-only  30.66 
 
 
606 aa  99.4  2e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0723  hydrogenase, Fe-only  29.86 
 
 
578 aa  99.4  2e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1605  NAD-reducing iron-only hydrogenase large subunit  27.66 
 
 
585 aa  98.6  3e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0147  [Fe] hydrogenase, large subunit HymC, putative  31.46 
 
 
573 aa  98.6  3e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06330  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 75 kDa subunit  28.23 
 
 
578 aa  98.2  4e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00021405  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3601  hydrogenase, Fe-only  29.13 
 
 
587 aa  97.4  6e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0224  hydrogenase, Fe-only  34.75 
 
 
573 aa  96.7  9e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0236  hydrogenase, Fe-only  27.6 
 
 
586 aa  95.9  1e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.660897  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_155  [Fe] hydrogenase, Hym C subunit  30.9 
 
 
573 aa  95.5  2e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0938  periplasmic [Fe] hydrogenase 1  28.37 
 
 
696 aa  95.5  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0625857  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1299  hydrogenase, Fe-only  27.65 
 
 
579 aa  95.1  3e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.130328  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2159  hydrogenase, Fe-only  24.65 
 
 
582 aa  94.7  3e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2502  iron-containing hydrogenase, Hyd gamma  29.63 
 
 
598 aa  95.1  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3805  hydrogenase, Fe-only  27.73 
 
 
582 aa  95.1  3e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0081  ferredoxin hydrogenase  23.85 
 
 
421 aa  94.4  5e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2232  hydrogenase, Fe-only  29.88 
 
 
582 aa  93.6  9e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1651  hydrogenases, Fe-only  29.89 
 
 
593 aa  93.6  9e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.556328  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1076  [Fe] hydrogenase  28.04 
 
 
696 aa  91.7  3e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.723256  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1085  hydrogenase, Fe-only  26.44 
 
 
577 aa  91.3  4e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16530  hydrogenase, Fe-only  27.01 
 
 
569 aa  90.9  5e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.143158  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2056  hydrogenase, Fe-only  27.52 
 
 
644 aa  89.4  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000410653  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0625  hydrogenase, Fe-only  31.37 
 
 
587 aa  89  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000144729  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48846  predicted protein  29.03 
 
 
627 aa  88.2  4e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.422234  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2467  hydrogenase, Fe-only  23.68 
 
 
574 aa  86.7  9e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0310  ferredoxin hydrogenase  29.35 
 
 
462 aa  85.9  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2900  [Fe] hydrogenase  26.48 
 
 
490 aa  63.2  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2579  [Fe] hydrogenase  26.48 
 
 
490 aa  63.5  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1708  hydrogenase large subunit domain protein  24.06 
 
 
435 aa  57.4  0.0000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0411  Ferredoxin hydrogenase  24.88 
 
 
531 aa  52  0.00003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0687694  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2300  putative PAS/PAC sensor protein  22.33 
 
 
574 aa  48.1  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.252887  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02060  putative PAS/PAC sensor protein  25.23 
 
 
571 aa  46.6  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0413  hydrogenase large subunit  27.06 
 
 
485 aa  46.6  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0146308  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0996  hydrogenase large subunit domain protein  28.05 
 
 
454 aa  46.2  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000195829  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02950  putative PAS/PAC sensor protein  25.97 
 
 
877 aa  45.1  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02870  Ferredoxin hydrogenase  27.82 
 
 
456 aa  45.4  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.417058  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2305  ferredoxin 2  31.43 
 
 
500 aa  45.1  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0655  putative PAS/PAC sensor protein  25.1 
 
 
580 aa  44.7  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1292  Fe-S cluster domain protein  21.3 
 
 
443 aa  43.9  0.007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>