More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1337 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2494  glutamate synthase (NADPH)  65.16 
 
 		 509 aa  679    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.12803  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0198  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  66.2 
 
 		 501 aa  677    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1128  glutamate synthase, alpha subunit, putative  63.77 
 
 		 500 aa  672    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.147695  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1239  glutamate synthase-related protein  65.16 
 
 		 509 aa  696    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0957  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  62.96 
 
 		 500 aa  668    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.653223  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1756  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  65.16 
 
 		 509 aa  680    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.314576  normal  0.0683666 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1814  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  84.81 
 
 		 507 aa  898    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1292  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  63.84 
 
 		 502 aa  654    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00363747 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0523  glutamate synthase (NADPH)  64.92 
 
 		 507 aa  648    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.55997  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0546  Glutamate synthase (NADPH)  86.36 
 
 		 507 aa  921    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0113147 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0537  glutamate synthase (NADPH)  64.92 
 
 		 507 aa  648    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2360  Glutamate synthase (NADPH)  67.66 
 
 		 502 aa  707    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.235602  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0212  glutamate synthase (NADPH)  63.31 
 
 		 497 aa  644    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_946  glutamate synthase-like protein, gltB-like fragment  63.36 
 
 		 500 aa  669    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1337  glutamate synthase (NADPH)  100 
 
 		 507 aa  1046    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.958593 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16300  Glutamate synthase (NADPH)  67.53 
 
 		 500 aa  715    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0221938  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0559  glutamate synthase (NADPH)  64.85 
 
 		 501 aa  639    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1301  glutamate synthase (NADPH)  60.2 
 
 		 510 aa  619  1e-176  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2025  glutamate synthase (NADPH)  58.81 
 
 		 530 aa  615  1e-175  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1079  glutamate synthase (NADPH)  60.12 
 
 		 510 aa  617  1e-175  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.592845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0664  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  59.56 
 
 		 503 aa  613  9.999999999999999e-175  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.633094 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1597  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  59.51 
 
 		 510 aa  604  1.0000000000000001e-171  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.322339  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0868  glutamate synthase (NADPH)  59.72 
 
 		 510 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00172644  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0781  glutamate synthase (NADPH)  58.59 
 
 		 503 aa  598  1e-169  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0188816  normal  0.24566 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1691  glutamate synthase (NADPH)  57.37 
 
 		 503 aa  588  1e-167  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.528981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2709  Glutamate synthase (NADPH)  58.1 
 
 		 502 aa  587  1e-166  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0333  glutamate synthase (NADPH)  55.76 
 
 		 505 aa  578  1.0000000000000001e-163  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.495212  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1093  glutamate synthase (NADPH)  58.7 
 
 		 510 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2137  glutamate synthase (NADPH)  58.73 
 
 		 502 aa  567  1e-160  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1884  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  49.85 
 
 		 712 aa  307  3e-82  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.95621  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1741  Glutamate synthase (NADPH)  50.29 
 
 		 747 aa  305  1.0000000000000001e-81  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.831135  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0029  glutamate synthase (NADPH)  49.22 
 
 		 741 aa  288  2e-76  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1608  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  42.16 
 
 		 693 aa  279  9e-74  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1811  glutamate synthase (NADPH)  40.82 
 
 		 685 aa  273  6e-72  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.172314  hitchhiker  0.0000101045 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0829  glutamate synthase (NADPH)  43.24 
 
 		 681 aa  269  8e-71  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.37412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1101  glutamate synthase (NADPH)  40.21 
 
 		 684 aa  256  8e-67  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.338613 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0145  Glutamate synthase (ferredoxin)  41.34 
 
 		 1533 aa  241  2e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.705237  normal  0.20582 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1903  glutamate synthase (ferredoxin)  40.32 
 
 		 1546 aa  238  1e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00598503 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1640  Glutamate synthase (ferredoxin)  43.08 
 
 		 1519 aa  237  4e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0608399  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0232  Glutamate synthase (ferredoxin)  42.15 
 
 		 1510 aa  237  4e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.261044 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2985  glutamate synthase (ferredoxin)  40.53 
 
 		 1554 aa  236  8e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1952  glutamate synthase, large subunit  39.54 
 
 		 1530 aa  228  1e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3462  Glutamate synthase (ferredoxin)  41.59 
 
 		 1577 aa  228  2e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0064  glutamate synthase subunit alpha  40.41 
 
 		 1484 aa  228  2e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1146  glutamate synthase (NADPH) large subunit  37.11 
 
 		 1512 aa  227  3e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2807  glutamate synthase (ferredoxin)  37.11 
 
 		 1512 aa  227  3e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0019  glutamate synthase (NADPH) large subunit  39.27 
 
 		 1524 aa  227  5.0000000000000005e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0488  glutamate synthase (ferredoxin)  40.5 
 
 		 1516 aa  227  5.0000000000000005e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0002  glutamate synthase  40.31 
 
 		 1512 aa  226  6e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4476  glutamate synthase (ferredoxin)  39.64 
 
 		 1485 aa  226  7e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.4617  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2562  glutamate synthase, large subunit  38.44 
 
 		 1515 aa  226  8e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0446  glutamate synthase (ferredoxin)  40.3 
 
 		 1478 aa  226  8e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004466  glutamate synthase [NADPH] large chain  38.73 
 
 		 1516 aa  225  1e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1703  Glutamate synthase (ferredoxin)  40.92 
 
 		 1518 aa  225  1e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.625118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0535  putative glutamate synthase, large subunit  40.3 
 
 		 1478 aa  226  1e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.684549  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0452  glutamate synthase (ferredoxin)  39.64 
 
 		 1477 aa  225  1e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0484  Glutamate synthase (ferredoxin)  39.38 
 
 		 1505 aa  225  2e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2781  glutamate synthase (ferredoxin)  36.84 
 
 		 1512 aa  224  2e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.975525  normal  0.828421 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0403  glutamate synthase subunit alpha  41.67 
 
 		 1507 aa  224  2e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0405842 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004468  glutamate synthase [NADPH] large chain  36.83 
 
 		 1487 aa  224  2e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3266  glutamate synthase (ferredoxin)  41.27 
 
 		 1572 aa  224  2e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.819491  normal  0.0774951 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3590  Glutamate synthase (ferredoxin)  41.27 
 
 		 1572 aa  224  2e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.610776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4791  putative glutamate synthase, large subunit  39.42 
 
 		 1478 aa  224  2e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.621621  normal  0.701675 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0585  glutamate synthase, large subunit, putative  39.16 
 
 		 1478 aa  224  3e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0251  glutamate synthase (NADPH) large subunit  39.39 
 
 		 1511 aa  224  3e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00928  glutamate synthase, large subunit  38.44 
 
 		 1516 aa  224  3e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2823  glutamate synthase (NADPH) large subunit  40.31 
 
 		 1510 aa  224  4e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0586  putative glutamate synthase, large subunit  39.16 
 
 		 1478 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1207  Glutamate synthase (ferredoxin)  40.84 
 
 		 1469 aa  223  6e-57  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3633  glutamate synthase subunit alpha  38.62 
 
 		 1486 aa  223  6e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0912  ferredoxin-dependent glutamate synthase  40.91 
 
 		 1567 aa  223  6e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00362249 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0437  glutamate synthase, NADPH, large subunit  39.46 
 
 		 1478 aa  223  7e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0530  glutamate synthase, large subunit  39.46 
 
 		 1478 aa  223  8e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0498  glutamate synthase, large subunit  39.46 
 
 		 1478 aa  223  9e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0299  glutamate synthase subunit alpha  38.99 
 
 		 1486 aa  223  9e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0513  putative glutamate synthase, large subunit  39.46 
 
 		 1478 aa  223  9e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0441  glutamate synthase, NADPH, large subunit  39.46 
 
 		 1478 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2165  glutamate synthase subunit alpha  42.44 
 
 		 1487 aa  222  9.999999999999999e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.409887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00926  glutamate synthase subunit alpha  38.57 
 
 		 1487 aa  222  1.9999999999999999e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0049  glutamate synthase, large subunit  38.78 
 
 		 1583 aa  221  1.9999999999999999e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1874  glutamate synthase subunit alpha  42.12 
 
 		 1487 aa  222  1.9999999999999999e-56  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2166  glutamate synthase subunit alpha  40.31 
 
 		 1489 aa  221  1.9999999999999999e-56  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2258  glutamate synthase subunit alpha  40.31 
 
 		 1477 aa  221  1.9999999999999999e-56  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0454247  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0054  glutamate synthase, large subunit  38.78 
 
 		 1583 aa  221  3e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.673781  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01631  glutamate synthase subunit alpha  38.6 
 
 		 1460 aa  221  3e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4277  glutamate synthase (ferredoxin)  38.19 
 
 		 1583 aa  221  3e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2944  glutamate synthase, large subunit  40.43 
 
 		 1513 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3791  glutamate synthase subunit alpha  38.04 
 
 		 1486 aa  219  6e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0305  glutamate synthase subunit alpha  38.69 
 
 		 1486 aa  220  6e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.910499  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3135  Glutamate synthase (ferredoxin)  39.42 
 
 		 1527 aa  220  6e-56  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.815016  normal  0.26832 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1617  glutamate synthase (ferredoxin)  37.79 
 
 		 1553 aa  219  6e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0657  glutamate synthase (NADPH) large subunit  36.54 
 
 		 1509 aa  219  7.999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0412975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03319  glutamate synthase subunit alpha  41.14 
 
 		 1462 aa  219  8.999999999999998e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.645921  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2140  glutamate synthase (ferredoxin)  37.02 
 
 		 1510 aa  219  1e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.697929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1117  Glutamate synthase (ferredoxin)  37.64 
 
 		 1468 aa  219  1e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0477  glutamate synthase (ferredoxin)  38.12 
 
 		 1567 aa  218  2e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0794035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2744  glutamate synthase (NADH) large subunit  39.16 
 
 		 1574 aa  218  2e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0730  Glutamate synthase (ferredoxin)  38.61 
 
 		 1509 aa  218  2e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000317884 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1007  glutamate synthase (ferredoxin)  39.87 
 
 		 1533 aa  218  2e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.465703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1013  glutamate synthase subunit alpha  40.76 
 
 		 1482 aa  218  2e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.471869  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>