More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0232 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3450  glutamate synthase-related protein  48.09 
 
 		 1510 aa  1308    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0585  glutamate synthase, large subunit, putative  42.47 
 
 		 1478 aa  1117    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0498  glutamate synthase, large subunit  42.34 
 
 		 1478 aa  1110    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0441  glutamate synthase, NADPH, large subunit  42.15 
 
 		 1478 aa  1115    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0437  glutamate synthase, NADPH, large subunit  42.27 
 
 		 1478 aa  1117    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0535  putative glutamate synthase, large subunit  43.09 
 
 		 1478 aa  1125    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.684549  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0513  putative glutamate synthase, large subunit  42.27 
 
 		 1478 aa  1113    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1226  Glutamate synthase (ferredoxin)  43.95 
 
 		 1499 aa  1123    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.27984  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0586  putative glutamate synthase, large subunit  42.76 
 
 		 1478 aa  1120    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2944  glutamate synthase, large subunit  47.14 
 
 		 1513 aa  1276    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0147  glutamate synthase (ferredoxin)  48.32 
 
 		 1510 aa  1313    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4791  putative glutamate synthase, large subunit  42.76 
 
 		 1478 aa  1120    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.621621  normal  0.701675 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0530  glutamate synthase, large subunit  42.34 
 
 		 1478 aa  1111    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0446  glutamate synthase (ferredoxin)  42.73 
 
 		 1478 aa  1123    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0484  Glutamate synthase (ferredoxin)  43.53 
 
 		 1505 aa  1113    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1703  Glutamate synthase (ferredoxin)  48.12 
 
 		 1518 aa  1240    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.625118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1640  Glutamate synthase (ferredoxin)  59.84 
 
 		 1519 aa  1784    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0608399  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0393  glutamate synthase (ferredoxin)  48.63 
 
 		 1507 aa  1322    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0232  Glutamate synthase (ferredoxin)  100 
 
 		 1510 aa  3071    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.261044 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0729  glutamate synthase (ferredoxin)  48.42 
 
 		 1507 aa  1279    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0452  glutamate synthase (ferredoxin)  42.56 
 
 		 1477 aa  1099    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1802  glutamate synthase (ferredoxin)  48.08 
 
 		 1498 aa  1248    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0512049  normal  0.419037 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1117  Glutamate synthase (ferredoxin)  30.22 
 
 		 1468 aa  541  9.999999999999999e-153  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2224  Glutamate synthase (ferredoxin)  31.4 
 
 		 1519 aa  530  1e-148  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2954  glutamate synthase subunit alpha  29.8 
 
 		 1482 aa  527  1e-148  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.791133  normal  0.168031 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1178  glutamate synthase subunit alpha  29.68 
 
 		 1482 aa  524  1e-147  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1032  glutamate synthase subunit alpha  30.47 
 
 		 1482 aa  523  1e-147  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.843249 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1325  glutamate synthase subunit alpha  29.61 
 
 		 1482 aa  525  1e-147  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0305  glutamate synthase subunit alpha  30.07 
 
 		 1486 aa  525  1e-147  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.910499  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0299  glutamate synthase subunit alpha  29.99 
 
 		 1486 aa  523  1e-147  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1136  glutamate synthase subunit alpha  29.55 
 
 		 1482 aa  525  1e-147  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2872  glutamate synthase subunit alpha  29.74 
 
 		 1482 aa  524  1e-147  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0333567 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2951  glutamate synthase subunit alpha  30.25 
 
 		 1482 aa  523  1e-147  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3050  glutamate synthase subunit alpha  29.74 
 
 		 1482 aa  525  1e-147  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.156524 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0145  Glutamate synthase (ferredoxin)  31.89 
 
 		 1533 aa  525  1e-147  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.705237  normal  0.20582 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1954  glutamate synthase subunit alpha  29.89 
 
 		 1487 aa  520  1e-146  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00926  glutamate synthase subunit alpha  29.95 
 
 		 1487 aa  520  1e-146  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3135  glutamate synthase subunit alpha  29.76 
 
 		 1482 aa  521  1e-146  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.429634  normal  0.864328 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0857  glutamate synthase subunit alpha  30.03 
 
 		 1483 aa  523  1e-146  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.245541 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004468  glutamate synthase [NADPH] large chain  29.96 
 
 		 1487 aa  518  1.0000000000000001e-145  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4476  glutamate synthase (ferredoxin)  32.06 
 
 		 1485 aa  519  1.0000000000000001e-145  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.4617  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1346  Glutamate synthase (ferredoxin)  30.08 
 
 		 1520 aa  518  1.0000000000000001e-145  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2961  Glutamate synthase (ferredoxin)  31.53 
 
 		 1536 aa  520  1.0000000000000001e-145  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.495295  normal  0.583434 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2166  glutamate synthase subunit alpha  32.15 
 
 		 1489 aa  518  1.0000000000000001e-145  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1794  glutamate synthase (ferredoxin)  29.65 
 
 		 1526 aa  519  1.0000000000000001e-145  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.856198  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3791  glutamate synthase subunit alpha  30.12 
 
 		 1486 aa  514  1e-144  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1260  Glutamate synthase (ferredoxin)  33.27 
 
 		 1511 aa  514  1e-144  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.179185  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2949  Glutamate synthase (ferredoxin)  30.73 
 
 		 1501 aa  514  1e-144  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.341665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1222  glutamate synthase subunit alpha  29.77 
 
 		 1462 aa  515  1e-144  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1255  glutamate synthase subunit alpha  29.7 
 
 		 1462 aa  516  1e-144  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.600674 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1903  glutamate synthase (ferredoxin)  31.33 
 
 		 1546 aa  513  1e-144  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00598503 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0064  glutamate synthase subunit alpha  32.95 
 
 		 1484 aa  515  1e-144  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0615  glutamate synthase subunit alpha  32.09 
 
 		 1483 aa  516  1e-144  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1221  glutamate synthase subunit alpha  30.22 
 
 		 1482 aa  515  1e-144  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.120556 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3633  glutamate synthase subunit alpha  29.96 
 
 		 1486 aa  515  1e-144  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03319  glutamate synthase subunit alpha  33.08 
 
 		 1462 aa  513  1e-143  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.645921  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1170  glutamine amidotransferase class-II  31.1 
 
 		 1563 aa  511  1e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2258  glutamate synthase subunit alpha  32.11 
 
 		 1477 aa  511  1e-143  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0454247  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2340  Glutamate synthase (ferredoxin)  28.72 
 
 		 1483 aa  512  1e-143  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2985  glutamate synthase (ferredoxin)  31.32 
 
 		 1554 aa  512  1e-143  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2790  glutamate synthase subunit alpha  29.71 
 
 		 1482 aa  509  9.999999999999999e-143  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1013  glutamate synthase subunit alpha  29.84 
 
 		 1482 aa  507  9.999999999999999e-143  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.471869  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2284  Glutamate synthase (ferredoxin)  30.53 
 
 		 1486 aa  508  9.999999999999999e-143  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0094  glutamate synthase (ferredoxin)  30.08 
 
 		 1581 aa  508  9.999999999999999e-143  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000146352  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2039  glutamate synthase, large subunit  30.93 
 
 		 1542 aa  504  1e-141  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.545584  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3590  Glutamate synthase (ferredoxin)  31.12 
 
 		 1572 aa  503  1e-141  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.610776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28040  glutamate synthase (NADH) large subunit  30.86 
 
 		 1527 aa  504  1e-141  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.723113  normal  0.697076 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0529  Glutamate synthase (ferredoxin)  29.22 
 
 		 1474 aa  504  1e-141  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.41827  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1126  glutamate synthase subunit alpha  30.01 
 
 		 1482 aa  502  1e-140  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.052618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1294  glutamate synthase (ferredoxin)  30.3 
 
 		 1562 aa  500  1e-140  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.163498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0019  glutamate synthase (NADPH) large subunit  31.38 
 
 		 1524 aa  502  1e-140  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4344  glutamate synthase subunit alpha  29.44 
 
 		 1486 aa  500  1e-140  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0225673 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0466  glutamate synthase (ferredoxin)  29.54 
 
 		 1546 aa  501  1e-140  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.549913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3266  glutamate synthase (ferredoxin)  31.12 
 
 		 1572 aa  503  1e-140  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.819491  normal  0.0774951 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0007  glutamate synthase, large subunit  29.97 
 
 		 1496 aa  499  1e-139  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0530  glutamate synthase subunit alpha  29.59 
 
 		 1485 aa  498  1e-139  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0265  Glutamate synthase (ferredoxin)  30.85 
 
 		 1487 aa  498  1e-139  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.316824 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1812  glutamate synthase (ferredoxin)  30.82 
 
 		 1564 aa  498  1e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0773594 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0033  glutamate synthase, large subunit  30.07 
 
 		 1495 aa  499  1e-139  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.281504  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3748  glutamate synthase subunit alpha  28.94 
 
 		 1488 aa  497  1e-139  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.956068  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1407  glutamate synthase (NADH) large subunit  29.36 
 
 		 1489 aa  498  1e-139  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1128  glutamate synthase subunit alpha  29.59 
 
 		 1535 aa  497  1e-139  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0466  glutamate synthase subunit alpha  29.59 
 
 		 1485 aa  499  1e-139  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.820942  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1253  Glutamate synthase (ferredoxin)  31.33 
 
 		 1479 aa  499  1e-139  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0495  Glutamate synthase (ferredoxin)  30.51 
 
 		 1517 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2805  glutamate synthase (ferredoxin)  29.37 
 
 		 1525 aa  496  9.999999999999999e-139  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2694  Glutamate synthase (NADH)  30.67 
 
 		 1569 aa  494  9.999999999999999e-139  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3103  glutamate synthase (NADH) large subunit  29.69 
 
 		 1579 aa  496  9.999999999999999e-139  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.456903 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4535  glutamate synthase subunit alpha  30.62 
 
 		 1517 aa  495  9.999999999999999e-139  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2788  glutamate synthase (ferredoxin)  30.14 
 
 		 1567 aa  496  9.999999999999999e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.395907  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2217  Glutamate synthase (ferredoxin)  32.39 
 
 		 1516 aa  496  9.999999999999999e-139  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3700  glutamate synthase subunit alpha  30.62 
 
 		 1486 aa  494  9.999999999999999e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1458  glutamate synthase  29.9 
 
 		 1508 aa  496  9.999999999999999e-139  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0475565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3656  glutamate synthase subunit alpha  30.48 
 
 		 1516 aa  495  9.999999999999999e-139  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.166032 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3558  glutamate synthase subunit alpha  30.51 
 
 		 1486 aa  495  9.999999999999999e-139  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1207  Glutamate synthase (ferredoxin)  29.58 
 
 		 1469 aa  496  9.999999999999999e-139  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3730  Glutamate synthase (ferredoxin)  30.11 
 
 		 1554 aa  494  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3405  glutamate synthase subunit alpha  30.62 
 
 		 1486 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0653  glutamate synthase  30.38 
 
 		 1571 aa  493  9.999999999999999e-139  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.58912  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3508  glutamate synthase subunit alpha  30.44 
 
 		 1517 aa  494  9.999999999999999e-139  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>