More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2137 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0664  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  76.65 
 
 		 503 aa  823    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.633094 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2709  Glutamate synthase (NADPH)  78.53 
 
 		 502 aa  825    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1301  glutamate synthase (NADPH)  67.92 
 
 		 510 aa  716    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0781  glutamate synthase (NADPH)  76.29 
 
 		 503 aa  817    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0188816  normal  0.24566 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2137  glutamate synthase (NADPH)  100 
 
 		 502 aa  1018    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1691  glutamate synthase (NADPH)  78.24 
 
 		 503 aa  827    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.528981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1079  glutamate synthase (NADPH)  65.74 
 
 		 510 aa  692    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.592845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1093  glutamate synthase (NADPH)  63.76 
 
 		 510 aa  648    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1597  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  64.75 
 
 		 510 aa  679    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.322339  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0868  glutamate synthase (NADPH)  64.95 
 
 		 510 aa  680    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00172644  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0333  glutamate synthase (NADPH)  77.64 
 
 		 505 aa  828    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.495212  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2025  glutamate synthase (NADPH)  57.17 
 
 		 530 aa  593  1e-168  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16300  Glutamate synthase (NADPH)  57.75 
 
 		 500 aa  589  1e-167  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0221938  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1337  glutamate synthase (NADPH)  58.73 
 
 		 507 aa  585  1e-166  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.958593 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2360  Glutamate synthase (NADPH)  57.46 
 
 		 502 aa  582  1.0000000000000001e-165  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.235602  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0523  glutamate synthase (NADPH)  56.6 
 
 		 507 aa  571  1e-161  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.55997  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0546  Glutamate synthase (NADPH)  56.97 
 
 		 507 aa  569  1e-161  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0113147 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1814  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  56.97 
 
 		 507 aa  568  1e-161  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1292  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  57.11 
 
 		 502 aa  571  1e-161  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00363747 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0537  glutamate synthase (NADPH)  56.6 
 
 		 507 aa  571  1e-161  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1128  glutamate synthase, alpha subunit, putative  55.51 
 
 		 500 aa  566  1e-160  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.147695  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_946  glutamate synthase-like protein, gltB-like fragment  55.31 
 
 		 500 aa  566  1e-160  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0198  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  56.18 
 
 		 501 aa  566  1e-160  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0957  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  55.11 
 
 		 500 aa  566  1e-160  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.653223  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0559  glutamate synthase (NADPH)  55.78 
 
 		 501 aa  546  1e-154  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0212  glutamate synthase (NADPH)  55.2 
 
 		 497 aa  540  9.999999999999999e-153  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1239  glutamate synthase-related protein  55.33 
 
 		 509 aa  526  1e-148  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2494  glutamate synthase (NADPH)  54.73 
 
 		 509 aa  522  1e-147  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.12803  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1756  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  55.03 
 
 		 509 aa  514  1e-144  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.314576  normal  0.0683666 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1884  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  50.15 
 
 		 712 aa  322  9.999999999999999e-87  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.95621  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1741  Glutamate synthase (NADPH)  50.72 
 
 		 747 aa  318  1e-85  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.831135  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0029  glutamate synthase (NADPH)  50.29 
 
 		 741 aa  314  1.9999999999999998e-84  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1811  glutamate synthase (NADPH)  40.73 
 
 		 685 aa  290  3e-77  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.172314  hitchhiker  0.0000101045 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0829  glutamate synthase (NADPH)  48.2 
 
 		 681 aa  288  1e-76  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.37412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1608  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  46.55 
 
 		 693 aa  287  2e-76  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1101  glutamate synthase (NADPH)  42.03 
 
 		 684 aa  286  8e-76  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.338613 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2822  glutamate synthase (ferredoxin)  40.97 
 
 		 1518 aa  222  9.999999999999999e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.857674 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0493  glutamate synthase (ferredoxin)  40.69 
 
 		 1499 aa  221  3e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0506  glutamate synthase (ferredoxin)  40.69 
 
 		 1499 aa  221  3e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3060  glutamate synthase (NADH) large subunit  42.31 
 
 		 1518 aa  219  1e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3593  glutamate synthase (ferredoxin)  42.31 
 
 		 1514 aa  219  1e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.544233  normal  0.0352812 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3044  glutamate synthase (NADH) large subunit  42.31 
 
 		 1518 aa  219  1e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.417373  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3103  glutamate synthase (NADH) large subunit  42.31 
 
 		 1518 aa  219  1e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.238876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0232  Glutamate synthase (ferredoxin)  40.12 
 
 		 1510 aa  218  2e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.261044 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1640  Glutamate synthase (ferredoxin)  38.29 
 
 		 1519 aa  217  2.9999999999999998e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0608399  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0265  glutamate synthase (NADH) large subunit  42.72 
 
 		 1584 aa  217  4e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.568336  normal  0.146722 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3462  Glutamate synthase (ferredoxin)  41.34 
 
 		 1577 aa  216  5e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0145  Glutamate synthase (ferredoxin)  40.98 
 
 		 1533 aa  216  9e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.705237  normal  0.20582 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5693  Glutamate synthase (ferredoxin)  43.13 
 
 		 1512 aa  215  9.999999999999999e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.232512  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3590  Glutamate synthase (ferredoxin)  42.72 
 
 		 1572 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.610776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3266  glutamate synthase (ferredoxin)  42.72 
 
 		 1572 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.819491  normal  0.0774951 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3176  glutamate synthase (NADH) large subunit  43.04 
 
 		 1546 aa  215  9.999999999999999e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0446  glutamate synthase (ferredoxin)  41.16 
 
 		 1478 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2161  glutamate synthase (ferredoxin)  40.19 
 
 		 1519 aa  216  9.999999999999999e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.706434  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1458  glutamate synthase  36.26 
 
 		 1508 aa  215  1.9999999999999998e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0475565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1260  Glutamate synthase (ferredoxin)  40.66 
 
 		 1511 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.179185  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0036  glutamate synthase (ferredoxin)  39.66 
 
 		 1571 aa  213  5.999999999999999e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.790561 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0535  putative glutamate synthase, large subunit  41.41 
 
 		 1478 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.684549  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1350  Glutamate synthase (ferredoxin)  34.3 
 
 		 1527 aa  213  5.999999999999999e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000183365 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28040  glutamate synthase (NADH) large subunit  41.99 
 
 		 1527 aa  213  7.999999999999999e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.723113  normal  0.697076 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0002  glutamate synthase  40.95 
 
 		 1512 aa  212  1e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3807  Glutamate synthase (ferredoxin)  41.85 
 
 		 1502 aa  212  1e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.344591  hitchhiker  0.00201054 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0484  Glutamate synthase (ferredoxin)  41.09 
 
 		 1505 aa  212  1e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1570  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  36.46 
 
 		 529 aa  212  1e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3654  Glutamate synthase (ferredoxin)  40.25 
 
 		 1558 aa  212  1e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4277  glutamate synthase (ferredoxin)  39.48 
 
 		 1583 aa  211  2e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4791  putative glutamate synthase, large subunit  41.1 
 
 		 1478 aa  211  2e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.621621  normal  0.701675 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2985  glutamate synthase (ferredoxin)  40.37 
 
 		 1554 aa  211  3e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0054  glutamate synthase, large subunit  40.42 
 
 		 1583 aa  211  3e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.673781  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0049  glutamate synthase, large subunit  40.42 
 
 		 1583 aa  211  3e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0585  glutamate synthase, large subunit, putative  40.55 
 
 		 1478 aa  210  4e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0441  glutamate synthase, NADPH, large subunit  40.24 
 
 		 1478 aa  210  4e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1812  glutamate synthase (ferredoxin)  39.39 
 
 		 1564 aa  210  4e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0773594 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5479  Glutamate synthase (ferredoxin)  39.36 
 
 		 1526 aa  210  4e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0092  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  37.86 
 
 		 496 aa  210  4e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.554506  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16921  ferredoxin-dependent glutamate synthase  37.5 
 
 		 1524 aa  210  4e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0610  Glutamate synthase (ferredoxin)  35.14 
 
 		 1510 aa  210  4e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1703  Glutamate synthase (ferredoxin)  39.88 
 
 		 1518 aa  210  5e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.625118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2961  Glutamate synthase (ferredoxin)  39.63 
 
 		 1536 aa  210  5e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.495295  normal  0.583434 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2562  glutamate synthase, large subunit  40.69 
 
 		 1515 aa  210  5e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0954  Glutamate synthase (NADPH)  40.51 
 
 		 529 aa  210  5e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0513  putative glutamate synthase, large subunit  39.94 
 
 		 1478 aa  209  6e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0498  glutamate synthase, large subunit  39.94 
 
 		 1478 aa  210  6e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1794  glutamate synthase (ferredoxin)  39.12 
 
 		 1526 aa  209  6e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.856198  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1219  Glutamate synthase (ferredoxin)  39.81 
 
 		 1525 aa  209  7e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.589961  normal  0.962678 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0437  glutamate synthase, NADPH, large subunit  39.94 
 
 		 1478 aa  209  7e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0530  glutamate synthase, large subunit  39.94 
 
 		 1478 aa  209  7e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0730  Glutamate synthase (ferredoxin)  39.43 
 
 		 1509 aa  209  8e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000317884 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1964  glutamate synthase (ferredoxin)  40.63 
 
 		 1580 aa  209  8e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.321687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0586  putative glutamate synthase, large subunit  40.55 
 
 		 1478 aa  209  8e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00928  glutamate synthase, large subunit  40.06 
 
 		 1516 aa  209  9e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0488  glutamate synthase (ferredoxin)  40.45 
 
 		 1516 aa  209  9e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5702  Glutamate synthase (ferredoxin)  41.99 
 
 		 1550 aa  209  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0474  Glutamate synthase (ferredoxin)  36.17 
 
 		 1525 aa  208  1e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0672  Glutamate synthase (ferredoxin)  41.14 
 
 		 1534 aa  209  1e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0019  glutamate synthase (NADPH) large subunit  38.89 
 
 		 1524 aa  209  1e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2866  ferredoxin-dependent glutamate synthase  34.06 
 
 		 1527 aa  209  1e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2131  Glutamate synthase (ferredoxin)  40.51 
 
 		 1502 aa  209  1e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.150906 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0912  ferredoxin-dependent glutamate synthase  40.73 
 
 		 1567 aa  208  2e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00362249 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0452  glutamate synthase (ferredoxin)  40.18 
 
 		 1477 aa  208  2e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>