More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0029 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1741  Glutamate synthase (NADPH)  49.47 
 
 		 747 aa  682    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.831135  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1884  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  47.4 
 
 		 712 aa  653    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.95621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0029  glutamate synthase (NADPH)  100 
 
 		 741 aa  1488    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1811  glutamate synthase (NADPH)  40.11 
 
 		 685 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.172314  hitchhiker  0.0000101045 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1101  glutamate synthase (NADPH)  40.24 
 
 		 684 aa  451  1e-125  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.338613 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1608  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  39.32 
 
 		 693 aa  443  1e-123  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0829  glutamate synthase (NADPH)  46.03 
 
 		 681 aa  420  1e-116  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.37412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0664  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  49.73 
 
 		 503 aa  322  1.9999999999999998e-86  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.633094 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1691  glutamate synthase (NADPH)  44.29 
 
 		 503 aa  318  3e-85  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.528981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2709  Glutamate synthase (NADPH)  43.22 
 
 		 502 aa  313  9e-84  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0781  glutamate synthase (NADPH)  47.88 
 
 		 503 aa  313  1e-83  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0188816  normal  0.24566 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0333  glutamate synthase (NADPH)  47.29 
 
 		 505 aa  311  2.9999999999999997e-83  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.495212  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2137  glutamate synthase (NADPH)  50.29 
 
 		 502 aa  307  4.0000000000000004e-82  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0198  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  41.11 
 
 		 501 aa  301  2e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2360  Glutamate synthase (NADPH)  44.05 
 
 		 502 aa  298  3e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.235602  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1079  glutamate synthase (NADPH)  47.71 
 
 		 510 aa  297  6e-79  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.592845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1814  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  49.53 
 
 		 507 aa  292  2e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0546  Glutamate synthase (NADPH)  48.91 
 
 		 507 aa  291  4e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0113147 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1301  glutamate synthase (NADPH)  48.6 
 
 		 510 aa  290  7e-77  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2025  glutamate synthase (NADPH)  47.51 
 
 		 530 aa  288  2.9999999999999996e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1337  glutamate synthase (NADPH)  49.22 
 
 		 507 aa  288  2.9999999999999996e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.958593 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16300  Glutamate synthase (NADPH)  46.11 
 
 		 500 aa  287  5e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0221938  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1239  glutamate synthase-related protein  48.67 
 
 		 509 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0868  glutamate synthase (NADPH)  49.22 
 
 		 510 aa  286  1.0000000000000001e-75  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00172644  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1597  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  48.91 
 
 		 510 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.322339  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2494  glutamate synthase (NADPH)  47.79 
 
 		 509 aa  282  2e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.12803  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1756  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  47.03 
 
 		 509 aa  280  7e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.314576  normal  0.0683666 
 
 
-
 
NC_002936  DET1128  glutamate synthase, alpha subunit, putative  45.21 
 
 		 500 aa  276  1.0000000000000001e-72  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.147695  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_946  glutamate synthase-like protein, gltB-like fragment  45.21 
 
 		 500 aa  276  1.0000000000000001e-72  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1292  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  47.04 
 
 		 502 aa  276  1.0000000000000001e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00363747 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0957  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  44.91 
 
 		 500 aa  274  4.0000000000000004e-72  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.653223  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0523  glutamate synthase (NADPH)  46.42 
 
 		 507 aa  273  1e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.55997  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0537  glutamate synthase (NADPH)  46.42 
 
 		 507 aa  273  1e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0212  glutamate synthase (NADPH)  40.3 
 
 		 497 aa  271  4e-71  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0559  glutamate synthase (NADPH)  47.92 
 
 		 501 aa  268  2e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1093  glutamate synthase (NADPH)  46.42 
 
 		 510 aa  255  2.0000000000000002e-66  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0446  glutamate synthase (ferredoxin)  40.92 
 
 		 1478 aa  213  1e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0232  Glutamate synthase (ferredoxin)  39.22 
 
 		 1510 aa  212  2e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.261044 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0585  glutamate synthase, large subunit, putative  40.8 
 
 		 1478 aa  210  6e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0437  glutamate synthase, NADPH, large subunit  40.49 
 
 		 1478 aa  209  2e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0484  Glutamate synthase (ferredoxin)  40.24 
 
 		 1505 aa  209  2e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0535  putative glutamate synthase, large subunit  40.49 
 
 		 1478 aa  209  2e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.684549  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0586  putative glutamate synthase, large subunit  40.49 
 
 		 1478 aa  209  2e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0498  glutamate synthase, large subunit  40.49 
 
 		 1478 aa  208  3e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0530  glutamate synthase, large subunit  40.49 
 
 		 1478 aa  208  3e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0513  putative glutamate synthase, large subunit  40.49 
 
 		 1478 aa  208  3e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0441  glutamate synthase, NADPH, large subunit  40.18 
 
 		 1478 aa  207  4e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4791  putative glutamate synthase, large subunit  40.49 
 
 		 1478 aa  207  4e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.621621  normal  0.701675 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0912  ferredoxin-dependent glutamate synthase  40.12 
 
 		 1567 aa  206  1e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00362249 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1640  Glutamate synthase (ferredoxin)  40.85 
 
 		 1519 aa  206  2e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0608399  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0145  Glutamate synthase (ferredoxin)  38.6 
 
 		 1533 aa  206  2e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.705237  normal  0.20582 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0452  glutamate synthase (ferredoxin)  40.18 
 
 		 1477 aa  203  9.999999999999999e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2944  glutamate synthase, large subunit  38.78 
 
 		 1513 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0493  glutamate synthase (ferredoxin)  37.97 
 
 		 1499 aa  201  3.9999999999999996e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0506  glutamate synthase (ferredoxin)  37.97 
 
 		 1499 aa  201  3.9999999999999996e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0393  glutamate synthase (ferredoxin)  38.28 
 
 		 1507 aa  201  3.9999999999999996e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0147  glutamate synthase (ferredoxin)  36.78 
 
 		 1510 aa  199  2.0000000000000003e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1260  Glutamate synthase (ferredoxin)  40.58 
 
 		 1511 aa  199  2.0000000000000003e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.179185  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3450  glutamate synthase-related protein  38.27 
 
 		 1510 aa  198  3e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3227  ferredoxin-dependent glutamate synthase  36.92 
 
 		 514 aa  198  3e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3135  Glutamate synthase (ferredoxin)  40 
 
 		 1527 aa  198  3e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.815016  normal  0.26832 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1903  glutamate synthase (ferredoxin)  39.48 
 
 		 1546 aa  196  9e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00598503 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000267  glutamate synthase [NADPH] large chain  37.74 
 
 		 466 aa  196  1e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1207  Glutamate synthase (ferredoxin)  38.26 
 
 		 1469 aa  196  1e-48  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0610  Glutamate synthase (ferredoxin)  37.65 
 
 		 1510 aa  196  1e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4476  glutamate synthase (ferredoxin)  38.83 
 
 		 1485 aa  196  1e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.4617  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2529  Glutamate synthase (ferredoxin)  39.81 
 
 		 1536 aa  196  2e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.455706  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2984  ferredoxin-dependent glutamate synthase  39.51 
 
 		 516 aa  196  2e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05134  Glutamate synthase Fragment [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9Y8F4]  38.27 
 
 		 2126 aa  195  3e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0818  glutamate synthase (NADH) large subunit  37.31 
 
 		 1506 aa  195  3e-48  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1294  glutamate synthase (ferredoxin)  33.18 
 
 		 1562 aa  194  4e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.163498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1802  glutamate synthase (ferredoxin)  38.99 
 
 		 1498 aa  194  4e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0512049  normal  0.419037 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2985  glutamate synthase (ferredoxin)  38.83 
 
 		 1554 aa  194  4e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3198  Glutamate synthase (ferredoxin)  39.49 
 
 		 1518 aa  194  5e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0341  glutamate synthase (NADH) large subunit  36.99 
 
 		 1489 aa  194  7e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1407  glutamate synthase (NADH) large subunit  36.45 
 
 		 1489 aa  193  9e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0946  Glutamate synthase (ferredoxin)  37.66 
 
 		 1539 aa  192  2e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.195752  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0526  Glutamate synthase (ferredoxin)  33.18 
 
 		 1548 aa  192  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.801021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3782  Glutamate synthase (ferredoxin)  35.53 
 
 		 1554 aa  192  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.376942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3758  Glutamate synthase (ferredoxin)  37.66 
 
 		 1521 aa  191  4e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00101986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0019  glutamate synthase (NADPH) large subunit  38.22 
 
 		 1524 aa  191  4e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2805  glutamate synthase (ferredoxin)  37.03 
 
 		 1525 aa  191  4e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0729  glutamate synthase (ferredoxin)  38.53 
 
 		 1507 aa  191  5e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0330  Glutamate synthase (ferredoxin)  37.58 
 
 		 1513 aa  191  5.999999999999999e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.954616 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2822  glutamate synthase (ferredoxin)  38.98 
 
 		 1518 aa  191  5.999999999999999e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.857674 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0653  glutamate synthase  35.81 
 
 		 1571 aa  190  7e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.58912  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1458  glutamate synthase  37.85 
 
 		 1508 aa  190  7e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0475565  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1703  Glutamate synthase (ferredoxin)  37.92 
 
 		 1518 aa  190  8e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.625118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1817  Glutamate synthase (ferredoxin)  37.2 
 
 		 1509 aa  190  9e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.568612 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0730  Glutamate synthase (ferredoxin)  38.82 
 
 		 1509 aa  190  9e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000317884 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3730  Glutamate synthase (ferredoxin)  35.26 
 
 		 1554 aa  190  1e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2694  Glutamate synthase (NADH)  38.3 
 
 		 1569 aa  189  1e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3044  glutamate synthase (NADH) large subunit  37.27 
 
 		 1518 aa  190  1e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.417373  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3060  glutamate synthase (NADH) large subunit  37.27 
 
 		 1518 aa  190  1e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3103  glutamate synthase (NADH) large subunit  37.27 
 
 		 1518 aa  190  1e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.238876  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1794  glutamate synthase (ferredoxin)  37.74 
 
 		 1526 aa  188  2e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.856198  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0567  glutamate synthase  36.88 
 
 		 1523 aa  188  3e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3022  glutamate synthase (NADH) large subunit  38.31 
 
 		 1519 aa  188  3e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1468  Glutamate synthase (ferredoxin)  33.03 
 
 		 1551 aa  188  4e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.163376 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1226  Glutamate synthase (ferredoxin)  38.84 
 
 		 1499 aa  187  5e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.27984  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>