More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0198 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0537  glutamate synthase (NADPH)  62.65 
 
 
507 aa  634    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1128  glutamate synthase, alpha subunit, putative  61.65 
 
 
500 aa  652    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.147695  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1239  glutamate synthase-related protein  63.6 
 
 
509 aa  651    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16300  Glutamate synthase (NADPH)  72.47 
 
 
500 aa  750    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0221938  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0198  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  100 
 
 
501 aa  1031    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1756  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  64 
 
 
509 aa  644    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.314576  normal  0.0683666 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1814  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  64.99 
 
 
507 aa  676    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0523  glutamate synthase (NADPH)  62.65 
 
 
507 aa  634    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.55997  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1292  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  65.93 
 
 
502 aa  693    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00363747 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0559  glutamate synthase (NADPH)  72.26 
 
 
501 aa  728    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0546  Glutamate synthase (NADPH)  65.79 
 
 
507 aa  688    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0113147 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_946  glutamate synthase-like protein, gltB-like fragment  61.65 
 
 
500 aa  652    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0212  glutamate synthase (NADPH)  60.72 
 
 
497 aa  635    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2360  Glutamate synthase (NADPH)  72.34 
 
 
502 aa  759    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.235602  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1337  glutamate synthase (NADPH)  66.2 
 
 
507 aa  677    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.958593 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2494  glutamate synthase (NADPH)  63.29 
 
 
509 aa  640    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.12803  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0957  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  62.05 
 
 
500 aa  654    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.653223  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1301  glutamate synthase (NADPH)  57.74 
 
 
510 aa  600  1e-170  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1597  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  56.94 
 
 
510 aa  592  1e-168  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.322339  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1079  glutamate synthase (NADPH)  56.94 
 
 
510 aa  593  1e-168  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.592845  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0868  glutamate synthase (NADPH)  56.94 
 
 
510 aa  590  1e-167  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00172644  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2025  glutamate synthase (NADPH)  55.03 
 
 
530 aa  578  1e-164  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0781  glutamate synthase (NADPH)  56.65 
 
 
503 aa  578  1.0000000000000001e-163  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0188816  normal  0.24566 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1691  glutamate synthase (NADPH)  55.36 
 
 
503 aa  570  1e-161  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.528981  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0664  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  55.56 
 
 
503 aa  571  1e-161  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.633094 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2709  Glutamate synthase (NADPH)  54.89 
 
 
502 aa  561  1.0000000000000001e-159  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1093  glutamate synthase (NADPH)  55.36 
 
 
510 aa  551  1e-155  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2137  glutamate synthase (NADPH)  56.18 
 
 
502 aa  545  1e-154  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0333  glutamate synthase (NADPH)  54.14 
 
 
505 aa  545  1e-153  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.495212  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1884  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  48.37 
 
 
712 aa  312  6.999999999999999e-84  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.95621  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1741  Glutamate synthase (NADPH)  49.7 
 
 
747 aa  312  7.999999999999999e-84  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.831135  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0029  glutamate synthase (NADPH)  41.11 
 
 
741 aa  301  1e-80  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1608  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  41.19 
 
 
693 aa  281  2e-74  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1811  glutamate synthase (NADPH)  44.48 
 
 
685 aa  277  3e-73  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.172314  hitchhiker  0.0000101045 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0829  glutamate synthase (NADPH)  45.27 
 
 
681 aa  277  4e-73  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.37412  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1101  glutamate synthase (NADPH)  47.32 
 
 
684 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.338613 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2985  glutamate synthase (ferredoxin)  45.57 
 
 
1554 aa  244  3e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4476  glutamate synthase (ferredoxin)  38.82 
 
 
1485 aa  242  1e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.4617  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1903  glutamate synthase (ferredoxin)  44.83 
 
 
1546 aa  242  1e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00598503 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5693  Glutamate synthase (ferredoxin)  43.17 
 
 
1512 aa  239  1e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.232512  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0145  Glutamate synthase (ferredoxin)  43.95 
 
 
1533 aa  238  2e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.705237  normal  0.20582 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2961  Glutamate synthase (ferredoxin)  43.97 
 
 
1536 aa  236  7e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.495295  normal  0.583434 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3213  Glutamate synthase (ferredoxin)  42.9 
 
 
1542 aa  236  8e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1260  Glutamate synthase (ferredoxin)  44.44 
 
 
1511 aa  236  9e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.179185  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0869  Glutamate synthase (ferredoxin)  43.71 
 
 
1536 aa  235  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.600507  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3462  Glutamate synthase (ferredoxin)  41.46 
 
 
1577 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11000  glutamate synthase (NADH) large subunit  42.77 
 
 
1550 aa  234  2.0000000000000002e-60  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.542266  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0506  glutamate synthase (ferredoxin)  43.67 
 
 
1499 aa  235  2.0000000000000002e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1794  glutamate synthase (ferredoxin)  43.53 
 
 
1526 aa  234  2.0000000000000002e-60  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.856198  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0493  glutamate synthase (ferredoxin)  43.67 
 
 
1499 aa  235  2.0000000000000002e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3016  Glutamate synthase (ferredoxin)  41.8 
 
 
1524 aa  234  3e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0817  glutamate synthase (NADH) large subunit  43.71 
 
 
1535 aa  233  4.0000000000000004e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1964  glutamate synthase (ferredoxin)  41.62 
 
 
1580 aa  234  4.0000000000000004e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.321687  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1173  glutamate synthase (NADH) large subunit  43.87 
 
 
1520 aa  233  5e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0912  ferredoxin-dependent glutamate synthase  41.27 
 
 
1567 aa  233  5e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00362249 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0865  Glutamate synthase (ferredoxin)  43.4 
 
 
1536 aa  233  6e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1346  Glutamate synthase (ferredoxin)  42.59 
 
 
1520 aa  233  6e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3590  Glutamate synthase (ferredoxin)  41.46 
 
 
1572 aa  233  6e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.610776  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3266  glutamate synthase (ferredoxin)  41.46 
 
 
1572 aa  233  6e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.819491  normal  0.0774951 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0854  glutamate synthase (ferredoxin)  42.77 
 
 
1540 aa  233  8.000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.265918  normal  0.188488 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2161  glutamate synthase (ferredoxin)  44.13 
 
 
1519 aa  233  9e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.706434  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3633  glutamate synthase subunit alpha  40.4 
 
 
1486 aa  232  9e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3317  Glutamate synthase (ferredoxin)  40.51 
 
 
1574 aa  232  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2224  Glutamate synthase (ferredoxin)  42.41 
 
 
1519 aa  232  1e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2340  Glutamate synthase (ferredoxin)  42.44 
 
 
1483 aa  232  1e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2866  Glutamate synthase (ferredoxin)  43.17 
 
 
1519 aa  231  2e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.166773  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0875  glutamate synthase ferredoxin subunit  43.49 
 
 
1582 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0619471  normal  0.609882 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0232  Glutamate synthase (ferredoxin)  40.83 
 
 
1510 aa  231  2e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.261044 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0959  Glutamate synthase (ferredoxin)  43.17 
 
 
1575 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.434425  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0761  glutamate synthase ferredoxin subunit  43.49 
 
 
1573 aa  231  3e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.220538  normal  0.186889 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3654  Glutamate synthase (ferredoxin)  42.72 
 
 
1558 aa  230  4e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1458  glutamate synthase  43.73 
 
 
1508 aa  230  4e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0475565  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0054  glutamate synthase, large subunit  41.48 
 
 
1583 aa  230  5e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.673781  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004468  glutamate synthase [NADPH] large chain  36.18 
 
 
1487 aa  230  5e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0730  Glutamate synthase (ferredoxin)  41.51 
 
 
1509 aa  230  5e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000317884 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0049  glutamate synthase, large subunit  41.48 
 
 
1583 aa  230  5e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3060  glutamate synthase (NADH) large subunit  43.27 
 
 
1518 aa  230  6e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3044  glutamate synthase (NADH) large subunit  43.27 
 
 
1518 aa  230  6e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.417373  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3022  glutamate synthase (NADH) large subunit  44.3 
 
 
1519 aa  229  6e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3103  glutamate synthase (NADH) large subunit  43.27 
 
 
1518 aa  230  6e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.238876  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4531  glutamate synthase ferredoxin subunit  40.8 
 
 
1579 aa  229  7e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.688027  normal  0.696569 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3593  glutamate synthase (ferredoxin)  43.27 
 
 
1514 aa  229  7e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.544233  normal  0.0352812 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3031  glutamate synthase (ferredoxin)  42.9 
 
 
1553 aa  229  8e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4277  glutamate synthase (ferredoxin)  40.62 
 
 
1583 aa  229  8e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2284  Glutamate synthase (ferredoxin)  43.65 
 
 
1486 aa  229  8e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1170  glutamine amidotransferase class-II  43.87 
 
 
1563 aa  229  9e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2949  Glutamate synthase (ferredoxin)  43.73 
 
 
1501 aa  229  9e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.341665  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1219  Glutamate synthase (ferredoxin)  41.99 
 
 
1525 aa  228  1e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.589961  normal  0.962678 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0474  Glutamate synthase (ferredoxin)  43.55 
 
 
1525 aa  229  1e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0894  glutamate synthase (ferredoxin)  41.16 
 
 
1528 aa  228  1e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.08401  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3616  Glutamate synthase (ferredoxin)  40.06 
 
 
1574 aa  229  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.103413  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3791  glutamate synthase subunit alpha  41.44 
 
 
1486 aa  229  1e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00928  glutamate synthase, large subunit  41.82 
 
 
1516 aa  229  1e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0946  Glutamate synthase (ferredoxin)  43.94 
 
 
1539 aa  228  1e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.195752  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2953  glutamine amidotransferase, class-II  42.81 
 
 
1596 aa  228  2e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.401719  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0672  Glutamate synthase (ferredoxin)  42.45 
 
 
1534 aa  228  2e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00926  glutamate synthase subunit alpha  35.93 
 
 
1487 aa  228  2e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6714  Glutamate synthase (ferredoxin)  43.4 
 
 
1526 aa  228  2e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0299  glutamate synthase subunit alpha  40.77 
 
 
1486 aa  228  2e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2822  glutamate synthase (ferredoxin)  43.27 
 
 
1518 aa  228  2e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.857674 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>